find ./ -name *.Annovar.hg19_multianno.vcf.gz |xargs -i cp {} ./bak/ find `pwd` -name "*.depth"|awk '{print "echo -e \""substr($1,31,13)" \\c\"; cat "$1"|awk '\''BEGIN {i=0} {  i=i+1  }  END {print i}'\''"…

linux驱动开发总结(一) 基础性总结 1, linux驱动一般分为3大类: * 字符设备 * 块设备 * 网络设备 2, 开发环境构建: * 交叉工具链构建 * NFS和tftp服务器安装 3, 驱动开发中设计到的硬件: * 数字电路知识 * ARM硬件知识 * 熟练使用万用表和示波器 * 看懂芯片手册和原理图 4, linux内核源代码目录结构: * arch/: arch子目录包括了所有和体系结构相关的核心代码.它的每一个子目录都代表一种支持的体系结构,例如i386就是关于intel c…

http://www.ibm.com/developerworks/cn/linux/l-cn-utrace/ utrace是为运行态的进程提供trace和debug支持. utrace能做如下事情: 1 跟踪目标进程的各种事件 2 Debugger能控制调试程序,让目标暂停或者单步执行 3 对目标进程地址空间的访问能力 可以使用nuttcp来确认两机之间的吞吐量 在一台机器上使用nuttcp搭建接收器(服务器),在另外一台机器上搭建发送器(Sender),然后就可以测试速度了. 如何控制网络的…

vi  文本编辑器 语法:vi [参数] 文件 进入vi全屏幕编辑画面 按字母i进入[输入模式],按[ESC]转到命令行, 输入 :q可不保存退出vi :wq存盘退出vi :q!不存盘强制退出 :w filename   将文件以指定的文件名filename保存 命令模式功能键 a 从目前光标所在的位置的下一个位置开始输入文字 o 插入新的一行,从行首开始输入文字 -移动光标 h.j.k.l 分别控制光标左.下.上.右移动一个 Ctrl+b 屏幕向后移动一页 Ctrl+f 屏幕向前移动一页 Ct…

1章 内核入门HACK #1 如何获取Linux内核HACK #2 如何编译Linux内核HACK #3 如何编写内核模块HACK #4 如何使用GitHACK #5 使用checkpatch.pl检查补丁的格式HACK #6 使用localmodconfig缩短编译时间 第2章 资源管理HACK #7 Cgroup.Namespace.Linux容器HACK #8 调度策略HACK #9 RT Group Scheduling 与RT ThrottlingHACK #10 Fair Group…

HACK #21FUSE 本节将介绍使用用户进程的文件系统框架—FUSE.FUSE概要FUSE(Filesystem in Userspace,用户空间文件系统),是用来生成用户空间的一般进程的框架.使用FUSE,就可以以一般应用程序进程的形式生成独特的文件系统,与已有的文件系统同样进行挂载.从Linux 2.6.14开始实际安装FUSE.例如,在最近的Linux发布版中,有一些标准配置用于挂载Windows的文件系统NTFS的ntfs-3g(Ubuntu等).当连接到存在NTFS格式文件系统的…

HACK #20 使用fio进行I/O的基准测试 本节介绍使用fio进行模拟各种情况的I/O基准测试的操作方法.I/O的基准测试中有无数需要考虑的因素.是I/O依次访问还是随机访问?是通过read/write的I/O?还是通过访问mmap的空间的I/O?是单一进程发出的I/O?还是多个进程同时发出的I/O?进程是受I/O限制还是受CPU限制?等等.如果使用fio,就不需要每次都根据不同情况来编写用于性能评估的程序,就可以模拟这些情况的I/O.安装fioFedora.Ubuntu等主流发布版中都备…

HACK #18 向ext4转换 ext4可以与ext2/ext3在后台进行互换.这里将介绍从ext2/ext3转换的方法以及转换时的注意事项.转换有两种方法可以将ext2/ext3的磁盘映像作为ext4来使用.1.直接作为ext4挂接执行下列命令,就可以将ext2/ext3的磁盘映像/dev/sdb1作为ext4挂载到/mnt. # mount -t ext4 /dev/DEV MOUNTPOINT 通过上述方法,ext4的多块分配.延迟分配等功能也可以使用,因此性能比ext2/ext3更高.…

HACK #17 如何使用ext4 本节介绍ext4的编写和挂载方法.开发版ext4的使用方法.ext4是ext3的后续文件系统,从Linux 2.6.19开始使用.现在主要的发布版中多数都是采用ext4作为标准文件系统.除了间接参照块管理以外,ext4还以扩展形式支持块的管理,使其能够处理更大的文件.文件系统.另外,还增加了确保多块(multiblock)注1.确保延迟块.提高fsck速度.碎片整理等新的功能.在ext3中,时间戳(time stamp)的单位为毫秒,而ext4中变成了纳秒,可…

HACK #16 OOM Killer的运行与结构(1) 本节介绍OOM Killer的运行与结构. Linux中的Out Of Memory(OOM) Killer功能作为确保内存的最终手段,可以在耗尽系统内存或交换区后,向进程发送信号,强制终止该进程. 这个功能即使在无法释放内存的情况下,也能够重复进行确保内存的处理过程,防止系统停滞.还可以找出过度消耗内存的进程.本节将介绍2.6内核的OOM Killer. 确认运行.日志 进行系统验证或负载试验时,有时会出现正在运行中的进程终止或者SSH…