命令行: ~/tools/sratoolkit/sratoolkit.2.3.2-5-centos_linux64/bin/fastq-dump --split-spot --gzip rhesus_b_heart.sra 报错信息: 2013-09-11T05:02:11 fastq-dump.2.3.2 err: name not found while resolving tree within virtual file system module - failed to open 'rh

一 . 虚拟环境的安装 如果我们在进行多个django项目的话,只用一个物理环境的话,那么会影响效率,这时候我们局可以应用虚拟环境了 virtualenv #指定清华源下载pip的包 pip3 install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple virtualenv #升级pip工具 pip3 install --upgrade pip 1.安装virtualenv pip3 install virtualenv 2.创建目录 mkdir My

这种文章挺难写的,一是JVM参数巨多,二是内容枯燥乏味,但是想理解JVM调优又是没法避开的环节,本文主要用来总结梳理便于以后翻阅,主要围绕四个大的方面展开,分别是JVM调优参数.JVM调优方法(流程).JVM调优工具.JVM调优案例,调优案例目前正在分析,会在将来补上. 垃圾回收有关参数 参数部分,这儿只是做一个总结,更详细更新的内容请参考Oracle官网:JVM的命令行参数参考 处理器组合参数 关于JVM垃圾处理器区别,参考:JVM调优之垃圾定位.垃圾回收算法.垃圾处理器对比 -XX:+Use

GC和GC Tuning GC的基础知识 1.什么是垃圾 C语言申请内存:malloc free C++: new delete c/C++ 手动回收内存 Java: new ? 自动内存回收,编程上简单,系统不容易出错,手动释放内存,容易出两种类型的问题: 忘记回收 多次回收 没有任何引用指向的一个对象或者多个对象(循环引用) 2.如何定位垃圾 引用计数(ReferenceCount) 根可达算法(RootSearching) 3.常见的垃圾回收算法 标记清除(mark sweep) - 位置

GC和GC Tuning GC的基础知识 什么是垃圾 C语言申请内存:malloc free C++: new delete c/C++ 手动回收内存 Java: new ? 自动内存回收,编程上简单,系统不容易出错,手动释放内存,容易出两种类型的问题: 忘记回收 多次回收 没有任何引用指向的一个对象或者多个对象(循环引用) 如何定位垃圾 引用计数(ReferenceCount) 根可达算法(RootSearching) 常见的垃圾回收算法 标记清除(mark sweep) - 位置不连续 产生

解决JVM运行中的问题 一个案例理解常用工具 测试代码: /** * 从数据库中读取信用数据,套用模型,并把结果进行记录和传输 */ public class T15_FullGC_Problem01 { private static class CardInfo { BigDecimal price = new BigDecimal(0.0); String name = "张三"; int age = 5; Date birthdate = new Date(); public v

dump 功能说明:备份文件系统.语 法:dump [-cnu][-0123456789][-b <区块大小>][-B <区块数目>][-d <密度>][-f <设备名称>][-h <层级>][-s <磁带长度>][-T <日期>][目录或文件系统] 或 dump [-wW]补充说明:dump为备份工具程序,可将目录或整个文件系统备份至指定的设备,或备份成一个大文件. 参 数: -0123456789  备份的层级.  -

前几天,一台Oracle数据库(Oracle Database 10g Release 10.2.0.4.0 - 64bit Production)监控出现"PMON failed to acquire latch, see PMON dump"错误,连接数据库出现短暂异常,告警日志中具体错误如下所示: Tue Dec 20 09:13:16 2016 PMON failed to acquire latch, see PMON dump Tue Dec 20 09:14:16 201

原文地址:http://gao-xianglong.iteye.com/blog/2173140?utm_source=tuicool&utm_medium=referral 前言 生产环境中,尤其是吃大内存的JVM,一旦出现内存泄露等问题是非常容易引发OutofMemory的,如果没有一个好的工具提供给开发人员定位问题和分析问题,那么这将会是一场噩梦.目前JDK其实自带有一些内存泄露分析工具专门用于帮助开发人员定位内存泄露等问题,但是这些工具往往并不是能够满足一些现状,这里笔者所指的现状更多是

什么是Java Core和Heap Dump Java程序运行时,有时会产生Java Core及Heap Dump文件,它一般发生于Java程序遇到致命问题的情况下. 发生致命问题后,Java进程有时可以继续运行,但有时会挂掉. 为了能够保留Java应用发生致命错误前的运行状态,JVM在死掉前产生两个文件,分别为JavaCore及HeapDump文件. JavaCore和Heap Dump的区别 l  JavaCore是关于CPU的 JavaCore文件主要保存的是Java应用各线程在某一时刻的

title: sublime text 乱码生成.dump问题的解决方法 tags: sublime text,sublime text 3,.dump,乱码 grammar_cjkRuby: true --- 因为电脑蓝屏,没有及时保存.造成sublime text的一些文件产生乱码问题.我网上找了好久,都没有很好的解决. 后来自己摸索出来了一种简单的方法. 先说下本质问题.sublime text出现乱码和产生.dump文件是因为编码问题. 解决方法 1.选择乱码的文件,用notepad++

