把gff转化为bed格式

bedtools神器 | gtf转bed | bed文件运算

我们生信技能书有一篇介绍bedtools的文章,可以在微信里搜着看下,非常有用. http://bedtools.readthedocs.io/en/latest/ gtf转bed用Linux命令完全可以实现,因为gtf每一行比较规律,不像fasta和fastq. cat gffcmp.combined.gtf | grep -v exon | cut -f1,4,5,9 | cut -f1 -d";" | awk '{print $1, $2, $3, $5}' | sed -e '

安装.cer证书并将证书从.cer格式转化为.pem格式

## 安装.cer证书并将证书从.cer格式转化为.pem格式 ### 安装.cer证书到本地打开*运行*窗口输入MMC.exe, 单击*确定* 在打开的控制台1的窗口中. 选择*文件*, 选择*添加或删除管理单元* 在**可用的管理单元**中, 选择*证书* 单击*添加* 现在, 你的所选管理单元窗口中将会出现*证书* 单击*确定* 选择*Computer account* 单击*下一步* 选择*Local computer: (the computer this consoled is

将搜狗词库.scel格式转化为.txt格式

由于项目中要用到词库,而下载的搜狗词库是.scel格式,所以就用python脚本将搜狗词库.scel格式文件转化为.txt格式文件. #!/bin/python # -*- coding: utf-8 -*- import struct import sys import binascii import pdb try: reload(sys) sys.setdefaultencoding('utf-8') except: pass # 搜狗的scel词库就是保存的文本的unicode编码,每两

R语言︱用excel VBA把xlsx批量转化为csv格式

笔者寄语:批量读取目前看到有以下几种方法:xlsx包.RODBC包.批量转化成csv后读入.本章来自博客:http://www.cnblogs.com/weibaar/p/4506144.html 在上面的尝试已经发现,xlsx本身就是这个复杂问题的最根本原因.与之相反,R对csv等文本格式支持的很好,而且有fread这个神器,要处理一定量级的数据,还是得把xlsx转化为csv格式. 以此为思路,在参考了两个资料后,我成功改写了一段VBA,可以选中需要的xlsx,然后在其目录下新建csv文件夹,

RGB格式图像转化为HSV格式

注:在阴影检测算法中经常需要将RGB格式的图像转化为HSV格式,对于阴影区域而言,它的色度和饱和度相对于原图像而言变化不大,主要是亮度信息变化较大,,将RGB格式转化为HSV格式,就可以得到H.S.V分量,从而得到色度.饱和度.亮度得值: 转换程序: void convert_ImageRGBtoHSV(const Mat& imageRGB, Mat &imageHSV){ float fR, fG, fB; float fH, fS, fV; const float FLOAT_TO_

TensorFlow 自定义模型导出：将 .ckpt 格式转化为 .pb 格式

本文承接上文 TensorFlow-slim 训练 CNN 分类模型(续),阐述通过 tf.contrib.slim 的函数 slim.learning.train 训练的模型,怎么通过人为的加入数据入口(即占位符)来克服无法用于图像推断的问题.要解决这个问题,最简单和最省时的方法是模仿.我们模仿的代码是 TensorFlow 实现的目标检测 API 中的文件 exporter.py,该文件的目的正是要将 TensorFlow-slim 训练的目标检测模型由 .ckpt 格式转化为.pb 格式,

linux下转换windows文件格式为unix sed -i 's/\r//' <filename> 转化为unix格式

sed -i 's/\r//' <filename> 转化为unix格式

腾讯下载的视频qlv格式转化为MP4格式

最近在看腾讯视频的时候发现下载下来的视频格式都是qlv格式,且不能用其他播放器播放,甚是恼怒,网上找了很多方法都很繁琐,于是自己写了一个小程序来处理这个问题.把下载下来的qlv格式转化为MP4格式首先还是按照网上所说的,找到这些文件所在位置: 首先将需要转换mp4格式的视频下载,要下载完成才能进行转换. 点击设置,将文件所在位置复制将复制内容粘贴到我的电脑,如图所示位置,点击回车[Enter]键,打开后我们找到下载文件, (因为腾讯下载内容一般都为隐藏,所以需要将文件找到) 我们打

怎么将txt文件转化为html格式的文件？--极为丑陋的方式

# -*- coding: utf-8 -*- #python 27 #xiaodeng #怎么将txt文件转化为html格式的文件?--极为丑陋的方式 import os #找出所有的txt格式的文件 def getAllTxtFilename(path): '找出所有的txt格式的文件,未对子文件夹进行查找' #初始化一个空list TxtFileNames=[] for dirpath,dirnames,filenames in os.walk(path): ''' #os.walk(pa

获取一个表单字段中多条数据并转化为json格式

如图需要获取下面两个li标签里面的数据,然后传给后台:而后台接收的数据格式是json的,所以需要把两个li里面的信息转化为以下格式的. {recieverName:小红,recieverPhone:12341234,recieverAddress:中国湖南},{recieverName:小明,recieverPhone:12345678,recieverAddress:中国上海} 代码如下: var recieverArr = []; //全局变量 var recieverMsg = {}; /

