筛选基因可以用p值吗

2024-11-08

p值还是 FDR ?

p值还是 FDR ? 差异分析如何筛选显著性差异基因,p value, FDR 如何选经常有同学询问如何筛选差异的基因(蛋白).已经计算了表达量和p value值,差异的基因(蛋白)太多了,如何筛选.其中最为关键的是需要对p value进行校正. 基本概念: 零假设:在随机条件下的分布. p值:在零假设下,观测到某一特定实验结果的概率称为p值. 假阳性:得到了阳性结果,但这个阳性结果是假的. 假阴性:得到了阴性结果,但这个阴性结果是假的. 单次检验: 针对单个基因(蛋白),采用统计检验,假设

VBA如何实现筛选条件之“排除某些值”

小爬一般习惯使用Python来解决爬虫和某些办公自动化场景问题,不过最近却需要实现一个VBA需求:从一堆人员处理的Excel数据记录中,排除某些"用户名称"处理的数据.整个思考过程很有意思,很值得分享下. 这个需求看上去很简单,实际当我们的待排除"用户名称"数超过2时,Excel原生的筛选"自定义筛选-不等于"功能是难以支持的: 那么这类问题该怎么高效解决呢? 小爬首先排除的方法是遍历每一行的"用户名称",然后进行remove

kaks calculator批量计算多个基因的选择压力kaks值

欢迎来到"bio生物信息"的世界今天给大家带来"批量计算kaks值"的技能. 关于kaks的背景知识我就不介绍了,感兴趣的自行搜索,这里直接开始讲怎么批量计算kaks值. 1 文件准备首先准备两个文件,一个是基因的cds序列,一个是蛋白质序列. cds序列和蛋白质可以在ensembl网站找到:http://ftp.ensembl.org/pub/current_fasta/ 这两个文件的示例如下: cds序列文件cds.fa >gene1 ATGGAGGT

[Python] Pandas 对数据进行查找、替换、筛选、排序、重复值和缺失值处理

目录 1. 数据文件 2. 读数据 3. 查找数据 4. 替换数据 4.1 一对一替换 4.2 多对一替换 4.3 多对多替换 5. 插入数据 6. 删除数据 6.1 删除列 6.2 删除行 7. 处理缺失值 7.1 数据准备 7.2 查看缺失值 7.3 删除缺失值 7.4 缺失值的填充 8. 处理重复值 8.1 删除重复行 8.2 删除某一列中的重复值 8.3 获取唯一值 9 排序数据 9.1 用sort_values()函数排序数据 9.2 用rank()函数获取数据的排名 10 rank(

【Excel】SUMIF 或用筛选器实现挑选含有某些字段的值，然后把这些值所对应的后面某列上的值相加

Background: 挑选含有某些字段的值,然后把这些值所对应的后面某列上的值相加.比如挑选下表中,所有带有“MX104”这个字段的值,然后把它的后面total那一列的值相加. Solution: 随便选个A16这个位置来记录这个数,公式是 =SUMIF(A2:A12,"*MX104*",D2:D12) ,得到的值是107784.6,就是含有MX104的这几个单元格的D列的值的相加. 使用筛选器也可以达到相同效果: 给A1加上筛选器,如上图,然后筛选MX104如下图但是要注意的是

CARS: 华为提出基于进化算法和权值共享的神经网络结构搜索，CIFAR-10上仅需单卡半天 | CVPR 2020

为了优化进化算法在神经网络结构搜索时候选网络训练过长的问题,参考ENAS和NSGA-III,论文提出连续进化结构搜索方法(continuous evolution architecture search, CARS),最大化利用学习到的知识,如上一轮进化的结构和参数.首先构造用于参数共享的超网,从超网中产生子网,然后使用None-dominated排序策略来选择不同大小的优秀网络,整体耗时仅需要0.5 GPU day 来源:晓飞的算法工程笔记公众号论文: CARS: Continuous

