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R语言︱大数据集下运行内存管理
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R语言︱大数据集下运行内存管理
在实操时出现以下的问题: Error: cannot allocate vector of size 2.9GB 大神指导(http://bbs.pinggu.org/thread-3682816-1-1.html) cannot allocate vector就是典型的数据太大读不了 方法有三 一.升级硬件 二.改进算法 三.修改操作系统分配给R的内存上限, memory.size(T)查看已分配内存 memory.size(F)查看已使用内存 memory.limit()查看内存上限 obj…
R处理大数据集
R会把所有的对象读存入虚拟内存中.对我们大多数用户来说,这种设计可以提高与R相互的速度,但是当分析大数据集时,这种设计会降低程序运行速度有时还会产生跟内存相关的错误. 内存限制主要取决于R的build版(32位还是64位),而在32位的windows下,取决于操作系统的版本.以cannot allocate vectoe of size开头的出错信息表示无法分配充足的连续内存,而以cannot allocate vector of length开头的出错信息表示超越了地址限制(address l…
R语言重要数据集分析研究——需要整理分析阐明理念
1.R语言重要数据集分析研究需要整理分析阐明理念? 上一节讲了R语言作图,本节来讲讲当你拿到一个数据集的时候如何下手分析,数据分析的第一步,探索性数据分析. 统计量,即统计学里面关注的数据集的几个指标,常用的如下:最小值,最大值,四分位数,均值,中位数,众数,方差,标准差,极差,偏度,峰度 先来解释一下各个量得含义,浅显就不说了,这里主要说一下不常见的 众数:出现次数最多的 方差:每个样本值与均值的差得平方和的平均数 标准差:又称均方差,是方差的二次方根,用来衡量一个数据集的集中性 极差:最大值…
R语言重要数据集分析研究——R语言数据集的字段含义
R语言数据集的字段含义 作者:马文敏 选择一种数据结构来储存数据 将数据输入或导入到这个数据结构中 数据集的概念 数据集通常是有数据结构的一个矩形数组,行表示规则,列表示变量. 不同的行业对数据集的行和列的叫法不同 统计学家称他们为观测和变量 数据库分析为记录和字段 示例分析者叫他们示例 R语言可以处理的数据类型有很多种包括数据型,字符型,逻辑性,原生性. 2.数据结构 R语拥有很多用于储存数据的对象类型,包括标量,向量,矩阵,数组,数据框和列表. 向量 向量数据必须要有相同的类型和模式的数据,…
R语言重要数据集分析研究—— 数据集本身的分析技巧
数据集本身的分析技巧 作者:王立敏 文章来源:网络 1.数据集 数据集,又称为资料集.数据集合或资料集合,是一种由数据所组成的集合. Data set(或dataset)是一个数据的集合,通常以表格形式出现.每一列代表一个特定变量.每一行都对应于某一成员的数据集的问题.它列出的价值观为每一个变量,如身高和体重的一个物体或价值的随机数.每个数值被称为数据资料.对应于行数,该数据集的数据可能包括一个或多个成员. 2.数据分析 数据结构 创建向量和矩阵 函数c(…
理解R语言gdistance包下的transition函数
library(raster)library(gdistance)r <- raster(nrows=3, ncols=4, xmn=0, xmx=7, ymn=0, ymx=6, crs="+proj=utm +units=m")r[] <- c(2, 2, 1, 1, 2, 2, 4, 4, 2, 1, 1, 4)par(mar=c(2,2,2,2))plot(r)text(r) 那么如果我们要求算四个方向上的平均值,注意是四个方向上…
R语言iris数据集的层次聚类
data=iris[,-5]dist.e=dist(data,method='euclidean')model1=hclust(dist.e,method='ward') #分3类result=cutree(model1,k=3)mds=cmdscale(dist.e,k=2,eig=T)x = mds$points[,1]y = mds$points[,2]library(ggplot2)p=ggplot(data.frame(x,y),aes(x,y))p+geom_point(size=3…
