1.列表包括数据库名称.表型.是否能下载到基因型(genotype).是否能下载到GWAS结果文件(P值.效应值.SNP位点).目前收集到的有如下: 参考到这些数据库的文献:Genome-wide association study identifies 74 loci associated with educational attainment 2.The Japanese Genotype-phenotype Archive (JGA)  :该数据拥有个体水平的基因型和表型数据,需要申请,已

GWAS Catalog The NHGRI-EBI Catalog of published genome-wide association studies EBI负责维护的一个收集已发表的GWAS研究的数据库 Catalog stats Last data release on 2019-09-24 4220 publications 107486 SNPs 157336 associations Genome assembly GRCh38.p12 dbSNP Build 151 Ense

http://www.educity.cn/jiaocheng/j9415.html JSP程序员常用的技术   第1章 JSP及其相关技术导航 [本章专家知识导学] JSP是一种编程语言,也是一种动态网页开发技术,要用它完成实践项目工程的开发,需要掌握的知识点比较多.为了让读者对JSP这一开发技术的知识体系有个全面.清晰的了解,为后续的学习打下基础,本章将首先讲述作为一名JSP程序员应该掌握的技术知识体系和本书的内容安排.接着,对JSP技术进行了简要的介绍,使读者了解JSP技术的功能和优势.读

欢迎关注微信公众号"bio生物信息" GeneATLAS的数据全部来自 UK Biobank 的452,264个英国白人样本. 总共囊括的表型有778个,位点有三千万个. 优点 网站所有关联分析的summary数据都是可以下载的. 而且提供了所有表型的原始基因型数据的曼哈顿图.imputation的曼哈段图.Q-Q Plot 可以说是相当贴心了. 缺点 不能下载原始基因型数据. 样本是欧洲群体,可能某些结果在其他群体有差异. 这个网站可以下载什么 1. 下载表型数据 比如搜索肥胖表型,

IP地址数据库  微信号:qqzeng-ip [全球旗舰版][国内精华版][国外拓展版][英文版][掩码版]     http://qqzeng.com 中国大陆:三大基础运营商 中国电信中国联通中国移动 除 3 家基础电信企业为网站提供互联网接入服务之外,另有 1479 家 IDC.ISP 等接入服务商为网站也提供互联网接入服务 铁通教育网鹏博士 阿里云腾讯云青云QingCloud百度腾讯广电网 新国信世纪互联东方有线科技网歌华有线天威视讯方正宽带有线通北龙中网华数阿里巴巴腾讯云京宽网络中电华

技术渣,大家将就着看 首先我们需要一个xml数据保存到数据库,这里我从QQ下面找到一个loclist.xml文件 <CountryRegion Name="中国" Code="1"> <State Name="北京" Code="11"> <City Name="东城" Code="1" /> <City Name="西城"

想系统的学习生信数据库可以先看一下北大的公开课,有一章专门讲的数据库与软件: -生物信息学:导论与方法 北大\ 生物信息数据库及软件资源 一个优秀的生信开发者能够解决如下问题: 如何鉴定一个重要的且没有被解决的生物学问题? 如何将该问题转化为一个可计算的问题? 如何提出一个解决此问题的算法? 如何实现该算法? 如何评估算法? 生信工具使用者需要解决如下问题: 每个方法解决的是哪个生物学问题? 该方法有哪些基本的假设? 每个参数是什么意思,都是用来干什么的? 准确度评估,sensitivity a

在高房价大幅度下降以后,银行会认为你在贷款的时候的抵押物,已经不值钱了,比如已经下跌百分之五十了,那么,银行就会给贷款者一个通知——你的抵押物--房子,已经不值钱了,所以说,你必须立刻缴纳这一部分贬值的钱.如果你交不出来,那么,对不起,你的房子就会被没收,归银行:与此同时,你还必须每个月照常向银行缴纳剩下的余款.你说你房子不要了,银行也不会理你.你说你破产了,银行还是不理你.你就是逃到天涯海角,银行还是会找到你,要你赔款.因为你欠款,你将不能坐火车,不能坐飞机,想逃?没门!那个时候,炒房者可能是

数据预处理(DNA genotyping.Quality control.Imputation) QC的工作可以做PLINK上完成Imputation的工作用IMPUTE2完成 2. 表型数据统计分析 逻辑回归(表型数据为二元) 线性回归(表型数据为连续性变量) 表型数据正态分析(如果不是正态分布,需转换处理为正态分布) 表型数据均值.中值.最大值.最小值 影响因子对表型的影响分析 3.画曼哈顿图(GWAS)和QQ plot图 (一).准备plink文件 (1).准备PED文件 PED文件有六列

我有一张表w1000,里面有1000万条数据,这张表结构如下:CREATE TABLE `w1000` ( `id` varchar(36) NOT NULL, `name` varchar(10) DEFAULT NULL, `age` int(3) DEFAULT NULL, `money` double(8,2) DEFAULT NULL, `address` varchar(100) DEFAULT NULL, `create_date` datetime(3) DEFAULT NULL