SharePoint 根据时间筛选

最近在整SP列表老大要求用列表规范周报格式. 提出要在一个视图内查看上周一至周日的内容翻了下资料想到了以下几种方法 1.在视图页面添加时间筛选器webpart,用参数传入列表筛选 2.在列表添加按钮及TextBox 通过查询字符串写段js传入参数查询列表 3.直接通过字段值判断第一种实现方式截图: 第二种实现效果截图第一种实现方式: 打开SharePoint desiger,插入两个日期筛选器点击筛选按钮,在弹出框中选择条件 STime为新建的参数,如下图以上在desiger的设计

SharePoint 2013无代码实现列表视图的时间段动态筛选

本文介绍两种为列表视图设置时间段筛选器的方法.其中,第一个方法用于SharePoint Server,第二个方法同时还能用于SharePoint Foundation. 方法一:日期筛选器Web部件先看一下接下来要用的列表,是一个任务列表: 为了实验方便,我们先建个页面,用来放置目标列表视图和筛选器. 1.打开SPD,选择左侧的“网站页面”,点击功能区里的“新建”->"Web部件页". 如果是已有页面,则右键高级模式编辑. 2.找到页面主要区域的WebPart Zone,在其中

EntityFramework_MVC4中EF5 新手入门教程之三 ---3.排序、筛选和分页

在前面的教程你实施了一套基本的 CRUD 操作,为Student实体的 web 页.在本教程中,您将添加排序. 筛选和分页到 StudentsIndex的功能.您还将创建一个页面,并简单分组. 下面的插图显示页面当你完成时的样子.列标题是链接,用户可以单击要作为排序依据的列.单击列标题,一再升序和降序之间切换. 将列排序链接添加到学生索引页若要添加排序到学生索引页,会改变Student控制器的Index方法,将代码添加到Student的索引视图. 添加排序功能指数法在Controllers\

pandas数据处理基础——筛选指定行或者指定列的数据

pandas主要的两个数据结构是:series(相当于一行或一列数据机构)和DataFrame(相当于多行多列的一个表格数据机构). 本文为了方便理解会与excel或者sql操作行或列来进行联想类比 1.重新索引:reindex和ix 上一篇中介绍过数据读取后默认的行索引是0,1,2,3...这样的顺序号.列索引相当于字段名(即第一行数据),这里重新索引意思就是可以将默认的索引重新修改成自己想要的样子. 1.1 Series 比方说:data=Series([4,5,6],index=['a',

深度学习实践-物体检测-faster-RCNN(原理和部分代码说明) 1.tf.image.resize_and_crop(根据比例取出特征层，进行维度变化) 2.tf.slice(数据切片) 3.x.argsort()(对数据进行排列,返回索引值) 4.np.empty(生成空矩阵) 5.np.meshgrid(生成二维数据) 6.np.where(符合条件的索引) 7.tf.gather取值

1. tf.image.resize_and_crop(net, bbox, 256, [14, 14], name) # 根据bbox的y1,x1,y2,x2获得net中的位置,将其转换为14*14,因此为[14, 14, 512], 256表示转换的个数,最后的维度为[256, 14, 14, 512] 参数说明:net表示输入的卷积层,bbox表示y1,x1,y2, x2的比例,256表示转换成多少个,[14, 14]表示转换的卷积,name表示名字 2. tf.slice(x, [0,

javaScript之实战页面筛选功能

友情提示:gif图太小,可以ctrl 加 +键放大成品如下: 开始搭建 html 和 css html代码如下: <!DOCTYPE html> <html lang="en"> <head> <meta charset="UTF-8"> <meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1.0

php laravel 多条件筛选

效果如图,点击的条件出现在已选择的地方,点击已选择的条件可以删除当前点击的条件语言是php 框架是laravel. 一.html <div class="doctor-condition" id="doctor-condition"> <dl> <dt>已选择</dt> <dd id="condition-checked" class="condition-checked"

pandas 筛选指定行或者列的数据

pandas主要的两个数据结构是:series(相当于一行或一列数据结构和DataFrame(相当于多行多列的一个表格数据机构). 原文:https://www.cnblogs.com/gangandimami/p/8983323.html DataFrame.drop(labels=None, axis=0, index=None, columns=None, level=None, inplace=False, errors='raise') inplace = true 时,会使DataF

