最近文章中经常出现及De Bruijin 这个关键字,网上搜索了一下,记录下来. De Bruijn序列 (德布鲁因序列) 问题:能否构造一个长度为2的n次方的二进制环状串,使得二进制环状串中总共2的n次方个长为n的不同截断作为2的n次方个长为n的二进制串来说互不相同.1946年,荷兰数学家De Bruijn解决了这个问题. 这种序列,就是De Bruijn序列. 例如,当n为2时,这样的环状串可以是:0011,它的4个长度为2的子串分别为00.01.11.10,这四个子串互不相同.详情参考:h

1. Velvet的安装 Velvet用于基因组的de novo组装,支持各种原始数据,包括Illumina的short reads和454的long reads. 首先下载velvet的安装包,直接使用make命令来编译,即可获得可执行主程序velveth和velvetg.安装如下: $ wget http://www.ebi.ac.uk/~zerbino/velvet/velvet_1.2.10.tgz $ tar zxf velvet_1.2.10.tgz $ cd velvet_1.2.

k-mer是指将reads分成包含k个碱基的字符串,一般长短为m的reads可以分成m-k+1个k-mers.举个例子吧,为了简化,有这么个reads(当然实际比这个长):AACTGACTGA.如果k-mer的k为3的话,我们可以将其切割为AAC ACT CTG TGA GAC ACT CTG TGA.我们将这些k-mers放入计算机中拼接,假设第一个为TGA ,那么下一个应该为GA-,.…… TGA GAC ACT CTG TG ???? 基于这样的思路,我们很快就发现了问题,下一个点可能有很

我在网上看到了一点神奇的代码,用来计算一个数字末尾连续零的个数. 刚好我在优化一个I2C读写函数(只写入I2C特定bit),觉得这个很有用.经过尝试,确实没问题. 下面我隆重介绍一下: Count the consecutive zero bits (trailing) on the right with multiply and lookup unsigned int v; // find the number of trailing zeros in 32-bit v int r; // r

作者: 负雪明烛 id: fuxuemingzhu 个人博客: http://fuxuemingzhu.cn/ 题目地址: https://leetcode.com/problems/cracking-the-safe/description/ 题目描述: There is a box protected by a password. The password is n digits, where each letter can be one of the first k digits 0, 1

谈到单元测试,任何一个开发或是测试人员都不会觉得陌生.我想大多数的同学也都是接触过各种单元测试框架.关于单元测试的重要性,应该不会有太多的质疑.这个系列,我向大家介绍一下xUnit.Net的使用.就让我们一起来玩转xUnit.Net吧.本文要讨论的内容如下: 单元测试框架提供了什么 .Net平台常见单元测试框架介绍 xUnit.Net简介 xUnit.Net 安装 第一个xUnit.Net Case (一)单元测试框架的提供了什么 有很多小伙伴经常会提到所谓“框架”,框架这样的概念有很多比如:X

atitit.orm的缺点与orm框架市场占有率,选型attilax总结 1. attilax的orm框架要求 1 2. orm框架市场占有率 2 3. spring jdbc templt 3 4. eclipselink /toplink  不好用 4 5. jooq 的总结 4 6. attilax的选择 atiorm 4 7. 参考 4 1. attilax的orm框架要求 1.无需配置文件或注解..直接从map.json生成sql 2.直接获取sql..无需连接数据库..方便调试.或这

生物信息学 Contig是reads拼成的连续的DNA片段,连续表达一个gene.通过双端测序的contig可确定contig之间的关系得到scaffold,Scaffold是reads拼成的有gap的DNA片段.理想情况下,一条染色体用同一个scaffold的表达.整个genome存在很多零碎片段,可舍弃.因为duplication产生很多overlap. N50,L50和NG50是评价genome assembly的quality的标准,评价长度时使用N50,N50是一个contig的长度.

美国时间 6月7日--9日,为期三天的微软.NET社区虚拟大会正式在 Channel9 上召开,美国时间6.8 是第二天, Miguel de Icaza 做Keynote,Miguel 在波士顿Xamarin的办公室,所以使用了Skype. Miguel一登场回顾了收购Xamarin ,Xamarin免费和开源,然后就把Keynote内容列出来了,内容都来自于社区,涵盖移动端和桌面开发者介绍 .NET 远景包括Xamarin 和 Universal Windows Platform. 首先是谈

atitit.细节决定成败的适合情形与缺点 1. 在理论界有两种观点:一种是"细节决定成败",另一种是"战略决定成败".1 1.1. 格局决定成败,方向决定成败 战略决定成败"1 1.2.   战略用的是望远镜,细节用的是显微镜.1 2. 只有战略正确,细节才会有意义.2 2.1. 只见树木,不见森林2 2.2. 对于一艘驶错了方向的航船来说,任何来风都是逆风,2 2.3. 南辕北辙的故事2 2.4. 大失误是战略,小失误是细节,战略错了回天无力,细节错了

