前言   处理vcf文件的时候,需要多种切割,正则匹配,如果要自己写其实会比较麻烦,并且每次还得根据vcf文件格式或者需要读取的值不同要修改相应的代码.因此很多人会选择一些python的vcf的库,但是首先你得安装这个库, 并且有一些库它固定了能够读的内容,如果你的vcf的信息不在它固定的里面,就读不出来.比如最近我想读一个样本的AF,但是它放在最后样本的GT那列,不在INFO那一列,有一些库竟然无能为力.   因此我写了这个通用的读vcf的类,直接复制粘贴这部分代码就可以方便的用这个类进行vc…

参考:XML DOM 参考手册(w3school) 参考:python专题-读取xml文件 参考:请问用python怎么修改xml的节点值? 1. 读取标签内的文本(Python) 如下的 xml 文件一部分,读取里面的经纬度 <?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?> <ProductMetaData> <SatelliteID>GF1</SatelliteID> <Sens…

package com.util; import java.io.BufferedInputStream; import java.io.FileInputStream; import java.io.InputStream; import java.util.Properties; /** * 读取Config文件工具类 * @version 1.0 * @since JDK 1.6 */ public class PropertiesConfig { /** * 获取整个配置文件中的属性 *…

项目中要用到这个,所以记录一下. python下读取excel文件方法多种,用的是普通的xlrd插件,因为它各种版本的excel文件都可读. 首先在https://pypi.python.org/pypi/xlrd下载插件安装,命令是“python setup.py install”,然后直接import xlrd就可以了. 下面是找到的现成函数,一个是按表的索引读,一个是按表名读,其实都一样啦. import xlrd def open_excel(filename= 'file.xls'):…

Python逐块读取大文件行数的代码 - 为程序员服务 python数文件行数最简单的方法是使用enumerate方法,但是如果文件很大的话,这个方法就有点慢了,我们可以逐块的读取文件的内容,然后按块来数块内的\n数,从而确定行数. 如下实现代码: def blocks(file, size=65536): while True: b = files.read(size) if not b: break yield b with open("file", "r")…

关于python读取xml文章很多,但大多文章都是贴一个xml文件,然后再贴个处理文件的代码.这样并不利于初学者的学习,希望这篇文章可以更通俗易懂的教如何使用python 来读取xml 文件. 什么是xml? xml即可扩展标记语言,它可以用来标记数据.定义数据类型,是一种允许用户对自己的标记语言进行定义的源语言. abc.xml <?xml version="1.0" encoding="utf-8"?> <catalog> <max…

Python json 读取 json 文件并转为 dict 在 D 盘 新建 test.json: { "test": "测试\n换行", "dict": { "list": [0, "str\""], "num": 0 } } json 格式编写: json 格式大致以 python 的 dict {} 格式来编写即可,只是要注意字符串不能用单引号'  ',一定要用双引号&…

一.提前知识点 在python中是同样和其他语言一样可以进行文件的读取写入操作,值得注意的是,Python中打开文件读取的方式有几种,分别是以下几种: f = open('username.txt') first_line = f.readline() print('first line:',first_line ) f.close() try: f = open('username.txt') print(f.read() ) finally: if f: f.close() 上面两种各有区别…

1.建立properts文件(error.message.properties) HTTP201= 请求成功并且服务器创建了新的资源 2.在spring-mvc.xml文件(applicationContext-mvc.xml)中配置properties工具类路径及读取properties文件的路径 <bean id="propertyConfigurer" class="com.yjlc.platform.utils.PropertyConfigurer"…

利用python中的json读取json文件时,因为错误使用了相应的方法导致报错:TypeError:the Json object must be str, bytes or bytearray,not‘TextIOWrapper’. 解决方法: 首先要弄明白json有四个方法:dumps和loads.dump和load.其中,dumps和loads是在内存中转换(python对象和json字符串之间的转换),而dump和load则是对应于文件的处理. 出现这个错误的原因是自己用了loads方…