前言 在产品的实际应用环境中,如果我们的程序在客户那里出现了问题,例如程序异常了,而这个时候的现象又不能还原或者很难还原重现,那么只有使用dump文件来保存程序的当前运行信息,例如调用堆栈等,同时使用符号文件来定位问题了;这里主要讲解使用dbghelp库来生成输出dump文件,同时使用符号文件和windbg来分析问题.样例代码 1 #include "stdafx.h" 2 #include <Windows.h> 3 #include <iostream> 4

一.WinDbg是什么?它能做什么? WinDbg是在windows平台下,强大的用户态和内核态调试工具.它能够通过dmp文件轻松的定位到问题根源,可用于分析蓝屏.程序崩溃(IE崩溃)原因,是我们日常工作中必不可少的一个有力工具,学会使用它,将有效提升我们的问题解决效率和准确率. 二.WinDbg下载: http://www.windbg.org/ 三.设置符号表: 符号表是WinDbg关键的"数据库",如果没有它,WinDbg基本上就是个废物,无法分析出更多问题原因.所以使用WinD

Dump 分析模式之 INCORRECT STACK TRACE dump 分析模式之 INCORRECT STACK TRACE 翻译自 MDA-Anthology Page288  初学者常犯的错误是认为 WinDbg 的 !analyze 和 kv 给出的信息是准确的.  WinDbg 只是一个工具, 有时候会缺少一些必要的信息来得到正确的栈信息, 因此我们需要自己明辨正确的与错误的栈信息. 我称之为 Incorrect Stack Trace, 它通常有以下特征: WinDbg给出警告:

前言 在开始这篇文章之前我们先来讲讲如何从高度优化的Release版的Dump中找到正确的异常上下文地址,并手动恢复异常发生的第一现场. 1. 什么是异常上下文 简单来说,在windows体系的操作系统里面,每个线程都有自己的线程上下文来保存需要的信息,其中包括当前寄存器的值.我们这里需要找到的异常上下文就是当异常发生的时候,异常分发器帮我们保存的当前寄存器的值(也叫寄存器上下文),利用这些信息结合汇编代码的分析,我们就可以进一步找到发生异常的原因.关于寄存器上下文结构体的定义我们可以在winn

前言 这篇文章我们一起来分析一个从Windows Phone Dev Center上下载下来的dump file.首先按照我上一篇的步骤设置好我们的Windbg,并按住Ctrl +D打开dumpfile.可以看到下面的界面: 分析一个dump file可以分解为4个步骤,第一步是信息收集,第二步是定位异常上下文,第三步分析和推理出现问题的原因,第四步分析和定位我们的源代码并进行修复和验证. 信息收集 我们可以使用一些命令浏览一下这个dump file对应的系统版本和一些模块的信息辅助我们后面的分

Windbg是windows平台上强大的调试器,它相对于其他常见的IDE集成的调试器有几个重要的优势, Windbg可以做内核态调试 Windbg可以脱离源代码进行调试 Windbg可以用来分析dump文件 Windbg支持丰富的调试扩展 以下是一些windbg安装和使用相关的文档, Installing and Configuring WinDbg (Windows Debug Tools)‏ Windbg Tutorials Debugging Using Windbg (msdn) Win

1.前言 一直在从事linux下后台开发,经常与core文件打交道.还记得刚开始从事linux下开发时,程序突然崩溃了,也没有任何日志.我不知所措,同事叫我看看core,我却问什么是core,怎么看.同事鄙视的眼神,我依然在目.后来学会了从core文件中分析原因,通过gdb看出程序挂再哪里,分析前后的变量,找出问题的原因.当时就觉得很神奇,core文件是怎么产生的呢?难道系统会自动产生,可是我在自己的linux系统上面写个非法程序测试,并没有产生core问题?这又是怎么回事呢?今天在ngnix的

core dump又叫核心转储, 当程序运行过程中发生异常, 程序异常退出时, 由操作系统把程序当前的内存状况存储在一个core文件中, 叫core dump. (linux中如果内存越界会收到SIGSEGV信号,然后就会core dump) 在程序运行的过程中,有的时候我们会遇到Segment fault(段错误)这样的错误.这种看起来比较困难,因为没有任何的栈.trace信息输出.该种类型的错误往往与指针操作相关.往往可以通过这样的方式进行定位. 一 造成segment fault,产生co

偶然翻了一下手机日历,原来今天是夏至啊,时间过的真快.ISCC的比赛已经持续了2个多月了,我也跟着比赛的那些题目学了2个月.......虽然过程很辛苦,但感觉还是很幸运的,能在大三的时候遇到ISCC,不管怎样,对我来说都会是一个很好的锻炼机会. 在做综合关的逆向破解的题目,遇到了很多蛋疼的问题,磕磕碰碰把<加密与解密>看完了.还是老习惯,把这1个多星期以后学到的,想到的做一个总结,希望能有一个思想上的提高,也希望能对其他人有一个借鉴的效果吧.这里想起lenus大神的一句话: Hacker的精神

什么是core dump   linux下用core和gdb查询出现"段错误"的地方 http://blog.chinaunix.net/uid-26833883-id-3193279.html 有些时候我们在一段C代码的时候,由于对一个非法内存进行了操作,在程序运行的过程中,出现了"段错误". 呵呵,这种问题我想很多人会经常遇到.遇到这种问题是非常无语的,只是提示了"段错误",接着什么都没 有,如果我们一味的去看代码找太疼苦了,因为我们都相信自