一.bwa比对软件的使用 1.对参考基因组构建索引 bwa index -a bwtsw hg19.fa   #  -a 参数:is[默认] or bwtsw,即bwa构建索引的两种算法,两种算法都是基于BWT的(BWT search while the CIGAR string by Smith-Waterman alignment.).-a bwtsw对于短的参考序列是不工作的,必须要大于等于10Mb:-a is 不适用于大的参考序列,必须要小于等于2G: output:hg19.fa.am

file -z b.zip

用到临界区 保护写日志的函数: 递归函数 删除目录下的所有文件: 循环创建或判断FTP的目录: 可改进的地方:循环压缩深层次目录的所以文件: 实现断点续传,或断点下载: {******************************************************************************* Copyright (C), 2014-2020, aicaipiao File name: UFtpContentThd.pas Author: lipingchen

hadoop对于压缩文件的支持及算法优缺点   hadoop对于压缩格式的是透明识别,我们的MapReduce任务的执行是透明的,hadoop能够自动为我们 将压缩的文件解压,而不用我们去关心. 如果我们压缩的文件有相应压缩格式的扩展名(比如lzo,gz,bzip2等),hadoop就会根据扩展名去选择解码器解压. 压缩格式 工具 算法 文件扩展名 多文件 可分割性 DEFLATE 无 DEFLATE .deflate 不 不 gzip gzip DEFLATE .gz 不 不 ZIP zip

前段时间碰到一个需要把目录下文件夹压缩的项目,但是度娘里没找到,只好自己写脚本了. #coding:utf-8 import os filePath = raw_input("请输入路径:") if filePath == "": os._exit() #需要退出 ds = list(os.walk(filePath)) #获得所有文件夹的信息列表 fileExe = os.path.realpath(__file__) x_ipos = fileExe.rfind

转载:https://www.cnblogs.com/ggjucheng/archive/2012/04/22/2465580.html hadoop对于压缩格式的是透明识别,我们的MapReduce任务的执行是透明的,hadoop能够自动为我们 将压缩的文件解压,而不用我们去关心. 如果我们压缩的文件有相应压缩格式的扩展名(比如lzo,gz,bzip2等),hadoop就会根据扩展名去选择解码器解压. hadoop对每个压缩格式的支持,详细见下表:  压缩格式  工具  算法  文件扩展名  

Freemaker基于word模板动态导出压缩文件汇总整理 Freemaker基于word模板动态导出单个文件思路和代码详情见连接: https://www.cnblogs.com/lsy-blogs/p/9243281.html 核心思路如下: 1.service中写方法,查询需要导出的结果list集合数据: 2.控制层中调用service方法获取结果集合数据,调用freemaker获取对应的word文件到临时目录下: 3.利用流处理,将临时目录下导出的每一个word写入到压缩文件中去,利用流

最近因为项目的需要,要对zip压缩文件进行批量解压.在网上查阅了相关的资料后,最终使用zlib开源库实现了该功能.本文将对zlib开源库进行简单介绍,并给出一个使用zlib开源库对zip压缩文件进行解压的示例程序. 1.zlib开源库 zlib是应用最广泛的压缩与解压缩zip文件的免费开源库,提供了数据压缩与解压缩的函式库. zlib中最关键的函数有以下两个: (1)int compress(Bytef *dest, uLongf *destLen, const Bytef *source, u

C#压缩文件可以使用第三方dll库:ICSharpCode.SharpZipLib.dll: 以下代码能实现文件夹与多个文件的同时压缩.(例:把三个文件夹和五个文件一起压缩成一个zip) 直接上代码,代码来自:http://blog.csdn.net/jk007/article/details/8115825 using System; using System.Collections.Generic; using System.Linq; using System.Text; using Sy

破解压缩文件密码rarcrack   常见的压缩文件格式有ZIP.RAR和7z.这三种格式都支持使用密码进行加密压缩.前面讲过破解ZIP压缩文件,可以使用fcrackzip.对于RAR和7z格式,可以使用rarcrack.该工具也是一款知名的加密压缩文件破解工具,它支持ZIP.RAR和7z三种格式.它采用暴力破解的模式进行破解.同时,用户可以修改破解配置文件,指定密码所使用的字符集和起始密码.虽然这个工具功能简单,但使用非常简便.   PS:Kali Linux默认没有安装该工具.用户需要使用a

