用bioperl 解析blast的默认输出结果, 整理成-m8格式的输出 #!/usr/bin/perl use Bio::SearchIO; my ($blast) = @ARGV; my $searchio = new Bio::SearchIO(-format => "blast", -file => "test.bls"); while (my $result = $searchio->next_result) { while (my $h

1.1. 从标准输入设备输入 <STDIN> 行输入操作在到达文件的结尾时将返回undef,在while循环的条件中不能使用chomp: while (defined($line = <STDIN>)) { print “I saw $line”; } 在循环的内部,我们将看到每一行,一行接着一行,perl提供简写: while(<STDIN>){ print “I saw $_”; } while (defined($_ = <STDIN>)){ prin

读取标准输入 用<STDIN>进行标准输入:chomp($line=<STDIN>); 如果读到文件尾,行输入操作符就会返回undef.便可利用这一性质跳出循环. while(defined ($line=<STDIN>)){ print "I saw $line"; } 简写为: while(<STDIN>){ print "I saw $_ ."; } 注意:这个简写只在最早的写法中才能正常运行,如果将行输入操作符

  今天写一个小脚本的时候,需要即时输出当前进度到命令行上,并即时将重要数据写入报告文件中.但是perl默认是有输出缓冲的,显示到命令行上必须以\n结尾才行,输出到文件中,回车了都不行,非得要等缓冲区满了. 代码: select( STDOUT ); $| = 1; open( REPORT, ">report.txt" ) || die "create report error: $!\n"; select( REPORT ); $| = 1; select

0.Perl书籍推荐 Perl书籍下载 密码:kkqx 下面是一些我学习Perl过程中读过完整的或部分章节的觉得好的书. 入门级别1:<Perl语言入门>即小骆驼 入门级别2:<Intermediate Perl>即羊驼 入门后复习:<beginning Perl> 系统性学习和进阶:<Pro Perl>(目前在读,是我整理.完善Perl的最佳书籍) Perl编码技巧:<Perl高效编程>(英文版Effective Perl Programmin

布尔值判断 如果是数字,0表示假,其它所有数字都是真. 如果是字符串,空字符串('')为假,其它所有字符串为真(有例外,见下一条). 如果是字符串'0',perl是当作数值0来处理的,所以这是唯一的非空但为假的字符串. 如果既不是数字,也不是字符串,那么先转换为数字或字符串再做判断(也就是"undef"表示假,其它所有引用表示真). "!"表示取反. perl有个技巧,将两个"!"一起用,相当于"负负得正",所以原来是真的仍然

列表和数组 列表 使用括号包围的元素,括号中的元素使用逗号隔开的是列表. 列表中的元素可以是字符串.数值.undef或它们的混合. 列表中的字符串元素需要使用引号包围. 空列表是括号中什么都没有的列表,空列表返回的是undef.但是赋值给别人时,不会当作undef,而是什么都没有(见稍后的例子). (1,2,"perl","python") ("var1","var2","var3") () # 空列表 i

Perl数组和hash相关函数 内置的数组函数有: each, keys, pop, push, shift, splice, unshift, values 内置的hash函数有: delete, each, exists, keys, values 有些是重复的.所以放在一起解释. 数组相关函数: push:将单元素或一个列表追加到数组的尾部,返回追加后的数组长度具体示例push pop:删除数组中的最后一个元素,返回被pop掉的元素,具体示例top unshift:将单元素或一个列表追加到

可有构建匿名的对象,这样就没必要去为只用一两次的数组.hash去取名字,有时候取名是很烦的事. 使用中括号[]构建匿名数组 使用大括号{}构建匿名hash 不包含任何元素的[]和{}分别是匿名空数组.匿名空hash 构造匿名对象 例如,在数组.hash中构建匿名数组: @name=('fairy',['longshuai','wugui','xiaofang']); %hash=('longshuai' => ['male',18,'jiangxi'], 'wugui' => ['male',

在Perl中,子程序的引用常用来做回调函数(callback).闭包(closure),特别是匿名子程序. 回调函数(callback) 关于什么是回调函数,见一文搞懂:词法作用域.动态作用域.回调函数.闭包 以File::Find模块的find函数为例,它用来搜索给定目录下的文件,然后对每个搜索到的文件执行一些操作(通过定义子程序),这些操作对应的函数要传递给find函数,它们就是回调函数.就像unix下的find命令一样,找到文件,然后print.ls.exec CMD操作一样,这几个操作就

