本文首发于“生信补给站”公众号,https://mp.weixin.qq.com/s/ZEjaxDifNATeV8fO4krOIQ更多关于R语言,ggplot2绘图,生信分析的内容,敬请关注小号. 为了能更方便的查看,检索,对文章进行了精心的整理.建议收藏,各取所需,当前没用也许以后就用到了呢! 一 R资料+计划 R语言精品资料年中无套路赠送 R-plotly|交互式甘特图(Gantt chart)-项目管理/学习计划 二 Bioinfo R|fastqcr QC数据处理 :测序结果的数据质控及…

各种生信工具: https://omictools.com/…

非原创 参考资料: 一文掌握GO和pathway分析 - 生物信息学讨论版 -丁香园论坛http://www.dxy.cn/bbs/thread/34904124#34904124 GO富集 GO是Gene ontology的缩写,GO数据库分别从功能.参与的生物途径及细胞中的定位对基因产物进行了标准化描述,即对基因产物进行简单注释,通过GO富集分析可以粗略了解差异基因富集在哪些生物学功能.途径或者细胞定位. Pathway Pathway指代谢通路,对差异基因进行pathway分析,可以了解实…

http://mp.weixin.qq.com/s/nK1Kkf9lfZStoX25Y7SzHQ 这篇文章主要适用于Linux平台,当然MacOS也行,不过它有更好安装方法. 此外网上也会许多更好的关于biconda的教程,这里还是抛砖应用,提供一种除了编译源码和直接下载二进制文件外安装生信软件的一种思路 bioconda是什么 官方介绍是: Bioconda is a channel for the conda package manager specializing in bioinform…

使用NCBI进行目的基因的引物设计 全文概述 利用生信工具进行目的基因的引物设计,使用了NCBI进行筛选与设计引物,使用 idtdna对筛选出的DNA进行检查.本文分享了如何筛选出高质量的基因引物,帮助想通过生信进行引物设计的学生.从业者找出合适的基因,毕竟购买引物也比较烧钱,避免设计出的基因质量偏低. NCBI查找基因 1.查询目的基因:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/?term=zbed3 备注:这里需要注意的是,要找到合适的目的基因!如果找智人,一…

这里记录每周值得分享的科技内容,周五发布. 本杂志开源(GitHub: ruanyf/weekly),欢迎提交 issue,投稿或推荐科技内容. 周刊讨论区的帖子<谁在招人?>,提供大量程序员就业信息,欢迎访问或发布工作/实习岗位. 封面图 2021 世界机器人大会在北京举行,一家公司展出了"爱因斯坦"人形机器人,使用中文向学生"授课".(via) 本周话题:中国法院承认 GPL 吗? 开源软件通常带有许可证.大家一直很想知道,如果国内用户不遵守许可证,…

LeDock是苏黎世大学Zhao HongTao在博士期间开发的一款分子对接软件,专为快速准确地将小分子灵活对接到蛋白质而设计.LeDock优于大部分商业软件,在Astex多样性集合上实现了大于90%的构象预测准确度,对接时间最快仅需三秒.LeDock同时支持Windows.Linux和MacOS三大操作系统. Linux版支持大规模虚拟筛选,需要通过代码操作才能实现目标. Windows版的图形界面极大简化了药物化学家常见多重复杂的对接过程,但每次任务只能对接一个分子,效率极低,只适用于少量对…

1.官网下载GATK. (学校网速实在是太慢了,下载几个小时到自闭) 下载地址:https://software.broadinstitute.org/gatk/download/ 下载完成后文件夹中有如下内容. 2.docker的下载. 因为我的电脑配置的Windows10,而GATK仅支持Linux和MacOSX(这个时候要注意一定要多查看documentation),询问老师后决定使用虚拟机.在GATK的入门指南上有明确建议使用docker,但是我从来没有接触过这一方面(卑微),所以下面主…

这里记录每周值得分享的科技内容,周五发布. 本杂志开源(GitHub: ruanyf/weekly),欢迎提交 issue,投稿或推荐科技内容. 周刊讨论区的帖子<谁在招人?>,提供大量程序员就业信息,欢迎访问或发布工作/实习岗位. 封面图 浙江普陀山客运中心最近获得2021年度凡尔赛建筑奖.(via) 本周话题:全能程序员 vs 特长程序员 我读过一些篮球报道,里面说 NBA 球队不喜欢"全能型球员",更喜欢"特长型球员". 所谓"特长型球员…

这里记录每周值得分享的科技内容,周五发布. 本杂志开源(GitHub: ruanyf/weekly),欢迎提交 issue,投稿或推荐科技内容. 周刊讨论区的帖子<谁在招人?>,提供大量程序员就业信息,欢迎访问或发布工作/实习岗位. 封面图 河北太行山脉,山头密密麻麻都被太阳能板覆盖了.(via) 本周话题:知识广度 vs 知识深度 上一期谈到,"特长程序员"比"全能程序员"吃香. 网友发给我一个网址,国外有人已经谈过这个话题. 国外作者画了一张图,将世…