总结:                                                          使用PHP下载文件的操作需要给出四个header(),可以参考我的另一篇博文:PHP如何实现下载功能超详细流程分析 计算文件的大小的时候,并不需要先打开文件,通过filesize($filename)就可以看出,如果需要先打开文件的话,filesize可能就会是这样的形式了filesize($filehandle) 向客户端回送数据的是,记得要设置一个buffer,用来指定每

java中实现zip的压缩与解压缩.java自带的 能实现的功能比较有限. 本程序功能:实现简单的压缩和解压缩,压缩文件夹下的所有文件(文件过滤的话需要对File进一步细节处理). 对中文的支持需要使用java7或java8,可以在ZipOutputStream和ZipInputStream中指定Charset参数,详见API中的构造参数. 1.压缩文件或文件夹 public void zip() throws IOException { File fileSrc = new File("E:\

public class ZipBin { public byte[] bytes; //C#读取压缩文件(将压缩文件转换为二进制 public void GetZipToByte(string inpath) { FileStream fs = new FileStream(inpath, FileMode.Open); bytes = new byte[fs.Length]; int count = Convert.ToInt32(fs.Length); fs.Read(bytes, , c

(1)复制文件 cp -r  要copy的文件/("/"指的是包括里面的内容)   newfile_name(要命名的文件名) eg:cp -r webapps_zero/   fxtf (2)删除文件里的内容 rm -rf   要删除的文件内容/("/"代表的是里面的内容,不能少) eg:rm -rf web-inf/lib/ (3)压缩文件 tar -czvf  fxtf.tar.gz(压缩之后的文件)   fxtf(要压缩的文件)

在工作过程中,需要将一个文件夹生成压缩文件,然后提供给用户下载.所以自己写了一个压缩文件的工具类.该工具类支持单个文件和文件夹压缩.放代码: import java.io.BufferedOutputStream; import java.io.File; import java.io.FileInputStream; import java.io.FileOutputStream; import org.apache.tools.zip.ZipEntry; import org.apache.

分享一个7z压缩文件时排除指定文件类型的命令行,感觉很有用: 7z a -t7z d:\updateCRM.7z d:\updateCRM\*.* -r -x!*.log -x!*bak a:创建压缩文件 -t7z:7z格式 d:\updateCRM.7z 目标文件名 d:\update7z\*.* 源文件位置 -r:遍历所有子目录 -x!* 要扣除的文件类型

reference :  http://www.open-open.com/lib/view/open1381641653833.html Java API中的import java.util.zip.*;包下包含了Java对于压缩文件的所有相关操作. 我们可以使用该包中的方法,结合IO中的相关知识,进行文件的压缩和解压缩相关操作. ZipFile java中的每一个压缩文件都是可以使用ZipFile来进行表示的. File file = new File("F:/zippath.zip&quo

using System;using System.Collections.Generic;using System.Text; ///第三方dllusing ICSharpCode.SharpZipLib;using ICSharpCode.SharpZipLib.Checksums;using ICSharpCode.SharpZipLib.Zip;using System.IO;using log4net;using log4net.Config;using System.Text.Reg

/** * 传入文件数组,压缩文件,在指定路径下生成指定文件名的压缩文件 * * @param files * 文件数组 * @param strZipName * 压缩文件路径及文件名 * @throws IOException */ public static void zipFiles(List

我想把 E:\\AA\BB\11.txt 压缩后存入 E:\\AA1\BB1\11.rar 但是当我解压( E:\\AA1\BB1\11.rar)的时候,发现:11.txt 不是在 E:\\AA1\BB1\11.txt 路径下, 而是 E:\\AA1\BB1\AA\BB\11.txt 悲剧就这样进行着, 下面是我的解决方案: /// <summary> /// 压缩文件 /// </summary> /// <param name="DFilePath"&

递归实现压缩文件夹和子文件夹. using System; using System.Collections.Generic; using System.Linq; using System.Text; using System.IO; using System.IO.Compression; using System.Collections; using System.Runtime.Serialization; using System.Runtime.Serialization.Forma