利用DAVID简单的进行GO富集度分析(这里只做简单的分析,即看基因是否存在在GO的三个过程里面) 比如我们有一组要分析的基因:TRPV6    CXADR    PROM1    GRAMD2    SOX10    GPRIN2    VANGL2    GRHL1    BCL11A    MROH8(这里用的是关于人的基因名) 首先打开DAVID网页,选择Functional Annotation: 在左边的框里面按提示输入,步骤1,输入你的ID号,这里可以是基因ID,也可以是基因名,或

开篇 其实这篇文章我本来想在讲完选举的时候就开始讲线性一致性读的,但是感觉直接讲没头没尾的看起来比比较困难,所以就有了RheaKV的系列,这是RheaKV,终于可以讲一下SOFAJRaft的线性一致性读是怎么做到了的.所谓线性一致性,一个简单的例子是在 T1 的时间写入一个值,那么在 T1 之后读一定能读到这个值,不可能读到 T1 之前的值. 其中部分内容参考SOFAJRaft文档: SOFAJRaft 线性一致读实现剖析 | SOFAJRaft 实现原理 SOFAJRaft 实现原理 - SO

nginx源代码总结: 1)代码中没有特别绕特别别扭的编码实现.从变量的定义调用函数的实现封装,都非常恰当.比方从函数命名或者变量命名就能够看出来定义的大体意义,函数的基本功能,再好的架构实如今编码习惯差的人实现也会黯然失色,假设透彻理解代码的实现,领悟架构的设计初衷,认为每块代码就想经过耐心雕琢一样,不只实现了主要的功能给你,为其它人阅读也会提供非常好的支持.仔细恰当的命名规则就能够看出作者的功力. 2)更好更高的软件性能体如今架构设计上,好的架构会让软件更加稳定.easy维护.便于扩展.从核

参考文章: https://segmentfault.com/a/1190000017255007 https://segmentfault.com/a/1190000020194154 1.线程启动分析(下图来源于李兴华教学视频)

前言 一般我们挑出一堆感兴趣的基因想临时看看它们的功能,需要做个富集分析.虽然公司买了最新版的数据库,如KEGG,但在集群跑下来嫌麻烦.这时网页在线或者本地化工具派上用场了. DAVID DAVID地址 以前我会首选DAVID,原因是方便简单.有人说它数据库更新慢,不准确(据说被science点名批评了),也有人说它运行慢,数据库更新慢是硬伤,但我只是大概看下基因集的功能,总体结果不会差到哪里去.至于运行速度我反而觉得比其他工具更快. 使用方法: 注释结果有很多,挑自己感兴趣的数据库,我一般看G

目录 OOM异常--intsmaze 正确姿势dump文件分析--intsmaze 正确的姿势--intsmaze dump丢失打印--intsmaze 哪些内存溢出会产生dump文件--intsmaze 应用程序出现OOM异常,你是否仍然通过看日志的方式去排查问题(该方式定位解决问题是大概率的巧合而已)?正确的排查方案是进行dump文件分析,你知道为什么吗? OOM异常--intsmaze 首先说一下,本人在开发中遇到的OOM异常基本也是通过看log日志去定位的(很多OOM异常是因为出现死循环

目录 前言 IOC 只是一个 Map 集合 IOC 三大核心接口 IOC 初始化三大步骤 定位 加载 注册 总结 前言 在 Spring 框架中,大家耳熟能详的无非就是 IOC,DI,Spring MVC,AOP,这些是 Spring 中最基础的核心功能,再高级点的功能就还有数据数据访问模块(JDBC,ORM,事务等).Spring 本身的扩展性也做得非常好,源码当中也是运用了大量设计模式来实现,了解 Spring 源码对于一个 Java 开发人员来说是非常有必要的,从源码中我们也可以学习到很多

非原创 参考资料: 一文掌握GO和pathway分析 - 生物信息学讨论版 -丁香园论坛http://www.dxy.cn/bbs/thread/34904124#34904124 GO富集 GO是Gene ontology的缩写,GO数据库分别从功能.参与的生物途径及细胞中的定位对基因产物进行了标准化描述,即对基因产物进行简单注释,通过GO富集分析可以粗略了解差异基因富集在哪些生物学功能.途径或者细胞定位. Pathway Pathway指代谢通路,对差异基因进行pathway分析,可以了解实

Android USB驱动中,上层应用协议里最重要的一个文件是android/kernel/drivers/usb/gadget/android.c.这个文件实现USB的上层应用协议. 首先包含了一些系统级别的头文件,如模块.电源管理.of API等 /* * Gadget Driver for Android * * Copyright (C) 2008 Google, Inc. *.Copyright (c) 2014, The Linux Foundation. All rights re

(一)项目启动前 从事产品的工作一年多,但自己一直苦于这样或者那样的困惑,很多人想要从事产品,或者老板自己创业要亲自承担产品一职,但他们对产品这个岗位的认识却不明晰,有的以为是纯粹的画原型,有的是以为做项目管理跟踪项目进度,有的是做竞品分析给老板看.实际上,这些都不是产品经理的核心和重点.在较为成熟的企业,因为产品的壮大和人员的增多,为了便于协作和沟通,岗位会细化的很清楚,如产品经理.交互设计师.UI设计师.用户体验分析师.数据分析师.运营等等.但是创业型公司中产品经理往往都是身兼数职,创业公司