R语言实现数据集某一列的频数统计——with和table
with(priority.train, table(From.EMail)) 统计priority.train中From.EMail的频数…
R语言重要数据集分析研究——搞清数据的由来
搞清数据的由来 作者:李雪丽 资料来源:百度百科…
R语言之内存管理
转载于:http://blog.csdn.net/hubifeng/article/details/41113789 在处理大型数据过程中,R语言的内存管理就显得十分重要,以下介绍几种常用的处理方法. 1,设置软件的内存 [plain] view plain copy <span style="font-size:14px;">memory.size(2048) #设置内存大小 memory.size(NA) #查看当前设置下最大内存(?"Memory-limit…
大数据平台R语言web UI应用架构 设计与开发
1. 系统拓扑图 在日常业务分析中,R是非常常用的分析工具,而当数据量较大时,用R语言需要需用更多的时间来完成训练模型,spark作为大规模数据处理框架,采用内存计算,可以短时间内完成大量的数据的处理及计算模型,但缺点是不能图形展示,R语言的sparkly则提供了R语言和Spark的接口,实现了在数据量大的情况下,应用Spark的快速数据分析和处理能力结合R语言的图形化展示功能,方便业务分析,模型训练. 但是要想使多人同时共享R和Spark,还需要其他的相关组件,下图展示了所有相关的组件及应用:…
R语言和数据分析十大:购物篮分析
提到数据挖掘,我们的第一个反应是之前的啤酒和尿布的故事听说过,这个故事是一个典型的数据挖掘关联规则.篮分析的传统线性回归之间的主要差别的差别,对于离散数据的相关性分析: 常见的关联规则: 关联规则:牛奶=>卵子[支撑=2%,置信度=60%] 支持度:分析中的所有事务的2%同一时候购买了牛奶和鸡蛋,需设定域值,来限定规则的产生. 置信度:购买了牛奶的筒子有60%也购买了鸡蛋,需设定域值,来限定规则的产生. 最小支持度阈值和最小置信度阈值:由挖掘者或领域专家设定. 与关联分析相关的专业术语包含: 项…
R语言︱数据集分组、筛选(plit – apply – combine模式、dplyr、data.table)
R语言︱数据集分组 大型数据集通常是高度结构化的,结构使得我们可以按不同的方式分组,有时候我们需要关注单个组的数据片断,有时需要聚合不同组内的信息,并相互比较. 一.日期分组 1.关于时间的包都有很多很好的日期分组应用. 2.cut()函数 cut(x, n):将连续型变量x分割为有着n个水平的因子 cut(x, breaks, labels = NULL, include.lowest = FALSE, right = TRUE, dig.lab = 3, ordered_result = F…
全网最详细的大数据集群环境下如何正确安装并配置多个不同版本的Cloudera Hue(图文详解)
不多说,直接上干货! 为什么要写这么一篇博文呢? 是因为啊,对于Hue不同版本之间,其实,差异还是相对来说有点大的,具体,大家在使用的时候亲身体会就知道了,比如一些提示和界面. 全网最详细的大数据集群环境下多个不同版本的Cloudera Hue之间的界面对比(图文详解) 下载版本: cdh版本 http://archive-primary.cloudera.com/cdh5/cdh/5/ 假设,我已经安装了如下的一个Hue版本 CDH版本大数据集群下搭建Hue(hadoop-2.6.0-cdh5…
CDH版本大数据集群下搭建Hue(hadoop-2.6.0-cdh5.5.4.gz + hue-3.9.0-cdh5.5.4.tar.gz)(博主推荐)
不多说,直接上干货! 我的集群机器情况是 bigdatamaster(192.168.80.10).bigdataslave1(192.168.80.11)和bigdataslave2(192.168.80.12) 然后,安装目录是在/home/hadoop/app下. 官方建议在master机器上安装Hue,我这里也不例外.安装在bigdatamaster机器上. Hue版本:hue-3.9.0-cdh5.5.4 需要编译才能使用(联网) 说给大家的话:大家电脑的配置好的话,一定要安装clou…
Ubuntu14.04下Ambari安装搭建部署大数据集群(图文分五大步详解)(博主强烈推荐)
