简单使用limma做差异分析 Posted: 五月 12, 2017  Under: Transcriptomics  By Kai  no Comments 首先需要说明的是,limma是一个非常全面的用于分析芯片以及RNA-Seq的差异分析,按照其文章所说: limma is an R/Bioconductor software package that provides an integrated solution for analysing data from gene expressi…

简单使用DESeq做差异分析 Posted: 五月 06, 2017  Under: Transcriptomics  By Kai  no Comments DESeq这个R包主要针对count data,其数据来源可以是RNA-Seq或者其他高通量测序数据.类似地,对于CHIP-Seq数据或者质谱肽段数据也是使用的. 由于DESeq是一个R包,因此使用它需要一点点R基础语法. 首先需要读入一个数据框,列代表每个sample,行代表每个gene database_all <- read.tab…

简单使用DESeq2/EdgeR做差异分析 Posted: 五月 07, 2017  Under: Transcriptomics  By Kai  no Comments DESeq2和EdgeR都可用于做基因差异表达分析,主要也是用于RNA-Seq数据,同样也可以处理类似的ChIP-Seq,shRNA以及质谱数据. 这两个都属于R包,其相同点在于都是对count data数据进行处理,都是基于负二项分布模型.因此会发现,用两者处理同一组数据,最后在相同阈值下筛选出的大部分基因都是一样的,但是…

php求和为s的两个数字(多复制上面写的代码,有利于检查错误)(由浅入深,先写简单算法,做题的话够用就行) 一.总结 1.多复制上面写的代码,有利于检查错误 2.一层循环就解决了,前后两个指针,和大了就后指针前移,和小了就前指针后移 3.由浅入深,先写简单算法,做题的话够用就行 4.php中的PHP_INT_MAX 二.php求和为s的两个数字 题目描述 输入一个递增排序的数组和一个数字S,在数组中查找两个数,是的他们的和正好是S,如果有多对数字的和等于S,输出两个数的乘积最小的. 输出描述:…

在做安卓UI的时候有时候需自定义具有动画效果的按钮或需要自定义一下actionbar~ 本节用一个简单的demo讲如何自定义具有动画效果的按钮,以及个性化的actionbar 下面是效果: 其中: △ 自定义button是由  3 个ImageView + animation动画构成 △ actionbar是自定义的效果,按钮按动也用到了动画 下面是整个工程的结构: 需要引用v7工程,因为继承了v7的ActionBarActivity 其中MyAnimation.java包含按钮动画的方法 其中…

既然标题是最简单的,那么很多东西就不需要我们自己做了,使用的是NGUI的示例,只针对初学者,接下来让我们来做一个最简单游戏设置里的声音控制. 1.导入NGUI: 2.找到NGUI的Menu示例Demo,文件夹为NGUI\Examples\Scenes 打开Example 3 - Menu场景 3.在Hierarchy视图中找到Option - Voice游戏对象[灰色的active没有启用的对象] 4.复制改游戏对象,并在你的项目的Hierarchy视图中粘贴到合适的位置,并将active启用(…

基于Redis封装一个简单的Python缓存模块 0. Docker Redis安装 参考: Get Docker CE for CentOS Docker 安装 Redis 安装Docker时错误sudo yum-config-manager \ --add-repo \ https://download.docker.com/linux/centos/docker-ce.repo 因为配置没改,当时只改了yum的设置,再改次yum-config-manager的 vim /usr/bin/y…

做一个简单的QML待做事项列表,能够动态添加和删除和编辑数据 GitHub:八至 作者:狐狸家的鱼 本文链接:QML学习笔记(五)— 做一个待做事项列表 主要用到QML:ListView 效果 全部代码 TodoList.qml /* date:20181221 author:狐狸家的鱼 */ import QtQuick 2.7 import QtQuick.Controls 2.2 import QtQuick.Layouts 1.3 ColumnLayout{ Frame{ Layout.…

工单里面可能有0个告警,一个或多个告警,当工单中没有告警的时候也需要将工单显示出来,所以就需要使用工单和告警的做链接查询,下面是具体实例 表: CREATE TABLE `alarm` ( `id` bigint() NOT NULL DEFAULT ', `title` varchar() DEFAULT NULL, `level` ) DEFAULT NULL, `customer_id` bigint() DEFAULT NULL, `work_sheet_id` bigint() DEF…

现在就是做ssm框架下的sql语句,主要是select语句,sql语句没什么难的,孰能生巧,趁此机会,把自己的sql基础打扎实,也是一种实习的经验. 1.在子查询中字段的类型不相容怎么办? cast函数转换,但是这样会使索引失效(使用函数就会失效),所以设计表时尽量避免sql语句中类型转换 2.在join查询时,出现两个相同的字段名,报错ambiguous 在<sql>中加入表名前缀,只需要在有歧义的字段名前 给表命名别名之后就应该使用别名 feign.Param和org.apache.iba…