大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因. 2023年03月07日,南华大学衡阳医学院李二毛团队在<Molecular Cancer>杂志发表了题为"The epigenetic regulatory mechanism of PIWI/piRNAs in human cancers"的综述文章,讨论了piRNA(PIWI-interacting RNA)的生物发生及其在人癌症中的表观遗传调控机制的研究进展,如N6-甲基腺苷(m6A)甲基化.组蛋白修饰.…

何川,RNA表观遗传学开创者.早年毕业于中国科技大学,2000年获麻省理工学院博士学位,2000到2002年在哈佛大学做博士后研究,2002年至今执教芝加哥大学化学系, 是芝加哥大学生物物理动态研究所主任, 北京大学合成与功能生物分子中心主任. 目前主要从事化学生物学.核酸化学和生物学.表观遗传学.分子生物学.生物无机化学.以及基因组学等方面研究. [他的观点] 1.科学研究中最难的,是找一个真正有意义的问题. 2.RNA表观遗传学“淘金热”的说法有些急功近利.这个领域要真正做深.搞清楚机理,还…

易基因(羟)甲基化DNA免疫共沉淀测序(h)MeDIP-seq研究成果见刊<Journal of Clinical Investigation> 2022年5月2日,中南大学湘雅二医院赵明教授团队.中国医学科学院皮肤病医院陆前进教授团队合作在Journal of Clinical Investigation上发表了题为"Iron-dependent epigenetic modulation promotes pathogenic T cell differentiation in…

RNA-seq这个工具该什么时候用?ATAC-seq该什么时候用?有相当一部分项目设计不行,导致花大钱测了一些没有意义的数据. 还是在中心法则这个框架下来解释,这是生物信息的核心.打开华大科技服务官网梳理一下现在到底都有些什么测序技术: 全基因组测序和重测序 - 组装以及寻找变异 (外显子和目标区域测序) RNA-seq测序 - 基因表达 (smRNA,lncRNA,circRNA,PB全长,可变剪切) 甲基化测序 ChIP-seq和ATAC-seq 蛋白组 - 所有蛋白的变化 代谢组 - 植物…

需要长期更新! 参考:生信修炼手册 enhancer的基本概念: 长度几十到几千bp,作用是提高靶基因活性,属于顺式作用原件,DNA作用到DNA,转录因子就是反式,是结合到DNA的蛋白. 1981年,Benerji发现SV40中某个140bp的序列可以显著提高血红蛋白融合基因的表达水平. 特性:远距离效应,无方向性. 如何鉴定enhancer区域: 对多个转录因子的peak区域进行聚类,识别增强子区域 将H3K4me1和K3K27ac这两种组蛋白修饰作为增强子区的mark 使用II型RNA聚合酶…

paper:cepip: context-dependent epigenomic weighting for prioritization of regulatory variants and disease-associated genes Genotype-Tissue Expression Project (GTEx) - genome上的eQTL位点及其对特定组织的特定基因表达的影响,同时包含了不同eQTL之间的LD关系.这个整合多个疾病的数据.正如其名,该数据包含了genotype.…

基因调控网络的概念在之前已经简要介绍过:https://www.cnblogs.com/pear-linzhu/p/12313951.html 沃丁顿表观遗传景观(The Waddington's epigenetic landscape) 是描述基因调控下细胞分化的动态性的一个经典的隐喻,是由沃丁顿在1957年提出的.他将细胞分化比喻作从高处沿山坡滚落下的小球,直到一个稳定的盆地 (basin),该盆地也就代表一定的分化状态.小球最开始能量较高,处于不稳定状态,对应干细胞等未分化的细胞状态,小…

生物医疗大数据-DNA element functions and identification Genetic vs epigenetic GENETICS  遗传学 DNA Code: 64 triplets of nucleotides encode for 20 amino acids and 3 stop codons. EPIGENETICS  表观遗传学 RNA Code: Non-coding RNA, miRNA, Alternative Splicing CpG Code:…

JavaScript表单验证年龄,判断一个输入量是否符合年龄,通过正则表达式实现. //检查年龄 function isAge(str){ var mydate=new Date; var now=mydate.getFullYear(); if (str < now-60 || str > now-18){ return false; } return true; } 去看看你都知道那些?>>颜色代码表大全…

日地距离计算参见<中华人民共和国气象行业标准太阳能资源评估方法>  …