LINQ查询返回DataTable类型[轉]與将DataTable序列化为Json格式【轉】

(原文地址:http://xuzhihong1987.blog.163.com/blog/static/26731587201101853740294/) LINQ查询返回DataTable类型在使用LINQ查询的时候,一般我们会返回List<T>或IList<T>类型,如下所示: 例1: public List<TSample> GetList() { using (BPDataContext db = newBPDataContext(TCTC_Connectio

$.each遍历json对象(java将对象转化为json格式以及将json解析为普通对象)

查看一个简单的jQuery的例子来遍历一个JavaScript数组对象. var json = [ {"id":"1","tagName":"apple"}, {"id":"2","tagName":"orange"}, {"id":"3","tagName":"banana&q

将网址url中的参数转化为JSON格式的两种方法

在我们进入主题前,我先先看下获取网址URL的方法: window.location.href // 设置或获取整个URL为字符串 window.location.hash // 设置或获取href属性中在井号#后面的部分参数 window.location.search // 设置或获取href属性中跟在问号?后面,井号#前面的部分参数例如我们这里有一个url,例如:http://127.0.0.1:8080/html/urltojson.html?id=1&name=good#&pri

js把时间转化为 ‘2019-07-01’ 格式

将new Date()数据转化为‘2019-07-01’格式 //时间 function formatDate(date) { var y = date.getFullYear(); ; m = m < ? ' + m : m; var d = date.getDate(); d = d < ? (' + d) : d; return y + '-' + m + '-' + d; }; var nowTime = new Date(); var ss = formatDate(nowTime

把数据转化为JSON格式用ajax进行前后端交互

接着在https://www.cnblogs.com/dong973711/p/10907733.html的基础上做验证. 从前端提交数据前端页面,submit.html <!DOCTYPE html> <html> <head> <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8"> <title>用AJAX以JSON方式提

form表单序列化为json格式数据

在web开发过程中,经常遇到将form序列化不能格式的字符串提交到后台,下面就介绍怎样将form表单序列化为json字符串. 首先,是扩展的jquery序列化插件,依赖jquery.经测试,这段代码可以放在$(funciton(){})中,也可以放在外面,都可以实现效果. $.fn.serializeObject = function() { var o = {}; var a = this.serializeArray(); $.each(a, function() { if (o[this.

将网址url中的参数转化为JSON格式

网上方法很多,各种奇技淫巧,这里贴上一种较为正常的思路. 主要利用split对获取的字符串不断进行分割,最后获得所需要的格式. 代码如下 <!DOCTYPE html> <html lang="en"> <head> <meta charset="UTF-8"> <title>将url转化为json数据</title> </head> <script> function

DGN格式转化为shp格式【转】

其实本来,我就是需要把一个autocad的dwg/dgn格式的东西导入到google earth里面:但是首先我对dwg/dgn格式的东西根本就不熟:其次我拿到的dwg/dgn格式文件是用的HK80 grid coordinate(香港80网格坐标系统):而google earth中用的是WGS84全球经纬度坐标系统.于是就有了上述题目中的流程. 1.dwg格式导入Arcgis 其实本来呢,我是想把dwg/dgn格式存成图片格式(tiff)的,然后用envi或者erdas在google eart

DWG/DGN格式导入Arcgis；转化为shp格式；更改地理坐标；导入Google Earth【转】

其实本来,我就是需要把一个autocad的dwg/dgn格式的东西导入到google earth里面:但是首先我对dwg/dgn格式的东西根本就不熟:其次我拿到的dwg/dgn格式文件是用的HK80 grid coordinate(香港80网格坐标系统):而google earth中用的是WGS84全球经纬度坐标系统.于是就有了上述题目中的流程. 1.dwg格式导入Arcgis 其实本来呢,我是想把dwg/dgn格式存成图片格式(tiff)的,然后用envi或者erdas在google

快速将对象转化为JSON格式

1.导入阿里巴巴fastjson包.  <dependency> <groupId>com.alibaba</groupId> <artifactId>fastjson</artifactId> <version>1.1.24</version> </dependency> 2.写一个公共的Action类,调用jar包中的toJSONStri

Json格式转化为string格式

今天在学习Jsonp的时候,想通过服务端返回一段json数据,因为使用的服务端是NodeJs,那么就需要在js文件中实现返回json.(这里不懂的同学,可以先了解一下NodeJs的基础概念,在这里,我想大家推荐一个Nodejs视频 http://www.icoolxue.com/album/show/89). 首先,我们有这样一个json格式 } 如果我们直接把上面这个”json对象“返回给客户端,那么客户端都不知道怎么接受(至于为什么客户端接受不了,可以查询一下html相关的文档),所以这个

把gff转化为bed格式

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