homology策略预测基因结构,下载了公共mRNA/CDS序列,考虑用gmap比对.本来是个很简单的脚本,但总是不那么顺利. 无论是用conda安装,还是源码安装较新版本,都存在问题. gmap_build -D ./ -d reference reference.fa gmap -t 10 -D ./ -d reference -f gff3_gene cds.fa > cds_gene.gff3 第一步建立索引都没问题.但比对时,没报错,出现如下: Pre-loading ref posi

Linux 系统上真正认识的可执行文件其实是二进制文件 ( binary program ) shell scripts 只是利用 shell (例如 bash) 这支程序的功能进行一些判断式,而最终执行的除了 bash提供的功能外,它是呼叫一些已经编译好的二进制程序来执行的 小结: 开放源码:就是程序代码,写给人类看的程序语言,但机器并不认识,所以无法执行 编译程序:将程序代码转译成为机器看的懂得语言,就类似翻译者的角色 可执行文件:经过编译程序变成二进制程序后,机器看的懂所以可以执行的档案.

//////知识储备//////////////////////////////////////////////////////////////////// /var 下存放着服务和经常改变的文件 /dev 下存放着光盘的文件  /dev/cdrom 存放着光驱 /mnt 临时的挂载点   /etc/yum.repos.d (yum是一个安装工具) /etc  存放配置的地方 13.通过软件进行安装gcc ; 1.加载镜像文件,并按打开与确定,确定软件放在哪里(放在本地光盘的iso文件和网址上的

Ubuntu 中软件的安装.卸载以及查看的方法总结 博客分类: Linux UbuntuDebian配置管理CacheF#  说明:由于图形化界面方法(如Add/Remove... 和Synaptic Package Manageer)比较简单,所以这里主要总结在终端通过命令行方式进行的软件包安装.卸载和删除的方法. 一.Ubuntu中软件安装方法 1.APT方式 (1)普通安装:apt-get install softname1 softname2 …; (2)修复安装:apt-get -f

手机抓包软件Charles安装使用实例   浏览:5258 发布日期:2015/07/17 分类:技术分享 关键字: 手机抓包软件 Charles 大胡子的博客Charles安装使用实例 Charles安装 手机抓包软件Charles 因为项目要用到,于是折腾了下,现在把自己做的笔记发出来,有兴趣的可以看看,避免大家走弯路 更多技术文章请访问: http://www.dahuizhi.com Charles上的设置要截取iPhone上的网络请求,我们首先需要将Charles的代理功能打开.在Ch

configure作用:是源码安装软件时配置环境用的 他根据你的配置选项和你的系统情况生成makefile文件 为make 做准备 最常用的参数: ./configure --prefix 作用: 不指定prefix,则可执行文件默认放在/usr/local/bin,库文件默认放在/usr/local/lib,配置文件默认放在/usr /local/etc.其它的资源文件放在/usr/local/share.你要卸载这个程序,要么在原来的make目录下用一次make uninstall(前提是m

在Windows系统中安装VirtualBox 双击从官网上下载的VirtualBox-4.3.12-93733-Win.exe安装程序,默认下一步,下一步完成基础安装. 在VirtualBox虚拟机软件上安装win7虚拟机的系统 打开VirtualBox程序,选择“控制”——“新建”选择新建虚拟机的模板类型,这里以“Windows7 (64bit)”为例: 设置虚拟机内存大小,这里设置为1G(1024MB)为例: 创建虚拟机硬盘: 创建虚拟硬盘:

Linux常见的安装为tar,zip,gz,rpm,deb,bin等.我们可以简单的分为三类. 第一:打包或压缩文件tar,zip,gz等,一般解压后即可,或者解压后运行sh文件: 第二:对应的有管理工具的deb,rpm等,通常的这类安装文件可以通过第三方的命令行或UI来简单的安装,例如Ubuntu中的apt来安装 deb,Redhat中的yum来安装rpm: 第三:像.bin类,其实就是把sh和zip打包为bin,或把sh和rpm打包为bin等,当在命令行运行bin安装文件时,其实就是bin里

Linux环境下的软件安装,并不是一件容易的事情:如果通过源代码编译后在安装,当然事情就更为复杂一些:现在安装各种软件的教程都非常普遍:但万变不离其中,对基础知识的扎实掌握,安装各种软件的问题就迎刃而解了.Configure脚本配置工具就是基础之一,它是autoconf的工具的基本应用. 'configure'脚本有大量的命令行选项.对不同的软件包来说,这些选项可能会有变化,但是许多基本的选项是不会改变的.带上'--help'选项执行'configure'脚本可以看到可用的所有选项.尽管许多选项

我们这章以redis和nginx软件为例,介绍一下centos下软件的安装. 需要软件包(可以先下载好复制到centos指定目录下,也可直接用wget命令获取): nginx-1.7.9.tar redis-2.8.19.tar.gz tar.gz软件安装通常的步骤是 $ ./configure  这一步一般用来生成 Makefile,为下一步的编译做准备,你可以通过在 configure 后加上参数来对安装进行控制$ make $ make install (注:运行这个要有足够的权限)$ m

想必linux新手刚开始对于linux软件安装很茫然吧,不知到怎么安装,软件到底安装在哪里,如果我需要删除软件怎么删除,配置文件到哪里去找. 想学习linux的话,最快上手的应该是Ubuntu,它特有的PPA和软件中心,让很多习惯了Windows的用户很是方便,但这些管理和安装细节都由系统自动处理的,有时候我们如果想对某些软件进行管理,就不知到如何下手.其实如果使用默认的安装方式,Ubuntu会使用自己的一套管理方式,文件的存放不是放在同一个目录,其实Linux之所以这么存放也是有原因的.我们知

