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业界良心啊,开源的单细胞课程. 随便看了几章,课程写得非常用心,非常适合新手. 课程地址:Analysis of single cell RNA-seq data 源码地址:hemberg-lab/scRNA.seq.course…

[转记]MAFFT多重序列比对图解教程 [絮语] 一提到多重序列比对,很多人禁不住就想到ClustalW(Clustalx为ClustalW的GUI版),其实有一款多重序列比对软件-MAFFT,不论从比对速度(Muscle>MAFFT>ClustalW>T-Coffee),还是比对准确性(MAFFT>Muscle>T-Coffee>ClustalW)来说,其相比于ClustalW(或ClustalX)有过之而无不及,所以这里强烈推荐使用MAFFT这款多重比对软件. PS…

http://www.gene-quantification.de/liquid-biopsy.html Liquid Biopsy -- Definitions Liquid Biopsy -- reliable biomarkers Liquid Biopsy -- the role in cancer diagnostics Liquid Biopsy -- the role of Exosomes Biofluids Guidelines Liquid Biopsy Research P…

https://community.emc.com/message/821593#821593 介绍 TCP通过滑动窗口机制检测丢包,并在丢包发生时调整数据传输速率.滑动窗口机制利用数据接收端的接收窗口来控制数据流. 接收窗口值由数据接收端指定,以字节数形式存储于TCP报文头,并告知传输设备有多少数据将会存储在TCP缓冲区.缓冲区就是数据暂时放置的地方,直至传递至应用层协议等待处理.因此,发送端每次只能发送Window Size字段指定的数据量.为了使发送端继续传送数据,接收端必须发送确认信息:…

Andrew 机器学习课程笔记 完成 Andrew 的课程结束至今已有一段时间,课程介绍深入浅出,很好的解释了模型的基本原理以及应用.在我看来这是个很好的入门视频,他老人家现在又出了一门 deep learning 的教程,虽然介绍的内容很浅,毕竟针对大部分初学者.不管学习到什么程度,能将课程跟一遍,或多或少会对知识体系的全貌有一个大致的理解.如果有时间的话,强烈建议跟完课程的同时完成各项作业.但值得注意的是,机器学习除了需要适当的数理基础之外,还是一门实践科学,只有通过不断的深入积累才能有更好…

关于数据挖掘发表文章,我们知道很多人是看不上.瞧不起.嗤之以鼻的.大抵是因为这些人平时只发 CNS 主刊,所以才认为通过数据挖掘这种用「别人的数据」或者叫「干实验」来发文章是“「垃圾」,没有什么价值. 真的是这样吗?今天我们要介绍的就是一篇做数据挖掘的 Cancer Cell 杂志的文章(IF: 27.4),大家来看看文章怎么样. A Comprehensive Pan-Cancer Molecular Study of Gynecologic and Breast Cancers. Cance…

TCGA的关键数字:图片来源<细胞> 由美国政府发起的癌症和肿瘤基因图谱(Cancer Genome Atlas,TCGA)计划于2006年联合启动,目前已经收录了来自1万多例病人的33种癌症的数据,2.5PB的数据量.全世界无数顶尖肿瘤学家经过10多年的辛苦工作,于近期公布了TCGA研究的收官之作:“Pan-Cancer Atlas”泛癌症图谱.这些研究精华共发表了27篇相关论文,涉及基因组测序,转录组测序,甲基化等表观组学测序以及最终的整合分析,同时研究者也将它们与临床和影像数据相关联,展…

Molecular Diversity of Midbrain Development in Mouse, Human, and Stem Cells 本文作者的官网:Ventral midbrain 顺便找到了:Download all the data and Python Notebooks from GitHub to reproduce the main figures. GitHub:linnarsson-lab/ipynb-lamanno2016 教程:scRNA-Seq Data…

作为网络管理员,很多时间必然会耗费在修复慢速服务器和其他终端.但用户感到网络运行缓慢并不意味着就是网络问题. 解决网络性能问题,首先从TCP错误恢复功能(TCP重传与重复ACK)和流控功能说起.之后阐述如何发现网络慢速之源.最后,对网络各组成部分上的数据流进行概况分析.这几张内容将会帮助读者识别,诊断,以及排查慢速网络. 更多信息接下来的内容,较多是黑白图片了.虽然看起来有点不爽,但还是很值得一看. TCP错误恢复功能: TCP的错误恢复功能是定位,诊断及修复网络延时的最佳工具.延时可以在单程也…