原文:https://www.jianshu.com/p/d0bbdf1974bd 采用方案: 使用spring 的 aop 技术切到自定义注解上,针对不同注解标志进行参数解析,记录日志 缺点是要针对每个不同的注解标志进行分别取注解标志,获取参数进行日志记录输出 1. 需要引用的依赖 <!--spring切面aop依赖--> <dependency> <groupId>org.springframework.boot</groupId> <artifa

存储使用mysql,增量更新东方头条全站新闻的标题 新闻简介 发布时间 新闻的每一页的内容 以及新闻内的所有图片.项目文件结构. 这是run.py的内容 1 #coding=utf-8 2 from scrapy import cmdline 3 import redis,time,threading 4 from multiprocessing import Process 5 #import scrapy.log 6 7 #cmdline.execute("scrapy crawl baox

一:需求:将从数据库查处来的数据,生成word文档,并有固定的格式.(dom4j的jar包+poi的jar包) 二:解决:(1)先建立固定格式的word文档(2007版本以上),另存成为xml文件,作为模板.(修改xml节点,添加属性,用于标示要填固定数据的节点) (2)dom4j解析模板xml文件,将文件读入内存,并把数据库数据写入内存的xml模型中 (3)利用poi将内存中的含有数据库内容的xml模型转换成word内存模型,利用输出流输出word文档 三:DEMO [1]模板的word文档

1.安装MySQL 直接去下载即可,如果是windows建可以下载msi,一路next即可.我已经安装过了,这里就不再演示了. 最后使用Navicat连接测试一下,我这里是没有问题的 2.SQLAlchemy的介绍和基本使用 sqlalchemy是一款orm框架 注意:SQLAlchemy本身是无法处理数据库的,必须依赖于第三方插件,比方说pymysql,cx_Oracle等等 SQLAlchemy等于是一种更高层的封装,里面封装了许多dialect(相当于是字典),定义了一些组合,比方说: 可

NCBI(National Center for Biotechnology Information,美国国家生物技术信息中心)除了维护GenBank核酸序列数据库外,还提供数据分析和检索资源.NCBI资源包括Entrez.Entrez编程组件.MyNCBI.PubMed.PudMed Central.PubReader.Gene.the NCBI Taxonomy Browser.BLAST.Pimer-Blast.COBALT.RefSeq.UniGene.HomoloGene.ProtES

软件界有只猫,不用我说,各位看官肯定知道是哪只,那就是大名鼎鼎的Tomcat,现在又来了一只猫,据说是位东方萌妹子,暂且认作Tom猫的表妹,本来叫OpencloudDB,后又改名为Mycat,或许Cat更亲切?那现在就来认识下这只小猫吧. 数据库的核心地位就不说了,但现在的问题是,各种RDB,各种NoSQL交织,又是分布式.多租户的场景下,心里有没有十足的把握能稳住如此局面呢.有需求,就有市场!自然,相应的技术也应运而生,Mycat作为一款DB中间件,可以作为应用和DB间的“桥梁”,让后台DB的

  本人5年开发经验.18年年底开始跑路找工作,在互联网寒冬下成功拿到阿里巴巴.今日头条.东方网等公司offer,岗位是Java后端开发,因为发展原因最终选择去了东方网,入职一年时间了,也成为了面试官,之前面试了很多家公司,感觉大部分公司考察的点都差不多,趁空闲时间,将自己的心得记下来,希望能给正在找或者准备找工作的朋友提供一点帮助.   下面提的问题可以看下你自己是否能回答出来,是否做好准备了,当然面试题准备是一方面,你本身的技能掌握是一方面,本身技能不过硬也会被刷下来,下面的图是进阶体系图可

欢迎来到"bio生物信息"的世界 6天前,BMC Genomics 推了一篇文献"Population history and genetic adaptation of the Fulani nomads: inferences from genome-wide data and the lactase persistence trait". 要不是这个标题起的太大,又是Population history,又是 genetic adaptation ,我可能都不

相关文章: A Unified Framework for Association Analysis with Multiple Related Phenotypes 太重要了,不得不单独拿出来分析一下.本review高度总结了GWAS这10年的成绩.以及现在的局限性.每个搞统计遗传的都必须要好好看看. 第一篇GWAS是什么时候?谁提出的?The first successful GWAS published in 2002 studied myocardial infarction. Ozak

目录 1.常用sqlplus命令 1.1 HELP命令 1.2 describe命令 1.3 SPOOL命令 1.4 其他常用命令 1.4.1 define命令 1.4.2 show命令 1.4.3 edit命令 1.4.4 save命令 1.4.5 get命令 1.4.6 start和@命令 2.格式化查询结果 2.1 COLUMN命令 2.1.1 FORMAT命令 2.1.2 HEADING选项 2.1.3 NULL选项 2.1.4 ON|OFF选项 2.1.5 WRAPPED/WORD_W