文章目录 wgcna入门-雌性小鼠肝脏表达数据的网络分析:寻找与体重有关的模块 1 数据输入和清洗 1.1 加载基因表达数据 1.2 数据清洗 1.3 加载临床特征数据 2 建设表达网络与模块检测 2.1 自动一步构建网络与模块检测 2.1.1 软阈值的选择:网络拓扑分析 2.1.2 一步构建网络与模块检测 2.2 其他检测算法 3 筛选与表型相关的模块 3.1 量化模块-特质关联 3.2 基因与性状和重要模块的关系:基因重要性和模块成员 3.3 模内分析:鉴定具有高GS和MM的基因 3.4 网…

本文主要是为了从零开始学习和理解R语言,简要介绍了该语言的最重要部分,以快速入门.主要参考文章: R-Tutorial R语言程序的编写需要安装R或RStudio,通常是在RStudio中键入代码.但是RStudio个人感觉并不好用,因此本人编写的R语言程序都是在Jupyter Notebook平台使用.具体可以见在 Jupyter Notebook 中使用R语言.R语言和Python,matlab一样都是解释型语言,语法差别不大,容易入门.其他进阶内容见R语言个人笔记 文章目录 1 入门基础…

R语言PCA分析教程 Principal Component Methods in R(代码下载) 主成分分析Principal Component Methods(PCA)允许我们总结和可视化包含由多个相互关联的定量变量描述的个体/观察的数据集中的信息.每个变量都可以视为不同的维度.如果数据集中包含3个以上的变量,那么可视化多维超空间可能非常困难. 主成分分析用于从多变量数据表中提取重要信息,并将此信息表示为一组称为主成分的新变量.这些新变量对应于原件的线性组合.主成分的数量小于或等于原始变量…

文章目录 1 ggplot2入门笔记1-ggplot2简要教程 1. 设置 The Setup 2. 图层 The Layers 3. 标签 The Labels 4. 主题 The Theme 5. 分面 The Facets 6. 常用函数 Commonly Used Features 6.1 绘制时间序列图(使用ggfortify) 6.2 在同一ggplot上绘制多个时间序列 6.3 条形图 6.4 自定义布局 6.5 翻转坐标轴 6.6 调整X和Y轴范围 6.7 等坐标轴 6.8 变更…

导言:     较早之前就听说R是一门便捷的数据分析工具,但由于课程设计的原因,一直没有空出足够时间来进行学习.最近自从决定本科毕业出来找工作之后,渐渐开始接触大数据行业的技术,现在觉得是时候把R拿下了:用了3天时间,除了对R先有一个大概认识之外,也着手敲指令.由于计算机专业的底子还不错,而且先后接触过不下10种编程语言,感觉R语言入门上手还是挺简单的.下面是自己汇总的一些简单入门代码供大家参考,感兴趣的朋友也可逐行敲打测试. 1. 介绍变量.顺序结构.分支结构.循环结构.函数使用.获取帮助等知…

<R语言基础语法入门>: http://www.xueqing.tv/upload/april-training/day1/index.html#1…

问题: 一组学生参加了数学.科学和英语考试.为了给所有的学生确定一个单一的成绩衡量指标,需要将这些科目的成绩组合起来.另外,还想将前20%的学生评定为A,接下来20%的学生评定为B,以此类推.最后,希望按字母顺序对学生排序. Excel中的数据表(自己一个个敲的,最讨厌做的事情TT) StuId StuName Math Science English 1 John Davis 502 95 25 2 Angela Williams 465 67 12 3 Bull Jones 621 78 2…

by 写长城的诗 • October 30, 2011 • Comments Off This post was kindly contributed by 数据科学与R语言 - go there to comment and to read  the full post. 一.数据导入 对初学者来讲,面对一片空白的命令行窗口,第一道真正的难关也许就是数据的导入.数据导入有很多途径,例如从网页抓取.公共数据源获得.文本文件导入.为了快速入门,建议初学者采取R语言协同Excel电子表格的方法.也就…

go快速入门指南 by 小强,2019-06-13 go语言是目前非常火热的语言,广泛应用于服务器端,云计算,kubernetes容器编排等领域.它是一种开源的编译型程序设计语言,支持并发.垃圾回收机制以提升应用程序性能.它既具有像c这种静态编译型语言的高性能,又具备像python这种动态语言的高效性.很多go程序员都是从C++,Java等面向对象语言因为工作的需要转过来的,因此没有必要从0开始学习go,当初自己的想法是找一篇半小时入门go的博客,貌似没有类似的好文章=_=.搜到的都是一些从小白…

原创博客,未经允许,不得转载. 生存分析,survival analysis,顾名思义是用来研究个体的存活概率与时间的关系.例如研究病人感染了病毒后,多长时间会死亡:工作的机器多长时间会发生崩溃等.  这里“个体的存活”可以推广抽象成某些关注的事件. 所以SA就成了研究某一事件与它的发生时间的联系的方法.这个方法广泛的用在医学.生物学等学科上,近年来也越来越多人用在互联网数据挖掘中,例如用survival analysis去预测信息在社交网络的传播程度,或者去预测用户流失的概率. R里面有很成熟…