目标如题,有多个fasta文件和一个文件名列表,将文件名列表中包含的文件匹配出来并提取第一条序列合并成一个fa文件. 这个采用perl实现,用法和代码如下: 1 #!/usr/bin/perl -w 2 use strict; 3 4 sub usage{ 5 die "usage:perl $0 <fa.list> <Fasta_Dir> <merged.fa>\n",unless(@ARGV==3); 6 } 7 usage(); 8 9 ope…

以下都是一些简单的免费分享的工具,技术支持群:592132877,提供定制化服务开发. Gif动图合成工具 主要功能是扫描指定的文件夹里的所有zip文件,然后提取Zip文件中的图片,并合成一张gif图片,存储到新的路径下,支持设置gif的时间,演示效果如下: 下载地址:gif合成工具 文件批量移动工具 主要功能是将指定文件夹及子文件夹里所有文件,复制到新的文件夹下,可以指定是否删除源文件.以下动图演示效果. 下载地址:文件批量移动工具.exe 文件批量移动工具 主要功能是将指定目录下所有文件按照…

例如在aaaa12xxxx中提取12,在参考了stackoverflow后比较方便的大致有以下几种方法: 利用sub跟gsub sub(".*?([0-9]+).*", "\\1", "aaa12xx99",perl=TRUE) #其中\\1指括号中匹配的部分 gsub("[^0-9]", "", "aaa12xxxx") regmatchs法 txt <- "aaa12…

import java.io.File; import java.util.ArrayList; import java.util.List; import java.util.Queue; /** * @author tiwson 2010-06-02 * */ public class FileSearcher { /** * 递归查找文件 * @param baseDirName 查找的文件夹路径 * @param targetFileName 需要查找的文件名 * @param file…

http://blog.sina.com.cn/s/blog_62e7fe670101dg9d.html linux下二进制文件查找: strings 0000.ts | grep -o "T"  | wc -l grep _initcall_.*1$ ./aa > a1 2982  find . -regex '.*\.c|.*\.cxx|.*\.cpp|.*\.h' 2983  find . -regex '.*\.c\|.*\.cxx\|.*\.cpp\|.*\.h' 29…

Python 标准库的 glob 模块支持查询匹配指定模式的文件或目录.这里的模式使用的并不是正则表达式,而是通过通配符来匹配的 Unix 风格的路径名扩展. 支持的通配符: 通配符 说明 *  匹配任意个字符 ?  匹配一个字符 []  匹配括号间的任一字符,可以使用 - 表示范围  \  转义字符,如用 \? 匹配 ? 假设现在有一个名为 dir 的目录,该目录及其子目录的结构如下: ├── dir │   ├── db.conf │   ├── dir1 │   │   ├── hello…

office版本:2016 系统版本:win10 问题描述: 1.桌面新建excel表格后,打开时,提示“Excel无法打开文件xxx.xlsx,因为文件格式或文件扩展名无效.请确定文件未损坏,并且文件扩展名与文件的格式匹配” 2.点击确认后,通过文件->新建->空白工作簿->另存为->xxx.xlsx,可正常打开 3.能打开之前保存的excel文件 截图:  出现原因: 安装极速PDF阅读器其他办公套件,后卸载,发现右键不能新建word/excel/ppt ,后采取http://…

[转]fnmatch模块的使用 fnmatch模块的使用 此模块的主要作用是文件名称的匹配,并且匹配的模式使用的unix shell风格.fnmatch比较简单就4个方法分别是:fnmatch,fnmatchcase,filter,translate 1.fnmatch fnmatch.fnmatch(filename, pattern)测试filename,是否符合pattern. import fnmatchimport osdef run():  for file in os.listdi…

正则表达式的新手经常将贪婪匹配和最小匹配理解错误.默认情况下,Perl 的正则表达式是“贪婪地”,也就是说它们将尽可能多地匹配字符. 下面的脚本打印出“matched defgabcdef”,因为它尽可能多地匹配模式,直至结尾的‘g’. $data = 'abcdefgabcdefg';$data =~ /abc(.+)g/i;print "matched "; 要改变匹配特点,只须简单地在量词(加号[+]或星号[*])后面加一个问号(?)即可.在上面的程序中把模式改为在‘+’之后包含…

        使用RegexKitLite正则表达式需要以下工作: 1.RegexKitLite官方网址(内含使用教程):http://regexkit.sourceforge.net/RegexKitLite 2.下载地址:http://downloads.sourceforge.net/regexkit/RegexKitLite-4.0.tar.bz2 3.将RegexKitLite.h和RegexKitLite.m引入到工程中. 4.引入"libicucore.dylib"框架…