pacbio 采用hdf5文件格式保存原始的下机数据,对于RS 测序系统而言,会产生一个 bas.h5 的文件; 以bas.h5 文件为例,看一下有下机数据中保存了那些信息 h5dump 工具可以用来查看h5 文件的内容: 我从HGAP的wiki 页面下载了一个测试用的h5文件,文件名为 m120729_040044_42134_c100384402550000001523033010171256_s1_p0.bas.h5 运行下面命令: h5dump -n m120729_040044_421…

h5文件是层次格式的第5代版本,用于存储科学数据的一种文件格式和库文件,由美国超级计算中心与应用中心研发的文件格式,用以存储和组织大规模数据. H5将文件结构简化成两个主要的对象类型: 1 数据集dataset,就是同一类型数据的多维数组 2 组group,是一种容器结构,可以包含数据集和其他组,若一个文件中存放了不同种类的数据集,这些数据集的管理就用到了group 直观的理解,可以参考我们的文件系统,不同的文件存放在不同的目录下: 目录就是hdf5文件中的group,描述了数据集DataSet…

Rhel6.5 Django1.10 Python3.5 Django框架-目录文件简介 1.介绍Django Django:一个可以使Web开发工作愉快并且高效的Web开发框架. 使用Django,使你能够以最小的代价构建和维护高质量的Web应用. 遵循模式:模型-视图-控制器(MVC)模式.简单的说, MVC 是一种软件开发的方法,它把代码的定义和数据访问的方法(模型)与请求逻辑 (控制器)还有用户接口(视图)分开来.这种设计模式关键的优势在于各种组件都是 松散结合 的.这样,每个由 Dja…

Android资源文件简介 1. Android应用资源的作用 (1) Android项目中文件分类 在Android工程中, 文件主要分为下面几类 : 界面布局文件, Java src源文件, 资源文件; -- 界面布局文件 : 在res/layout目录下定义, 用于定义Android中界面的显示样式; -- Java源码文件 : Android程序的逻辑实现, 程序主体; -- 资源文件 : 各种XML文件, 可以定义图片等资源, 以及各种图片, 音频, 视频, 3d模型等资源; (2)…

一.properties文件简介 java中的properties文件是一种配置文件,主要用于表达配置信息,文件类型为*.properties,格式为文本文件,文件的内容是格式是"键=值"(推荐)或"键:值"的格式,在properties文件中,可以用"#"(推荐)或者"//"来作注释,properties文件在Java编程中用到的地方很多,操作很方便.(注意:其实properties文件相当于只是定义了一种文件格式,在实际应…

1.AndroidManifest.xml文件简介: 每个应用程序在它的根目录中都必须要有一个AndroidManifest.xml(名字须精确一致)文件.这个清单把应用程序的基本信息提交给Android系统,在应用程序的代码能够运行之前,这个信息系统必须建立.以下项目是清单文件所需要完成的工作: [注]:这个文件是需要程序员手动配置的,所以了解它的作用和结构很有必要. 1. 用Java包给应用程序命名.这个包名是应用程序的唯一标识: 2. 描述应用程序的组件---组成应用程序的Activity…

原文:IOS之Info.plist文件简介 http://www.apkbus.com/android-130240-1-1.html (出处: Android开发论坛 - 安卓开发论坛 - Android开发 - 安卓论坛 - 移动互联网门户) 元信息简介    为了提供更好的用户体验,IOS 和 OS X的每个app或bundle都依赖于特殊的元信息(meta Information).     元信息有多种用途,包括 直接向用户展示信息 系统内部用来标识你的app或其支持的文档类型 系统框…

h5文件格式,HDF 的版本 5(HDF 版本 5不与 HDF 版本 4 及早期版本兼容)．HDF是什么呢?就是Hierarchical Data Format,可以存储不同类型的图像和数码数据的文件格式,并且可以在不同类型的机器上传输,同时还有统一处理这种文件格式的函数库.大多数普通计算机都支持这种文件格式.美国国家高级计算应用中心(National Center for Supercomputing Application,NCSA)为了满足各种领域研究需求而研制的一种能高效存储和分发科学数…

Git .gitignore文件简介及使用 By:授客 QQ:1033553122 .gitignore 这个文件的作用就是告诉Git哪些文件不需要添加到版本管理中.实际项目中,很多文件都是不需要版本管理的,比如Python的.pyc文件,Git会根据这个文件里配置的这些规则来判断是否将文件添加到版本控制中. 注意,直接新建文件后,重命名为.gitignore是行不通的,windows不让,必须通过另存为的方式设置为.gitignore文件 常用的规则: 1)/mtk/             …

Keras的模型是用hdf5存储的,如果想要查看模型,keras提供了get_weights的函数可以查看: for layer in model.layers: weights = layer.get_weights() # list of numpy array 而通过hdf5模块也可以读取:hdf5的数据结构主要是File - Group - Dataset三级,具体操作API可以看官方文档.weights的tensor保存在Dataset的value中,而每一集都会有attrs保存各网络…