技术背景 在分子动力学模拟过程中会遇到一些拓扑结构非常复杂的分子模型,所谓的复杂不仅仅是包含众多的原子,还有各种原子之间的成键关系与成键类型等.这时候就非常能够体现一个好的可视化软件的重要性了,这里我们介绍的VMD是一个业界非常常用.功能也非常强大的一款软件. VMD的安装 首先访问VMD官方网站,找到适合自己本地OS和硬件系统的版本进行下载.这里我们本地是Ubuntu20.04的系统,所以下载了一个Linux通用的版本: 下载到本地之后,找到一个合适的文件夹进行解压: dechin@ubunt…

技术背景 增强采样(Enhanced Sampling)是一种在分子动力学模拟中常用的技术,其作用是帮助我们更加快速的在时间轴上找到尽可能多的体系结构及其对应的能量.比如一个氢气的燃烧反应,在中间过程中会产生众多的反应产物,但是我们光从结果来看的话,就是从\(H_2\)加\(O_2\),经过燃烧以后变成了\(H_2O\),那么中间的过程就被我们全部忽略了.实际上化学反应是一个整体的过程,是非常复杂的,如果要控制一个化学反应的过程,或者制备某个中间态的产物,或者需要提升最终预期产物的占比,我们不得…

网络运维必回的模拟器-GNS软件下载和安装 作者:尹正杰  版权声明:原创作品,谢绝转载!否则将追究法律责任. 一.GNS简介 1>.什么是GNS GNS3是一款具有图形化界面可以运行在多平台(包括Windows, Linux, and MacOS等)的网络虚拟软件.Cisco网络设备管理员或是想要通过CCNA,CCNP,CCIE等Cisco认证考试的相关人士可以通过它来完成相关的实验模拟操作.同时它也可以用于虚拟体验Cisco网际操作系统IOS或者是检验将要在真实的路由器上部署实施的相关配置.…

目录: 一.文章主旨 二.问题发现的起因 三.bug(问题)描述 四.软件截图 五.我的思考 六.一点期盼 一.文章主旨: 2019年5月18.19.20日,又是一年一度的护资考试(上机考),考试前夕,我却发现了考试软件的一个bug(问题),不是严重漏洞,莫慌,属于设计规则问题,有损人性化和公平性. 二.问题发现的起因: 女PY(Peng You)给我说她们的护资上机考试不能回头修改答案,我当时还不相信,还说女PY理解错了,跟女PY大声说理,原来是我错了.现在有点自责,不该对女PY大声说话. 具…

用JSON-server模拟REST API(一) 安装运行 在开发过程中,前后端不论是否分离,接口多半是滞后于页面开发的.所以建立一个REST风格的API接口,给前端页面提供虚拟的数据,是非常有必要的. 对比过多种mock工具后,我最终选择了使用 json server 作为工具,因为它足够简单,写下少量数据,即可使用.也因为它足够强大,支持CORS和JSONP跨域请求,支持GET, POST, PUT, PATCH 和 DELETE 方法,更提供了一系列的查询方法,如limit,order等…

用 Ubuntu 安装输入法软件包时提示"需要安装不能信任的软件包","这个动作需要从没有授权的软件源来安装软件包",赋予权限执行仍然无法安装,上网查了一下,只需要升级一下软件源列表(在终端下执行 sudo apt-get update ,需要保持联网)再执行安装即OK…

PfSense基于BSD的软件防火墙的安装.配置与应用 PfSense是一个FreeBSD下的免费开源的防火墙和路由器软件,他为了在X86平台上面建立一个高集成性的防火墙项目,下面就为大家展示如何配置应用. 安装:http://video.sina.com.cn/v/b/73333887-1443650204.html 配置:http://you.video.sina.com.cn/b/73331652-1443650204.html 应用:http://video.sina.com.cn/v/…

打包的时候,经常需要安装一些其它的环境库,而又不想让用户繁锁的去选择,这时就需要静默安装,而不同的文件所加的参数了不一致,比如VS的环境库vcredist_x86.exe(这是32位的环境库)后面加/q即可完成静默安装,而NSIS打包的文件使用/q是不行的,查了相关的资料得使用/S(这里要大写),其它格式的文件参考下面的转载内容: --------------------------------------------------华丽的分割线---------------------------…

RAMPS1.4 3D打印控制板:软件下载\连接\安装\测试 特别说明: 电源接反,电机驱动板接反将有可能烧毁芯片和电路,请再三确认后再进行通电. 如何使用: 1.需要用到的模块或器件: Arduino Mega2560 主控板(该套件包含):这是3d打印机的大脑,负责控制整个打印机来完成特定的动作,如打印特定的文件等: RAMPS1.4 (该套件包含):这是上面主控板的拓展板,有它是为了更好的与其它硬件进行连接和控制的,起到过渡桥梁的作用: A4988步进电机驱动板(该套件包含):这是用来连接…

今天来说下在CentOS下下载软件,不安装的方法: 方法一:通过yum自带一个工具:yumdownloader[root@web1 ~]#  rpm -qa |grep yum-utils[root@web1 ~]# yum -y install yum-utils*[root@web1 ~]# rpm -ql yum-utils/usr/bin/debuginfo-install/usr/bin/package-cleanup/usr/bin/repo-graph/usr/bin/repo-r…