python之pandas数据筛选和csv操作

本博主要总结DaraFrame数据筛选方法(loc,iloc,ix,at,iat),并以操作csv文件为例进行说明 1. 数据筛选 a b c (1)单条件筛选 df[df[] # 如果想筛选a列的取值大于30的记录,但是之显示满足条件的b,c列的值可以这么写 df[[] # 使用isin函数根据特定值筛选记录.筛选a值等于30或者54的记录 df[df.a.isin([, ])] (2)多条件筛选可以使用&(并)与| (或)操作符或者特定的函数实现多条件筛选 # 使用&筛选a列的取值大

js实现table内某列的内容进行即时筛选

往往有些时候,我们把数据从数据库读取出来,显示到table里面,而此时来了个新需求,要在一个搜索框内输入关键字,表格的内容进行即时的筛选. 而即时触发进行数据库的查询,再回调显示,就显得慢,拖累服务器,降低用户体验度,这时,要是有个纯js操作,进行表格某列的即时筛选,这样既能提高搜索速度,也不用占用服务器资源,用户自然也满意. 实现如下,先看效果图, 开始状态: 在输入框内输入‘w’,表格即时进行筛选,筛选表格内包含有‘w’的行,没有‘w’的进行隐藏,原理就是这样: 实现代码: <!DOCTYP

如何添加筛选器 (Reporting Services)

如果您希望在计算或显示时包含或排除特定值,可向数据集.数据区域或组添加筛选器.在运行时应用筛选器的顺序为:先对数据集,再对数据区域,最后对组,并按照组层次结构自上而下的顺序.在表.矩阵或列表中,对行组.列组和相邻组分别应用各自的筛选器.在图表中,对类别组和序列组分别应用各自的筛选器. 若要添加筛选器,必须指定一个或多个筛选器公式.筛选器公式由标识了要筛选的数据的表达式.运算符和要比较的值组成.所筛选数据的数据类型和值必须匹配.不支持筛选数据集或数据区域的聚合值. 若要筛选图表中的数据点,可以对类

【百奥云GS专栏】1-全基因组选择介绍

目录什么是基因组选择? 基因组选择技术的发展基因组选择的原理和流程基因组选择的模型基因组选择的展望参考资料什么是基因组选择? 基因组选择(Genomic Selection,简称GS)这一概念由挪威生命科学大学的Theo Meuwissen 教授于2001年提出.它是一种利用覆盖全基因组的高密度分子标记进行选择育种的新方法,可通过构建预测模型,根据基因组估计育种值(Genomic Estimated Breeding Value, GEBV)进行早期个体的预测和选择,从而缩短世代间隔

7、前端--jQuery简介、基本选择器、基本筛选器、属性选择器、表单选择器、筛选器方法、节点操作、绑定事件

jQuery简介宗旨:Write less, do more. 内部封装了js代码是编程更加简单并且兼容所有的主流浏览器版本:1.x 2.x 3.x # 可以使用3.x最新版是第三方的类库:使用jQuery需要提前导入 # 实际中很容易遗忘了导入 jQuery下载压缩之后的版本将很多变量名全部使用英文字母代替了导入方式本地导入缺点在于需要提前下载文件优点在于不会受到网络的影响 CDN导入 # CDN:内容分发网络网站:bootcdn jquery最好使用3.4.1版本基本使

零基础照样做RNA-seq差异分析

零基础照样做RNA-seq差异分析 GCBI知识库2018-08-24 14:43:36 基因表达谱的差异分析是RNA-seq中最常见的应用.你眼中的RNA-seq差异分析或许是酱紫的,对不会编程,不懂统计,纯正生物学出生的人, 内心简直SOS…… 但有些人眼中的RNA-seq差异分析却是这样的,借助云平台和图形化界面,生信零基础同样可以做RNA-seq差异分析. 小编也是第一次尝试,一起来看看云平台如何拯救你我于水火之中.RNA测序原始数据太大,就直接用了demo数据. 平台用的是GCBI(w

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