本系列: Perl面向对象(1):从代码复用开始 Perl面向对象(2):对象 Perl面向对象(3):解构--对象销毁 第3篇依赖于第2篇,第2篇依赖于1篇. 已有的代码结构 现在有父类Animal,子类Horse,它们的代码分别如下: lib/Animal.pm中: #!/usr/bin/env perl use strict; use warnings; package Animal; sub speak { my $class = shift; print "a $class goes

Perl 类的定义 Perl的一个packag可以作为一个类使用,文件后缀名为.pm,并且把package里的函数当作类的方法来用.如: package Person; 创建和使用对象 大多数程序使用类名作为构造函数,Perl 中可以使用任何名字. 你可以使用多种 Perl 的变量作为 Perl 的对象.大多数情况下我们会使用引用数组或哈希. 接下来我们为 Person 类创建一个构造函数,使用了 Perl 的哈希引用.如: package Person; sub new { my $class

CString和string都是一个类,不同的是CString主要用于MFC或者是ATL编程中,而string则多用于Windows控制台编程中 在实际编程过程中,我们经常用到string或者是CString来保存数据,保存数据的同时,我们也希望把这些保存的数据能够使用输入输出流给输出出来,不过是我们使用Cout标准输出到屏幕,还是使用ofstream输出到文件,我们都需要输出这些对象保存的数据 在实际过程中,我们会遇到三种情况,下面结合遇到的三种情况来说明下如何将CString或者是strin

title author date CreateTime categories Roslyn 让编译时候 Message 内容默认输出 lindexi 2019-07-01 14:16:59 +0800 2019-6-28 9:57:4 +0800 Roslyn MSBuild 编译器 默认无论是在 VisualStudio 还是在 dotnet 命令行都会忽略项目文件或安装库里面的消息输出,而吕水小伙伴给了一个馊主意将所有需要输出给用户的消息换为警告,因为默认是会输出警告,于是消息就可以输出了

首先,我们知道在C++中,空格或者回车被认为是字符串的分割标志,使用cin输入string类的字符串时遇到会自动停止接收输入 例如,当如下程序时: #include <bits/stdc++.h> using namespace std; int main() { string s; cin>>s; ; j>= ; j--){ cout<<s.at(j); } ; 运行结果如下,我们可以看到,输入的字符串实际上只接收到了空格前半部分. 这个时候我们就需要用到get

本节讨论 CCM 在 WiFi 中的实际应用 -- CCMP 协议 根据 RFC 3610,完成 CCMP 报文的加解密,需要提供:分组密钥(K).随机数(Nonce).附加认证数据(AAD),这三个参数从哪里来? 另外, 作为处理对象的 CCMP 报文又来自哪里? 正常是通过抓包获取,但无线报文比普通的有线(以太)报文抓取相对麻烦点幸运的是,万能的 Internet 已经给我们准备好了,在 Wireshark 网站 -- wiki.wireshark.org -- 中有个网页链接主流协议的报文

基于某些原因你需要嗅探HTTP Web流量(即HTTP请求和响应).例如,你可能会测试Web服务器的性能,或者x奥uy调试Web应用程序或RESTful服务 ,又或者试图解决PAC(代理自动配置)问题,或检查从网站上下载的任何恶意文件.甭管是什么原因,对于系统管理员,开发人员,甚至是最终用户,嗅探HTTP流量是非常有帮助的. 数据包嗅探工具如tcpdump是普遍用于实时数据包转储,需要设定一些过滤规则,只捕获HTTP流量,即便如此,它的输出内容很难理解,需要一定的协议基础知识.实时的Web服务器

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此教程是我花了一点时间和功夫整理出来的,希望能够帮到喜欢Lisp(Common Lisp)的朋友们.本人排版很烂还望多多海涵! <Lisp简明教程>PDF格式下载 <Lisp简明教程>ODT格式下载 具体的内容我已经编辑好了,想下载的朋友可以用上面的链接.本人水平有限,如有疏漏还望之处(要是有谁帮我排排版就好了)还望指出!资料虽然是我整理的,但都是网友的智慧,如果有人需要转载,请至少保留其中的“鸣谢”页(如果能有我就更好了:-)). Lisp简明教程 整理人:Chaobs 邮箱:c

绘制函数调用关系图对理解大型程序大有帮助.我想大家都有过一边读源码(并在头脑中维护一个调用栈),一边在纸上画函数调用关系,然后整理成图的经历.如果运气好一点,借助调试器的单步跟踪功能和call stack窗口,能节约一些脑力.不过如果要分析的是脚本语言的代码,那多半只好老老实实用第一种方法了.如果在读代码之前,手边就有一份调用图,岂不妙哉?下面举出我知道的几种免费的分析C/C++函数调用关系的工具. 函数调用关系图(call graph)是图(graph),而且是有向图,多半还是无环图(无圈图)