Mientras que yo apareció su campo usando nuestro Nike Glide Wildhorse sólo dos ($ 110) zapatillas de deporte, mi esposo y yo terminó siendo complacido por simplemente sus apariciones. Soy un nuevo lechón perteneciente a las zapatillas de deporte que

ajax的优点 Ajax的给我们带来的好处大家基本上都深有体会,在这里我只简单的讲几点: 1.最大的一点是页面无刷新,在页面内与服务器通信,给用户的体验非常好. 2.使用异步方式与服务器通信,不需要打断用户的操作,具有更加迅速的响应能力. 3.可以把以前一些服务器负担的工作转嫁到客户端,利用客户端闲置的能力来处理,减轻服务器和带宽的负担,节约空间和宽带租用成本.并且减轻服务器的负担,ajax的原则是"按需取数据",可以最大程度的减少冗余请求,和响应对服务器造成的负担. 4.基于标准化的

PNG32的alpha透明效果在IE6下会出现bug,出现灰色背景.而目前的解决方案就是 IE提供的滤镜.需要注意的是滤镜并不是对原图片进行修改,而是对相应的html元素进行 修改.所以在一个html中的多处使用alpha滤镜,那么性能的损耗将会累加. 现总结使用滤镜的缺点: 1,IE6下使用滤镜,那么无法对该PNG图片进行定位.可以通过其他解决方案完成.这篇 文章提到了两种解决方案,分别是硬编码和clip方案. 2,使用滤镜会冻结IE6的渐进渲染.渲染往往是从css下载完毕开始进行,然而对于使

德淘W家(Windeln.de)网址:www.windeln.de 德淘W家(Windeln.de)的新人优惠码wcode0520 第一次购物结账时输入wcode0520,提交订单,1000积分划入你的账户: 第二次购物可抵10欧元.

注解与XML配置的区别 注解:是一种分散式的元数据,与源代码耦合. xml :是一种集中式的元数据,与源代码解耦. 因此注解和XML的选择上可以从两个角度来看:分散还是集中,源代码耦合/解耦. 注解的缺点: 1.很多朋友比如在使用spring注解时,会发现注解分散到很多类中,不好管理和维护: 2.注解的开启/关闭必须修改源代码,因为注解是源代码绑定的,如果要修改,需要改源码,有这个问题,所以如果是这种情况,还是使用XML配置方式:比如数据源: 3.注解还一个缺点就是灵活性,比如在之前翻译的Spr

本文为原创,转载请注明:http://www.cnblogs.com/gistao/ epoll提供了ET和LT两种模式,网上文章很多,这里只总结下LT模式下的两个缺点 epoll对fd的管理实现是用的红黑树,所以epoll_ctl并不是一个很快的操作,而LT模式更放大了这个缺点. 有一个关于内存屏障(Memory barrier)的patch:prevent missed events on EPOLL_CTL_MOD,可能很多内核都没有打上这个补丁.

转自:http://blog.csdn.net/jyp123123/article/details/52836905 java.lang.NoClassDefFoundError: de.greenrobot.event.EventBus 标签: androidandroid studio 2016-10-17 10:57 312人阅读 评论(2) 收藏 举报  分类: 环信 版权声明:本文为博主原创文章,未经博主允许不得转载. 集成环信的时候,程序安装运行是报错: Java.lang.NoCl

不论是从官方手册,还是各种第三方教程,几乎涉及到的,都是讲如何使用U3D,以及U3D的优点. 虽然我是用的一个让步语气,但请不要否认U3D的这些优点,它们的确存在. 但对于一个引擎的特性来说,优点与缺点总是共存的. 你可以从网上了解到所有优点,但是,你很难真正体会到U3D的缺点,除非你自己被坑过. 今天,我就来细数一下U3D的缺点. 这些缺点,仅针对大中型项目. 小型项目,U3D的优点可以充分利用. 是不是猛的一看,全是缺点. 不要怕,想看优点的朋友,走这里  Unity3D使用经验总结 优点篇

Atitit 面向对象弊端与问题 坏处 缺点   1.1. 状态fsm,反模块化,又是反并行的,这是它的非常固有的特征, 1 1.2. 现时的OOP编程有可能不缓存友好(cache friendly), 1 1.3. 面向对象是一个很重量级的方法.你得设计类的继承关系. 3 1.4. 继承的代价庞大的继承体系来获得代码的可重用性3 1.5. ,毕竟很难一开始就做好规划,所谓的is-a,has-a 3   1.1. 状态fsm,反模块化,又是反并行的,这是它的非常固有的特征, 1.2. 现时的OO

xUnit.Net本身提供了标记测试方法的标签Fact和Theory.在前面的文章<Lesson 02 玩转 xUnit.Net 之 基本UnitTest & 数据驱动>中,也对它们做了详细的介绍.这一篇,来分享一个高级点的主题:如何扩展标签?还是老规矩,看一下议题: 概述 让xUnit.Net识别你的测试Attribute 定义运行策略:XunitTestCase 与Runner交流:消息总线 - IMessageBus 总结 这一篇有一些不大容易理解的东东.因此,我是默认读者已经读