1)blast产生背景 双序列比对可以采用是基于动态规划算法的Needleman-Wunsch(NW)和Smith-Waterman algorithm(SW)算法,虽然精度高,但计算消耗大.当与数据库比对的时候,该算法就显得不切实际.因此TASTA,blast采用启发式算法使得通过大幅度丢失灵敏度来减少运行时间.与FASTA软件相比,blast通过把搜索限制在狭隘的矩阵对角线条带上,来改进FASTA进行数据库搜索的速度. 2)blast的大致原理 blast 程序首先查询query序列的所有子

import re x = input('Please input a string:') pattern = re.compile(r'\b[a-zA-Z]{3}\b') print(pattern.findall(x))

一般情况下,源程序中所有的行都参加编译.但是有时希望对其中一部分内容只在满足一定条件才进行编译,也就是对一部分内容指定编译的条件,这就是“条件编译”.有时,希望当满足某条件时对一组语句进行编译,而当条件不满足时则编译另一组语句. 今天看到了 #define后面只跟一个“参数” 定义宏,并在预处理过程中将其替换为空字符串(即删除).这样做主要是为了标记某些内容,使程序阅读者能够清楚标记表明的意义,同时又不影响被编译的源代码.另外,通常这些标记能被条件编译的预处理命令#ifdef.#ifndef检测

建议20: 不要只替换一个类 我们经常在系统中定义一个常量接口(或常量类),以囊括系统中所涉及的常量,从而简化代码,方便开发,在很多的开源项目中已采用了类似的方法,比如在Struts2中,org.apache.struts2.StrutsConstants就是一个常量类,它定义了Struts框架中与配置有关的常量,而org.apache.struts2.StrutsStatics则是一个常量接口,其中定义了OGNL访问的关键字. 关于常量接口(类)我们来看一个例子,首先定义一个常量类: publ

前言:今天在网上无意间看到cas单点登录排除请求的问题,发现很多人在讨论如何通过改写AuthenticationFilter类来实现忽略/排除请求URL的功能:突发奇想搜了一下,还真蛮多人都是这么干的,原谅我是个耿直的boy,当时我笑的饭都喷出来了,只需要一个配置的问题,被你们搞的这么麻烦:虽然很想回复他们"你们这帮人用别人的东西都不看源码的吗?",转念一想,这也要怪作者不给力,文档里压根没有提到这个配置,在这里用少量篇幅讲解如何配置排除不需要拦截的请求URL,后面用大量篇幅介绍我是如

之前的文章:构建NCBI本地BLAST数据库 (NR NT等) | blastx/diamond使用方法 | blast构建索引 | makeblastdb 本地运行blast时,需要指定out format. 常见的网页版blast结果可以参照:Blast结果的详细解析 *** Formatting options -outfmt <String> alignment view options: 0 = Pairwise, 1 = Query-anchored showing identit

明明想在学校中请一些同学一起做一项问卷调查,为了实验的客观性,他先用计算机生成了N个1到1000之间的随机整数(N≤1000),对于其中重复的数字,只保留一个,把其余相同的数去掉,不同的数对应着不同的学生的学号.然后再把这些数从小到大排序,按照排好的顺序去找同学做调查.请你协助明明完成“去重”与“排序”的工作. Input Param n               输入随机数的个数 inputArray      n个随机整数组成的数组 Return Value OutputArray    

有时主机较多时,我们只想关注有问题的主机. Ansible callback 插件中有一个 actionable,官方描述为: actionable - shows only items that need attention 即只输出需要关注的部分. 但是 callback 插件只对 playbook 生效,如何对 Ad-hoc 起作用呢? 参考文档:https://docs.ansible.com/ansible/2.6/plugins/callback.html#managing-adho

children([expr]) 概述 取得一个包含匹配的元素集合中每一个元素的所有子元素的元素集合. 可以通过可选的表达式来过滤所匹配的子元素.注意:parents()将查找所有祖辈元素,而children()只考虑子元素而不考虑所有后代元素.大理石量具哪家好 参数 exprStringV1.0 用以过滤子元素的表达式 示例 描述: 查找DIV中的每个子元素. HTML 代码: <p>Hello</p><div><span>Hello Again</

python练习:编写一个程序,检查3个变量x,y,z,输出其中最大的奇数.如果其中没有奇数,就输出一个消息进行说明. 笔者是只使用条件语句实行的.(if-else) 重难点:先把三个数进行由小到大的排序,然后再从最大数进行判断,如果是奇数就输出,如果不是就判断下一个数. print("————————————————————————————") x,y,z=1,4,6 if x>y: x,y=y,x#交换两个变量的值 if y>z:#这里注意单独写一个if而不是elif

