DNA Sequence Time Limit: 1000MS   Memory Limit: 65536K Total Submissions: 11860   Accepted: 4527 Description It's well known that DNA Sequence is a sequence only contains A, C, T and G, and it's very useful to analyze a segment of DNA Sequence,For ex…

题意:给定一些串,然后让你构造出一个长度为 m 的串,并且不包含以上串,问你有多少个. 析:很明显,如果 m 小的话 ,直接可以用DP来解决,但是 m 太大了,我们可以认为是在AC自动机图中,根据离散中的矩阵的幂可以表示 从 i 到 j 需要 x 步的有多少条.比如A[1][2]^5 = 10,表示从结点 1 到结点 2 走五步有10种方法,利用这种方法,就可以直接进行矩阵快速幂了. 代码如下: #pragma comment(linker, "/STACK:1024000000,1024000…

题意 : 给出一些病毒串,问你由ATGC构成的长度为 n 且不包含这些病毒串的个数有多少个 分析 : 这题搞了我真特么久啊,首先你需要知道的前置技能包括 AC自动机.构建Trie图.矩阵快速幂,其中矩阵快速幂和AC自动机可能都熟悉,但是这题为什么和矩阵有关系?Trie图是什么呢?好像只听说过Trie树啊!下面我慢慢展开,首先声明本人水平实在实在有限,理解错误的地方请批评指证,万分感激! 与矩阵的联系( 你可能需要百度.... ) ==> 解决此题就要先了解到如何用矩阵去解决 求从A点到B点刚好经…

链接:http://poj.org/problem?id=2778 题意:给定不超过10串,每串长度不超过10的灾难基因:问在之后给定的长度不超过2e9的基因长度中不包含灾难基因的基因有多少中? DNA:只含'A','T','C','G'四种字符: 思路:这并不是很裸的ac自动机..没有很明显的文本串匹配过程,但是我们能过通过对灾难基因建好Trie,在跑一下失配边时需要初始化状态转移矩阵了: 状态矩阵:每一次都可以往下一个位置走四个方向,但是要求不能走到单词节点. (mat[i][j]) ^n:…

题意:给定n个不能出现的模式串,给定一个长度m,要求长度为m的合法串有多少种. 思路:用AC自动机,利用AC自动机上的节点做矩阵乘法. #include<iostream> #include<cstdio> #include<cstring> #include<cmath> #include<string> #include<algorithm> #include<queue> #define MOD 100000 ];…

DNA Sequence Time Limit: 1000MS   Memory Limit: 65536K Total Submissions: 11860   Accepted: 4527 Description It's well known that DNA Sequence is a sequence only contains A, C, T and G, and it's very useful to analyze a segment of DNA Sequence,For ex…

DNA Sequence 题意:DNA的序列由ACTG四个字母组成,如今给定m个不可行的序列.问随机构成的长度为n的序列中.有多少种序列是可行的(仅仅要包括一个不可行序列便不可行).个数非常大.对100000取模. 思路:推荐一个博客,讲的很清楚. 这样的题目.n非常大,首先想到的就是用矩阵来优化.那么怎样构造转移方程呢:首先建立一棵Trie,然后依照AC自己主动机的方式构造fail指针,然后会发现.当一个状态分别加入ACTG之后,会得到还有一个状态. (详细解释见代码) 代码: /* ID:…

传送门 AC自动机加DP就不说了 注意到 m <= 10,所以模式串很少. 而 n 很大就需要 log 的算法,很容易想到矩阵. 但是该怎么构建? 还是矩阵 A(i,j) = ∑A(i,k) * A(k,j),那么i到j的方案数就是j到k的方案数称k到j的方案数,那么直接矩阵快速幂即可 #include <queue> #include <cstdio> #include <cstring> #define N 100001 #define p 100000 #d…

题目链接 能AC还是很开心的...此题没有POJ2778那么难,那个题还需要矩阵乘法,两个题有点相似的. 做题之前,把2778代码重新看了一下,回忆一下当时做题的思路,回忆AC自动机是干嘛的... 状态表示dp[i][j]长度为i的以j串为结束的最小改变数目.AC自动机预处理一下,然后DP. 卡内存+不知道状态数,MLE+RE+WA了多次. #include <iostream> #include <cstring> #include <cstdio> #include…

DNA repair Problem Description   Biologists finally invent techniques of repairing DNA that contains segments causing kinds of inherited diseases. For the sake of simplicity, a DNA is represented as a string containing characters 'A', 'G' , 'C' and '…