不多说,直接上干货! 写在前面的话 (1) 最近一段时间,因担任我团队实验室的大数据环境集群真实物理机器工作,至此,本人秉持负责.认真和细心的态度,先分别在虚拟机上模拟搭建ambari(基于CentOS6.5版本)和cloudermanager(基于CentOS6.5或Ubuntu14.04版本). (2) 大数据集群范围包括3节点和4节点.本人都尝试过. (3) 安装搭建包括离线和在线.本人都尝试过 (4) 版本包括自定义指定和官方最新版本搭建.本人都尝试过. (5) 大数据集群节点的增…
《R语言实战》读书笔记--第二章 创建数据集
2.1数据集的概念 变量的类型是不同的,比如标示符.日期变量.连续变量.名义变量.有序型变量等,记得数据挖掘导论中有专门的描述. R可以处理的数据类型包括了数值型.字符型.逻辑型.复数型(虚数).原生型(字节). 2.2数据结构 R拥有很多存储数据的对象类型,包括 标量.向量.矩阵.数组.数据框.列表.它们可以用下图表示: 因子是R中的名义型或者有序型变量,比较特殊. 2.2.1向量 标量是只有一个元素的向量,一般用来保存常量.其他没什么说的. seq函数: seq(, to = , by =…
机器学习十大算法总览(含Python3.X和R语言代码)
引言 一监督学习 二无监督学习 三强化学习 四通用机器学习算法列表 线性回归Linear Regression 逻辑回归Logistic Regression 决策树Decision Tree 支持向量机SVM Support Vector Machine 朴素贝叶斯Naive Bayes K近邻KNN K- Nearest Neighbors K均值K-Means K-means如何形成群类 随机森林Random Forest 降维算法Dimensionality Reduction Algo…
R语言实战(一)介绍、数据集与图形初阶
本文对应<R语言实战>前3章,因为里面大部分内容已经比较熟悉,所以在这里只是起一个索引的作用. 第1章 R语言介绍 获取帮助函数 help(), ? 查看函数帮助 example() 使用函数示例 vignette() 列出vignette文档 vignette("svmdoc") 打开对应文档 管理工作空间 getwd() 显示当前工作目录 setwd("mydirectory") 修改当前工作目录为mydirectory rm(objec…
R语言和大数据
#安装R语言R3.3版本会出现各种so不存在的问题,退回去到R3.1版本时候就顺利安装.在安装R环境之前,先安装好中文(如果没有的话图表中显示汉字成框框了)和tcl/tk包(少了这个没法安装sqldf)sudo yum install fonts-chinese tcl tcl-devel tclx tk tk-devel -y安装中文字体后重新加载 service xfs reload (不过在有台机器上总是失败,后来重启机器OK)sudo service xfs reload有些包会需要rg…
R语言数据集合并、数据增减、不等长合并
每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- 数据选取与简单操作: which 返回一个向量中指定元素的索引 which.max 返回最大元素的索引 which.min 返回最小元素的索引 sample 随机在向量中抽取元素 subset 根据条件选取元素 sort 升序排列元素 rev 反转所有元素 order 获取排序后的索引 table 返回频数表 cut 将数据分割为几部分 spl…
全网最详细的大数据集群环境下多个不同版本的Cloudera Hue之间的界面对比(图文详解)
不多说,直接上干货! 为什么要写这么一篇博文呢? 是因为啊,对于Hue不同版本之间,其实,差异还是相对来说有点大的,具体,大家在使用的时候亲身体会就知道了,比如一些提示和界面. 安装Hue后的一些功能的问题解决干货总结(博主推荐) 全网最详细的大数据集群环境下如何正确安装并配置多个不同版本的Cloudera Hue(图文详解) 都是安装在/opt/modules下 [kfk@bigdata-pro01 modules]$ pwd /opt/modules [kfk@bigdata-pro01 m…
【数据分析 R语言实战】学习笔记 第三章 数据预处理 (下)
3.3缺失值处理 R中缺失值以NA表示,判断数据是否存在缺失值的函数有两个,最基本的函数是is.na()它可以应用于向量.数据框等多种对象,返回逻辑值. > attach(data) The following objects are masked fromdata (pos = 3): city, price, salary > data$salary=replace(salary,salary>5,NA) > is.na(salary) [1] FALSEFALSE TRUE…