@ 目录 前提 依赖环境 问题原因 解决方案 重写jar中的方法 原理 前提 本解决方案来源于网络,因解决自己需求,因此自行记录起来,如有侵权请联系我. 依赖环境 easypoi--依赖版本3.1.0 问题原因 easypoi源代码中创建图片的方法中,没有对图片合并单元格后计算单元格合并,仅仅是计算图片所在的一个单元格位置,因此只填充一个单元格. /** * 图片类型的Cell */ public void createImageCell(Cell cell, double height, St

如上图所示,桌面或其他大部分地方点击右键菜单,都只显示一个白色框,鼠标移上去才有菜单项看,并且效果很丑 解决办法: 计算机-右键-属性-高级-性能-设置-视觉效果-淡入淡出或滑动菜单到视图,将其前面的复选框的钩去掉.

在一个Activity中,多次调用startActivity()来启动另一个Activity,要想只生成一个Activity实例,方法有两种. 方法一:设置起动模式 一个Activity有四种启动模式:standard, singleTop, singleTask, singleInstance. standard: 标准模式,一调用startActivity()方法就会产生一个新的实例. singleTop: 如果已经有一个实例位于Activity栈的顶部时,就不产生新的实例,而只是调用Act

创建auth-up文件 vi /etc/ppp/auth-up chmod a+x /etc/ppp/auth-up auth-up脚本内容如下 #!/bin/sh # get the username/ppp line number from the parameters REALDEVICE=$1 USER=$2 # create the directory to keep pid files per user mkdir -p /var/run/pptpd-users # if there

在这里说一说浏览器里form表单的默认行为 我们都知道浏览器是存在很多默认行为的,可能是出于常用行为考虑又或者是历史原因.但有时候我们不需要这些默认行为.以下: 1).当form表单里只存在一个input输入框时,回车会提交表单操作.  解决方法可以在form里面再加入一个隐藏的input输入框,或者把input从form里面放出来. 2).当form表单里有一个type="submit"的按钮,回车会自动提交. 3).当form表单里的button按钮没有加type类型时,在ie下默

  35．按要求编写Java程序: (1)编写一个接口:InterfaceA,只含有一个方法int method(int n): (2)编写一个类:ClassA来实现接口InterfaceA,实现int method(int n)接口方 法时,要求计算1到n的和: (3)编写另一个类:ClassB来实现接口InterfaceA,实现int method(int n)接口 方法时,要求计算n的阶乘(n!): (4)编写测试类E,在测试类E的main方法中使用接口回调的形式来测试实现 接口的类. p

取得一个包含匹配的元素集合中每一个元素的所有唯一同辈元素的元素集合,用于筛选同辈元素的表达式 $("#pageList").click(function(){ $(this).parent("li").addClass("active"); $(this).parent("li").siblings("li").removeClass("active"); }); 点击时当前按钮添加ac

方法有很多,以下只是提供一种用的多的 一. 单文档程序 在程序App类的InitInstance中添加如下代码 BOOL CDDZApp::InitInstance() { /*只运行一个实例*/ //创建命名信标对象. HANDLE hSem = CreateSemaphore(NULL, 1, 1, "DDZ"); if (hSem) //信标对象创建成功. { //信标对象已经存在,则程序已有一个实例在运行. if (ERROR_ALREADY_EXISTS == GetLast

//设置IE8 多个Table只产生一个进程 using Microsoft.Win32; RegistryKey key = Registry.LocalMachine; RegistryKey software = key.OpenSubKey("Software\\Microsoft\\Internet Explorer\\Main", true); //该项必须已存在 software.SetValue(", RegistryValueKind.DWord); key

只启动一个exe方法: using System; using System.Collections.Generic; using System.Runtime.InteropServices; using System.Windows.Forms; namespace StringToImage { static class Program { [DllImport("user32.dll")] public static extern IntPtr FindWindow(Strin

镇场诗:---大梦谁觉,水月中建博客.百千磨难,才知世事无常.---今持佛语,技术无量愿学.愿尽所学,铸一良心博客.------------------------------------------ 1 base code use master drop database helloworld --创建一个数据库 create database helloworld --用helloworld1这个数据库 use helloworld --创建一个表格FoJiaTeacher create t