医疗图像解析 Dicom 后缀: .dcm..DCM Dicom中规定的坐标系是以人坐标系为绝对坐标系的,规定X轴正向指向病人的左侧,Y轴正向指向病人的背部,Z轴正向指向病人的头部.但是,坐标点的位置,每个厂商都有自己的看法 下图展示了成像过程中对应的坐标系 成像坐标系 三视图 图片信息中的Tag说明 在DICOM中,是通过Image Position和Image Orientation来描述当前的图像和人体坐标系的相对位置的. 解析举例 import dicom import pylab im…

最近导师给安排了新任务,由于刚进入实验室,对于医学图像这一块还一知半解,所以就想分享一下有关医学常见影像的学习(尤其是dicom后缀的图像文件),欢迎大家一起交流. 目录 1.医学影像学的介绍 2.DICOM信息的简介 3.DICOM内部信息详解(DICOM Tag与VR) 4.利用python+pydicom这个库解析DICOM文件 5.DICOM的三个切面 1.医学影像学 (1).医学影像学Medical Imaging,是研究借助于某种介质(如X射线.电磁场.超声波等)与人体相互作用,把人…

CT值的单位是Hounsfield,简称为Hu,范围是-1024-3071.用于衡量人体组织对X射线的吸收率,设定水的吸收率为0Hu. 在DICOM图像读取的过程中,我们会发现图像的像素值有可能不是这个范围,通常是0-4096,这是我们常见到的像素值或者灰度值,这就需要我们在图像像素值(灰度值)转换为CT值. 首先,需要读取两个DICOM Tag信息,(0028|1052):rescale intercept和(0028|1053):rescale slope. 然后通过公式: Hu = pix…

在matlab中用dicomread读取dicom文件后,生成一个MxN矩阵(对应图像像素个数),每个像素灰度数据是int16格式 但是bmp图像灰度是int8格式的(灰度范围0~255),所以若想把dicom图像存储为bmp图像做后续处理,需要将16位的dicom灰度数据映射为8位的灰度数据. 采用的方法即医学图像处理中常见的加窗处理. 实例代码如下: img=imadjust(img_raw,[;]); %调整灰度范围 img= low=min(min(img)); high=max(max…

加入实验室后,经过张老师的介绍,有幸与某公司合共共同完成某个项目,在此项目中我主要负责的是三维 pdf 报告生成.Dicom图像上亮度.对比度调整以及 Dicom图像三维重建.今天主要介绍一下完成Dicom图像三维重建的过程以及自己的心得体会.实现Dicom三维图像重建最主要用的VTK(Visualization Toolkit,也就是可视化工具包),由于今天的主题不是有关VTK,所以有关VTK的学习(包括VTK介绍.使用.实列),可以参考此链接:https://blog.csdn.net/wi…

, , bmpOrg.Width, bmpOrg.Height);       g.Dispose();       // 画像を保存       string dirName = Path.GetDirectoryName(basePath);       string fileName = Path.GetFileNameWithoutExtension(basePath);       string extName = Path.GetExtension(basePath);       …

Git别名设置:https://www.cnblogs.com/hero123/p/9105381.html Git远程项目公钥配置:https://www.cnblogs.com/hero123/p/9105822.html 基础命令: git init 初始化本地仓库 git status 查看git状态 git log 查看commit记录    注意:q 键退出 git log config --list  查看配置 git config --global  user.name  "xx…

官网地址:https://github.com/chafey/cornerstone 简介: Cornerstone is an open source project with a goal to deliver a complete web based medical imaging platform. This repository contains the Cornerstone Core component which is a lightweight JavaScript libra…

背景介绍: 近期项目需求,须要使用C#进行最新的UI和相关DICOM3.0医学图像模块的开发.在C++语言下,我使用的是应用最广泛的DCMTK开源库,在本专栏的起初阶段的大多数博文都是对DCMTK开源库的介绍和学习.眼下因为项目须要,现開始对mDCM开源库继续学习分析,因此本专栏接下来的文章会大多以mDCM开源库为例进行医学图像的解说,DCMTK因为是C++语言开发的,所以作为我学习和剖析mDCM开源库的原始根据,我们并未放弃对DCMTK开源库的学习,而是通过更加细致的研读和分析DCMTK的C+…

题记: DICOM医学图像处理专栏撰写已有两个年头,积累了近百篇文章.起初只是用于记录自己科研.工作中遇到的疑难问题,专注于图像处理(主要是医学图像,这也正是专栏名称最初的由来):后来逐渐延伸到了DICOM数据传输方向,专注于医院内影像数据的传输和管理,遂将博文标题按照[DICOM医学图像处理:XXX]和[DICOM:XXX]划分,分别介绍图像处理和数据传输:到最后又添加了开源工具分析部分,诸如DICOM开源实现库(dcmtk.dcm4che.fo-dicom).开源PACS系统(Orthanc…