准备总结几篇关于 Markov Chain Monte Carlo 的笔记. 本系列笔记主要译自A Gentle Introduction to Markov Chain Monte Carlo (MCMC) 文章下给出的链接. Monte Carlo Approximations Monte Carlo Approximation for Integration 理论部分 本文主要参考 Monte Carlo Approximations 蒙特卡洛方法是用来近似计算积分的,通过数值方法也可以计
连续型变量的推断性分析方法主要有t检验和方差分析两种,这两种方法可以解决一些实际的分析问题,下面我们分别来介绍一下这两种方法 一.t检验(Student's t test) t检验也称student t检验(Student's t test),由Gosset提出,主要用于样本含量较小(例如n<30),总体标准差σ未知的正态分布资料.我们在介绍连续变量分布时讲过t分布,t检验是用t分布理论来推论差异发生的概率,从而比较两个平均数的差异是否显著. 介绍t检验之前,先说一下Z检验,假设我们已知一个样本
Kalman滤波器的历史渊源 We are like dwarfs on the shoulders of giants, by whose grace we see farther than they. Our study of the works of the ancients enables us to give fresh life to their finer ideas, and rescue them from time’s oblivion and man’s neglect.
GSVA的简介 Gene Set Variation Analysis,被称为基因集变异分析,是一种非参数的无监督分析方法,主要用来评估芯片核转录组的基因集富集结果.主要是通过将基因在不同样品间的表达量矩阵转化成基因集在样品间的表达量矩阵,从而来评估不同的代谢通路在不同样品间是否富集.其实就是研究这些感兴趣的基因集在不同样品间的差异,或者寻找比较重要的基因集,作为一种分析方法,主要是是为了从生物信息学的角度去解释导致表型差异的原因.它的主要输入文件为表达量的矩阵和基因集的文件,通过gsva的方法
6.1Introducing Normally Distributed Variables Why the word “normal”? Because, in the last half of the nineteenth century,researchers discovered that it is quite usual, or “normal,” for a variable to have a distribution shaped like that in Fig. 6.1 no