上一篇分析了c语言的函数调用栈情况,知道了c语言的函数调用机制后,我们来看一下,linux0.11中起动部分的代码是如何从汇编跳入c语言函数的.在LINUX 0.11中的head.s文件中会看到如下一段代码(linux0.11的启动分析部分会在另一部分中再分析,由于此文仅涉及c与汇编代码的问题,). after_page_tables: pushl $ # These are the parameters to main :-) pushl $ pushl $ pushl $L6 # retur

一直以来,HashMap就是Java面试过程中的常客,不管是刚毕业的,还是工作了好多年的同学,在Java面试过程中,经常会被问到HashMap相关的一些问题,而且每次面试都被问到一些自己平时没有注意的问题.因为HashMap不管对于毕业生,还是对于老司机来说,都非常熟悉,熟悉到你经常忽略它. 本着知其然,更要知其所以然的精神,本人对JDK 1.8版本的HashMap源码进行了仔细的学习.大家知道,JDK 1.8中HashMap的实现有了一些改进,特别是数据存储结构引进了红黑树,使得查询更加的快捷

一:什么是ANR ANR:Application Not Responding,即应用无响应 二:ANR的类型 ANR一般有三种类型: 1. KeyDispatchTimeout(5 seconds) --主要类型按键或触摸事件在特定时间内无响应 2. BroadcastTimeout(10 seconds) --BroadcastReceiver在特定时间内无法处理完成 3. ServiceTimeout(20 seconds) --小概率类型 Service在特定的时间内无法处理完成 三:K

目录 前言 重要接口及类介绍 源码分析 拦截器的配置 编写自定义的拦截器 总结 总结 前言 SpringMVC是目前主流的Web MVC框架之一. 如果有同学对它不熟悉,那么请参考它的入门blog:http://www.cnblogs.com/fangjian0423/p/springMVC-introduction.html 拦截器是每个Web框架必备的功能,也是个老生常谈的主题了. 本文将分析SpringMVC的拦截器功能是如何设计的,让读者了解该功能设计的原理. 重要接口及类介绍 1. H

事件绑定的方式有很多种.使用了jQuery那么原来那种绑定方式(elem.click = function(){...})就不推荐了,原因? 最主要的一个原因是elem.click = fn这种方式只能绑定一个事件处理,多次绑定的只会保留最后一次绑定的结果. 看一下jQuery绑定事件的方式有哪些 jQuery.fn.eventType([[data,] fn]) 比如eventType指的是事件类型,比如click: $("#chua").click(fn); data这个参数一般都

在前面分析的时候也分析了部分筛选操作(详见),我们接着分析,把主要的几个分析一下. jQuery.fn.find( selector ) find接受一个参数表达式selector:选择器(字符串).DOM元素(Element).jQuery对象.分两种情况处理: 第一种,如果传入的参数是非字符串,则先通过jQuery选择器将selector查找出来,然后过滤出包含于当前jQuery对象所匹配的元素的节点. if ( typeof selector !== "string" ) { s

上一篇介绍了BeanFactory体系的所有接口——Spring源码分析——BeanFactory体系之接口详细分析,本篇就接着介绍BeanFactory体系的抽象类和接口. 一.BeanFactory的基本类体系结构(类为主): 上图可与 Spring源码分析——BeanFactory体系之接口详细分析 的图结合分析,一个以接口为主,一个以类为主(PS:Spring的体系结构要分析清楚,不得不曲线救国啊!不然27寸屏幕给我画估计都装不下.). 具体: 1.7层的类体系继承. 2.Abstrac

时间 2014-12-11 12:41:43  CSDN博客 原文  http://blog.csdn.net/bboyfeiyu/article/details/41863951 主题 HTTPHttpComponents 在开发中,我们使用的比较多的HTTP请求方式基本上就是GET.POST.其中GET用于从服务器获取数据,POST主要用于向服务器提交一些表单数据,例如文件上传等.而我们在使用HTTP请求时中遇到的比较麻烦的事情就是构造文件上传的HTTP报文格式,这个格式虽说也比较简单,但也

非个人的全部理解,部分摘自cocos官网教程,感谢cocos官网. 在<CCScheduler.h>头文件中,定义了关于调度器的五个类:Timer,TimerTargetSelector,TimerTargetCallback, TimerScriptHandler和Scheduler,Timer和Scheduler直接继承于Ref类,TimerTargetSelector,TimerTargetCallback和TimerScriptHandler继承自Timer类. 先看看Timer类:

来自: http://blog.csdn.net/tjy1985/article/details/6777346 http://blog.csdn.net/tjy1985/article/details/6777355 http://blog.csdn.net/tjy1985/article/details/6777983 http://www.eoeandroid.com/forum.php?mod=viewthread&tid=165974 =========================