在生成序列时,“:”的优先级最高 (1)从1到20的整数序列: > 1:20 [1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 (2)用函数seq生成实数等差序列:(两种表示方法) seq(start,end,d)     start表示起点,end表示终点,d表示步长. > seq(1,20,2) [1] 1 3 5 7 9 11 13 15 17 19> seq(1,20,3)[1] 1 4 7 10 13 16 19 &g…

目的:读入序列文件(fasta格式),返回一个数据框,内容包括--存储ID.注释行(anno).长度(len).序列内容(content) 一.问题思考: 1. 如何识别注释行和序列内容行 2. 如何快速定位序列内容所在位置 二.你可能需要的知识--基本的R语言基础 1. R语言基本数据类型 2. 会使用帮助(help,?)及网络资源 3. 其他的部分可能需要你针对自己看到的问题自己想办法解决或者留言 ##--构建函数--## seq_import <- function( file ){ se…

先言:R语言常用界面操作 帮助:help(nnet) = ?nnet =??nnet 清除命令框中所有显示内容:Ctrl+L 清除R空间中内存变量:rm(list=ls()).gc() 获取或者设置当前工作目录:getwd.setwd 保存指定文件或者从磁盘中读取出来:save.load 读入.读出文件:read.table.wirte.table.read.csv.write.csv 1.一些简单的基本统计量 #基本统计量 sum/mean/sd/min #一些基本统计量 which.min(…

环境设置函数为options(),用options()命令可以设置一些环境变量,使用help(options)可以查看详细的参数信息. 1. 数字位数的设置,options(digits=n),n一般默认情况下是7位,但实际上的范围是1~22,可以随意设置位数. #这个命令,可以把R的整数表示能力设为10位. options(digits=10) 2. 扩展包的安装,使用下面的命令,可以联网安装扩展包. options(CRAN="http://cran.r-project.org")…

(1)生成正态分布随机数: rnorm(n,mean,sd)     其中,n表示生成的随机数个数,mean表示正态分布均值,sd表示正态分布标准差 > rnorm(5,0,2)[1] -5.31147765 0.09634197 0.35276104 -1.94548466 0.54533883 (2)生成均匀分布随机数: runif(n,min,max)     其中,n表示生成的随机数个数,min表示均匀分布最小值,max表示均匀分布最大值 > runif(5,0,10)[1] 9.74…

我们经常会需要生成这样一类的变量,比如a1,a2,a3...... 这时候我们需要用到这两个函数:get()和assign() get()用法 get()函数只是在环境中搜索该变量名的变量,如果该变量不存在则返回异常 a2 = 1 get(paste0("a","2")) ls()[grep("a2", ls())] assign()用法 assign()功能就是对变量进行赋值:assign(x, value, ...)  # x为变量名,val…

set.seed()函数 set.seed()设定生成随机数的种子,让样本可重复. > x<-rnorm() # 生成4个随机数 > x [] 0.6599492 0.5881863 -1.9215553 -0.9161720 > y<-rnorm() > y [] -0.8496265 -2.5471568 0.5650117 0.9226440 > )# 设定种子,让样本可重复 > x<-rnorm() > x [] 0.2167549 -0…

length(object) # 显示对象中元素/成分的数量 dim(boject) # 显示某个对象的维度 str(object) # 显示某个对象的结构 class(object) # 显示某个对象的类或类型 mode(object) # 显示某个对象的模式 names(object) # 显示某个对象中各成分的名称 c(object,object,...) # 将对象合并入一个向量 cbind(object,object,...) # 按列合并对象 rbind(object,object,…

函数计算字符数量,包括在一个字符串的空格的个数. 语法 nchar()函数的基本语法是: nchar(x) 以下是所使用的参数的说明: x - 向量输入. 示例 result <- nchar("Count the number of characters") print(result) 当我们上面的代码执行时,它产生以下结果: [1] 30…

R语言笔记 学习R语言对我来说有好几个地方需要注意的,我觉得这样的经验也适用于学习其他的新的语言. 语言的目标 我理解语言的目标就是这个语言是用来做什么的,为什么样的任务服务的,也就是设计这个语言的动机.比如C++是为系统编程服务的,java是为企业级应用服务的.R语言是用于统计分析,这样在R的系统中有大量的库(或者是package)用来实现特定的统计方法. 基本的数据类型 学习各个语言的第一步是了解这个语言的最基本的数据类型,这决定如何使用变量进行计算. 基本数据类型是直接由语言本身所定义的变…