R  画网络图 目的:用R做生信分析,画基因样本的网络图,从中观察样本的致病性情况. 一.所用到的包 library(tidyr) library(ggplot2) library(reshape2) library(readr) library(network) library(dplyr) library(plyr) library(sna) library(GGally) library(ggnetwork) library(tidygraph)# tidy graph analysis…

用R画地图数据 首先,从这里下载中国地图的GIS数据,这是一个压缩包,完全解压后包含三个文件(bou2_4p.dbf.bou2_4p.shp和bou2_4p.shx),将这三个文件解压到同一个目录下. 用R绘制地图比较简单.比如画一下全国范围的区域,可以用如下代码: library(maptools) mydat = readShapePoly("china-province-border-data.tar/china/bou2_4p.shp") #地图包位置,根据自己的角标位置设置…

用 R 画中国分省市地图 (2010-11-18 16:25:34) 转载▼ 标签: 中国地图 营销 杂谈 分类: 数据分析 用R 也可以做出漂亮的依参数变化的中国地图. 主要参考(http://cos.name/author/yixuanq/) library(maptools) axx<-readShapePoly("bou2_4p.shp", proj4string=CRS("+proj=longlat +ellps=clrk66")) x=axx #p…

#导入R包 library(grid)library(futile.logger)library(VennDiagram) #建立测试数据集 A = 1:150B = c(121:170,300:320)C = c(20:40,141:200)Length_A<-length(A)Length_B<-length(B)Length_C<-length(C)Length_AB<-length(intersect(A,B))Length_BC<-length(intersect(…

近期在网上找了几种画中国地图方法,终于认为这种方法还是最适用的 1.用googlevis包.因为中国国情如今已经不能訪问google地图了.所以大多中国用户来说仅仅能望洋兴叹了. 2.用ggplot包,尽管也不错是,但试了后还是些限制的,要用到的gpclib包,在windows和redhat linux系统上是不被支持的,仅仅有ubuntu系统上支持,所以对于想在win和redhad linux绘图不太easy.并且画出来的地图easy变形,不好调整. 3.最后还是plot工具画的,看上还不错.…

R 绘制中国省市分布地图 library(maps) library(mapdata) library(maptools); getColor=function(mapdata,provname,provcol,othercol) { f=function(x,y) ifelse(x %in% y,which(y==x),0); colIndex=sapply(mapdata@data$NAME,f,provname); fg=c(othercol,provcol)[colIndex+1]; r…

1.导入数据 2.散点图 plot(iris[,1]~iris[,4],xlab='Length',ylab='Width',col='red',main='Length VS Width')…

id percent  k1_B04_WL-1.fs_1   0.021 k31_B04_WL-1.fs_1   0.624 k21_B04_WL-1.fs_1   0.355 k1 K=3  数据输入如上面所示: library(ggplot2) ggplot(b,aes(id,percent,fill=k))+geom_bar(stat="identity",width=1)+xlab("")+ theme_bw()+ theme(panel.grid =ele…

原始图样: library(ggplot2) dt = data.frame(A = c(2, 7, 4, 10, 1), B = c('B','A','C','D','E')) p = ggplot(dt, aes(x = "", y = A, fill = B)) + geom_bar(stat = "identity") + coord_polar(theta = "y") ## 把柱状图折叠成饼图(极坐标) p 如何去除饼图中心的杂点:…

数据格式如下 gene_id Sham-1 Sham-2 Sham-3 Sham-4 Sham-5 Rep-1h-1 Rep-1h-2 Rep-1h-3 Rep-1h-4 Rep-1h-5 Rep-3h-1 Rep-3h-2 Rep-3h-3 Rep-3h-4 Rep-3h-5 Rep-6h-1 Rep-6h-2 Rep-6h-3 Rep-6h-4 Rep-6h-5 Rep-12h-1 Rep-12h-2 Rep-12h-3 Rep-12h-4 Rep-12h-5 Rep-24h-1 Rep-2…