sequenza细胞纯度计算

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安装sequenza bam文件要放在前面,否侧会-f命令可能识别错误 samtools mpileup a.bam -f hg19.fasta -Q 20 |gzip > normal.pileup.gzsamtools mpileup b.sorted.bam -f hg19.fasta -Q 20 |gzip > tumor.pileup.gz ········································································…

语音识别（LSTM+CTC）

完整版请微信关注“大数据技术宅” 序言:语音识别作为人工智能领域重要研究方向,近几年发展迅猛,其中RNN的贡献尤为突出.RNN设计的目的就是让神经网络可以处理序列化的数据.本文笔者将陪同小伙伴们一块儿踏上语音识别之梦幻旅途,相信此处风景独好. 内容目录环境准备 RNN与LSTM介绍RNNLSTM语音识别介绍声学特征提取声学特征转换成音素(声学模型)音素转文本(语言模型+解码)语音识别简单实现提取WAV文件中特征将WAV文件对应的文本文件转换成音素分类定义双向LSTM 模型训练和测试环境准备…

lakala proportion轨迹分析代码

/** * Created by lkl on 2017/12/7. */ import breeze.numerics.abs import org.apache.spark.sql.SQLContext import org.apache.spark.mllib.regression.LabeledPoint import org.apache.spark.SparkContext import org.apache.spark.SparkConf import org.apache.spa…

LSTM理解

简介 LSTM(Long short-term memory,长短期记忆)是一种特殊的RNN,主要是为了解决长序列训练过程中的梯度消失问题.以下先从RNN介绍. 简说RNN RNN(Recurrent Neural Network,循环神经网络)是一种处理序列数据的神经网络.下图是它的结构: RNN优点:它能处理序列数据,并且有记忆能力,能够利用上文信息. RNN缺点: 梯度消失:对于获取长距离依赖的效果不是很好(即如果上文信息离当前输入距离太远的话,理论上它是能够记得上文信息,但是事实上并不是…

[NLP]LSTM理解

简介 LSTM(Long short-term memory,长短期记忆)是一种特殊的RNN,主要是为了解决长序列训练过程中的梯度消失问题.以下先从RNN介绍. 简说RNN RNN(Recurrent Neural Network,循环神经网络)是一种处理序列数据的神经网络.下图是它的结构: 从上图可以看出,RNN循环获取输入序列,并保存上一次输入的计算结果,与当前输入进行计算后,将计算结果输出并保存当前的计算结果,这样不断循环输入并计算,即可获取上文信息. RNN内部网络如下图所示,从图中可以…

Vector-based navigation using grid-like representations in artificial agents

郑重声明:原文参见标题,如有侵权,请联系作者,将会撤销发布! Nature May 17, 2018 Received: 5 July 2017; Accepted: 3 April 2018;Published online 9 May 2018. Abstract 深度神经网络在从目标识别到复杂的游戏(例如Go1,2)等领域都取得了令人瞩目的成功.然而,对于人工智能体而言,导航仍然是一个巨大的挑战,通过强化学习训练的深度神经网络3-5无法与哺乳动物空间行为的能力相提并论,而后者是由内嗅皮层中…