首先说明一下 ubuntu 的软件安装大概有几种方式: 1. deb 包的安装方式deb 是 debian 系 Linux 的包管理方式, ubuntu 是属于 debian 系的 Linux 发行版,所以默认支持这种软件安装方式,当下载到一个 deb 格式的软件后,在终端输入这个命令就能安装:sudo dpkg -i *.deb 2.编译安装方式(小贴士:使用编译安装前,需要先建立编译环境,使用以下命令建立基本的编译环境:sudo apt-get install build-essential

Linux软件安装由于不同的Linux分支,安装方法也互不相同,介绍几种常见的安装方法. 1. 源码安装,     对于本身具有开源血统的Linux系统来说,几乎所有的开源软件都支持在Linux平台运行,而这些软件一般都以源码打包形式分发,源码安装适用于所有 Linux分支,只需要系统安装了gcc.make.以及automake和autoconf,源码安装的一般方法如下:   1. cd 源码目录 2. ./configure [opts] 3. make 4. make install    

在Linux下软件分三种: 1.绿色软件:即不用安装直接就能用的软件 2.rpm安装包:以rpm结尾的可执行文件  3.源码文件:没有进行过编译和打包的文件,需要编译后再进行安装 一.绿色软件的安装 这类软件安装最简单,只需要将复制到/usr/bin目录下面,即可完成安装: 二.rpm安装包安装 使用rpm命令来安装rpm程序:以安装Java JDK为例: 1.首先要检查在当前系统中是否安装了jdk: 使用命令: rpm -qa | grep jdk  如果什么执行命令后,什么也没显示就代表没有

ubuntu中的软件可通过图形界面的软件中心安装,也可以通过命令行apt-get install安装.但是安装后的软件在哪个位置呢?这点跟windows环境下安装软件的路径选择不一样.ubuntu中可供调用的终端大都在/usr/bin或者/opt,但也不尽然.可尝试用下面的方法快速找到软件的位置. 1.执行该程序: 2.用命令 ps -e 找到该程序的名字: 3.用 find 或 whereis 命令查找文件位置. 此外,如果知道使用apt-get install命令安装的软件,可直接用命令 d

Linux软件的安装rpm -ivh安装软件全名 -i install 安装 -v verbose 显示详细信息 -h hash 显示进度 --nodeps 不检测依赖性(不推荐使用) rpm -Uvh升级 软件全名 有则更新 无则更新rpm -e卸载 软件名 -e erase 卸载 --nodeps 不检测依赖性(不推荐使用) rpm -q 软件名 查询软件包是否安装rpm -qa 查询系统中所有的软件 | grep 软件名 rpm -qi 软件名 查看软件详细信息rpm -qlp 软件全名

序言 上一篇我们了解啦Linux系统中,根目录下的各个文件夹是做什么用的啦,也学会文件如何压缩打包.那么接下来我们就该用到这个系统啦.用这个系统,就是用这个系统的软件,那么我们对我们需要的软件如何安装,对不需要的软件如何卸载,本篇就此做个详解. 我们针对的系统为Centos,那么Centos的主要软件管理有3种,源码与tarball,rpm与srpm,yum. 我会在讲解每一种安装方式的同时,写一个我们开发常用到的软件实例的安装,源码安装redis,rpm安装rabbitmq,yum安装ngin

一.gcc gcc是Linux上面最标准的C语言的编译程序,用来源代码的编译链接. gcc -c hello.c 编译产生目标文件hello.o gcc -O hello.c 编译产生目标文件,并进行优化 gcc -o hello hello.c 生成hello这个可执行的二进制文件   缺点:命令的冗余性,如果 C 语言程序中包含对其他函数或者程序的引用,那么其他程序也要编译成目标文件,然后一起编译成可执行文件,才能运行成功.一个大的程序引用是非常多的,所以用gcc来编译,显得很冗余.   二

本文出处:http://www.cnblogs.com/lhj588/archive/2012/07/17/2595328.html,感谢作者分享. Linux常见的安装为tar,zip,gz,rpm,deb,bin等.我们可以简单的分为三类. 第一:打包或压缩文件tar,zip,gz等,一般解压后即可,或者解压后运行sh文件: 第二:对应的有管理工具的deb,rpm等,通常的这类安装文件可以通过第三方的命令行或UI来简单的安装,例如Ubuntu中的apt来安装 deb,Redhat中的yum来

Python版本:3.6.2  操作系统:Windows  作者:SmallWZQ 最近,有读者透露:Python软件如何安装?为什么自己安装的软件会有各种"奇怪"的问题?据此,本篇随笔将具体讲述如何安装Python 3.x版本的软件.特别地,篇中所述的不是安装文本编辑器(比如Notepad++,Sublimetext,PyCharm......),而是安装Python.为学习Python提供解释器.命令行交互环境以及简单的集成开发环境. 随笔中主要内容如下: 1.安装Python 3

原创笔记,转载请注明出处! 点击[关注],关注也是一种美德~ 我学习C++使用软件为Microsoft Visual Studio 2010. 首先,软件的安装包 链接:https://pan.baidu.com/s/1kW3ChL1 密码:lg9p 下载软件并安装不多说. 新建项目 第一步,打开Microsoft Visual Studio 2010 第二步,依次选择[文件]--[新建]--[项目] 第三步,选择[Visual C++]-- [Win32控制台应用程序] 第四步,填写[项目名称