就是指唯一比对的reads 现在人们已经开始避免使用unique mapped reads这个概念了,而转向使用mapq值来保留高质量的比对结果.因为mapq值反应了一组比对结果发生的可能性,MapQ = -10 log10(P), 比如结果为10,那就是1/10的概率会出现这个比对结果,如果我们认为0.05%是一个小概率的话,那个mapq值为15就可以用于筛选了, 如果认为0.01%是个小概率的话,mapq值为20就可以用于筛选了.但是人们往往从30这个值开始试起(1/1000的概率),如果它

说明:思路用的很新奇,也对COUNTIF有了更深一步的了解,但是,对于百行数据运算速度特别低,不适合数据多的使用 当面对一堆数据,我们要提取一列的唯一值的时候,如果单纯用人为一个个判断,显然是不科学的,那么如何用index函数提取唯一值呢   工具/原料   EXCEL2007以及以上版本 方法/步骤     新建一个空白的EXCEL工作表,而后打开   在A列输入人名,人名有重复,要求将唯一值提取到B列   首先我们在B2单元格输入公式=INDEX(A$1:A$99,MATCH(0,COUNT

之前讲过预测植物miRNA的一款软件miR-PREFER, 今天在介绍一款软件miRDeep-p2, 也叫miRDP2 安装 在此之前,应安装一下软件 Bowite, Bowtie2, Vienna (RNA二级结构预测软件大礼包) 安装以上软件以后,在mirdp2下载最新版的miRDP2,以及ncRNA_rfam.tar.g 1 tar -xf miRDP2-v1.1.4.tar 2mv 1.1.4 miRDP2-v1.1.4 在TestData下载测试数据集--TestData.tar.gz

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shell脚本第一行写明解释器的路径: #!/bin/bash运行脚本两种方式:使用bash命令运行shell文件,或授予脚本文件执行权限,可直接执行文件shell启动时,一开始执行一组命令来定义提问文本.颜色等设置,命令存放在~/.bashrc中登录shell放在~/.bash_profileshell历史记录文件~/.bash_historybash中每个命令或命令序列通过使用分号或换行符来分隔 echo用于终端打印printf 用于终端打印env 查看所有与终端相关的环境变量cat /pr

如果希望 PowerCenter 从源选择唯一值,您可以使用"选择相异"选项.例如,您可以使用此功能从列出总销售额的表中提取唯一客户标识.使用"选择相异"过滤器可以较早地过滤掉不必要的数据,这有助于提高性能. 默认情况下,Designer 生成 SELECT 语句.如果选择"选择相异",源限定符转换将在默认 SQL 查询中包括此设置.          例如,启用"选择相异"选项.Designer 将把 SELECT DIST

Numpy支持大量的维度数组和矩阵运算,对数组运算提供了大量的数学函数库! Numpy比Python列表更具优势,其中一个优势便是速度.在对大型数组执行操作时,Numpy的速度比Python列表的速度快了好几百.因为Numpy数组本身能节省内存,并且Numpy在执行算术.统计和线性代数运算时采用了优化算法. Numpy的另一个强大功能是具有可以表示向量和矩阵的多维数组数据结构.Numpy对矩阵运算进行了优化,使我们能够高效地执行线性代数运算,使其非常适合解决机器学习问题. 与Python列表相比

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折腾这么多都是白瞎,STAR就有输出没有别对上的pair-end reads的功能 参见:How To Filter Mapped Reads With Samtools I had the same issue but with Paired End Reads, and I solved using samtools and bamToFastq. You can find bamToFastq here: https://code.google.com/p/hydra-sv/ If you

版权声明:本文发布于http://www.cnblogs.com/yumiko/,版权由Yumiko_sunny所有,欢迎转载.转载时,请在文章明显位置注明原文链接.若在未经作者同意的情况下,将本文内容用于商业用途,将保留追究其法律责任的权利.如果有问题,请以邮箱方式联系作者(793113046@qq.com). Oracle唯一索引.普通索引及约束的关系 在总结索引扫描类型前(不同于前面总结的五大类索引类型,索引类型主要是索引类别的划分,而索引扫描类型是索引在进行索引扫描时的具体方法),需要了

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网站在进行新用户注册时,都会将用户的注册信息存入数据库中,需要的时候再进行提取.今天写了一个简单的实例. 主要完成以下几点功能: (1)用户进行注册,实现密码重复确认,验证码校对功能. (2)注册成功后,将用户进行插入数据库中进行保存. (3)将数据库表中数据进行提取,并打印. 1.注册表单 在以前的几篇博客中,分享过注册及登录表单的代码.这次的代码,大致相同,只是略有变化.仅作为实例探讨 <html> <head> <title>注册页面</title>

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