Windows7-32位系统下R语言链接mySQL数据库步骤
安装R和MySQL在此就不再多说了.网上有非常多教程能够找到.以下直接进入到odbc的安装流程. 1.下载安装mysql-connector-odbc-5.x.x-win32.msi 下载地址:http://dev.mysql.com/downloads/connector/odbc/可下载最新版本号 但在安装过程中遇到以下问题(经測试win10-64位版本号下安装mysql-connector-odbc-5.3.6-winx64.msi不会出现该问题): Error 1918. Error i…
R语言实现分层抽样(Stratified Sampling)以iris数据集为例
R语言实现分层抽样(Stratified Sampling)以iris数据集为例 1.观察数据集 head(iris) Sampling)以iris数据集为例"> 选取数据集中前6个数据,我们可以看出iris数据集一共有5个字段. dim(iris) Sampling)以iris数据集为例"> iris数据集一共有150条数据,5个字段 summary(iris) Sampling)以iris数据集为例"> 观察各个变量的内容,可以看出前四个变量(Se…
Ubuntu下安装R语言和开发环境
[简介]R是用于统计分析.绘图的语言和操作环境.R是属于GNU系统的一个自由.免费.源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具. [R语言的安装]官网:https://www.r-project.org/ 在Ubuntu上的安装一般都有两种方式: 1.直接到官网上下载安装包(tar.gz),然后依次安装即可. 2.在网速可以的情况下,利用在apt-get安装是一种更为方便的方式: 命令如下: sudo apt-get install r-base 接下来步骤完全自动完成! 如果安…
windows下R语言在终端的运行
在windows下可以有多种方式来运行R,R导论的这些章节给出一些详细的指导. 通常在环境变量离包含R的安装目录类似于R\R-3.1.2\bin\x64的情况下,就可以在CMD下运行R程序了 注意我这里是64bit环境,R.exe在R\R-3.1.2\bin下也存在,但是包含这个目录会导致调用R.exe失败,想要确定到底是哪一个,只要双击那个可执行程序,如果可以运行出现R语言的RPEL那就是那个的: 那个R\R-3.1.2\bin\x64目录下包含很多可执行程序 R与Rterm打开的都是Rter…
linux命令行下使用R语言绘图
系统:centos 6.4 64bit 环境安装参考:http://hi.baidu.com/solohac/item/4a18e78f1bef9b5825ebd99c 在R语言中可以使用png()等函数生成图片,例如: png("aa.png")可以生成图片. 但是如果你是通过shell远程连接到系统上,可能会碰到如下错误: 1 2 3 4 5 > png("aa.png") 错误于.External2(C_X11, paste("png::&qu…
R语言实战读书笔记(二)创建数据集
2.2.2 矩阵 matrix(vector,nrow,ncol,byrow,dimnames,char_vector_rownames,char_vector_colnames) 其中: byrow=TRUE/FALSE,表示按行填充还是按列填充,默认情况下是按列填充 2.2.4 数据框 1.attach,detach()和with() attach():将数据框加入搜索路径 detach():将数据框移除出搜索路径 with():赋值仅在括号内有效,如果想在括号外生效也可以,用<<- 2.…
R语言处理大规模数据集的编程要点
1.提高程序效率,保证执行速度 (1)尽量使用向量化运算 (2)尽量使用矩阵,必要时才使用数据框 (3)使用read.table时,尽量显式设定colClasses和nrows,设定comment.char="",把不需要的列设置为NULL (4)将外部数据导入矩阵时,使用scan函数 (5)删除临时对象和不再用的对象 (6)用ls.objects()列出工作区对象占用的内存大小 2.把数据存在外部 (1)ff包:将数据保存在硬盘,操作起来跟在内存中一样 (2)bigmemory包:支…