查找DICOM基础知识时,看到这篇文章里面写了一些关于使用深度学习进行医疗影像分析:文件格式篇.下文摘自:https://www.jiqizhixin.com/articles/2017-07-31 医疗数据组成: 医疗数据有四个关键的组成部分--像素深度.光度解释.元数据以及像素数据.这几部分决定了图像的大小和分辨率. 像素深度(Pixel Depth)或者位深度(Bit Depth)或者色深度(Color Depth)就是用来编码每一像素的信息所用的位数.例如,一个 8 位的栅格会拥有从 0

转载:http://blog.csdn.net/zssureqh/article/details/39213817 背景: 上一篇专栏博文中针对PACS终端(或设备终端,如CT设备)与RIS系统之间worklist查询进行了介绍,并着重对比分析了DICOM3.0中各部分对DICOM网络通讯服务的定义.此次通过结合早些时间的博文DICOM医学图像处理:基于DCMTK工具包学习和分析worklist,对DCMTK开源库中提供的storescp.exe和storescu.exe工具的源码进行剖析,从底

转载:http://blog.csdn.net/zssureqh/article/details/44278693 题记: 近一年来一直坚持周末写博客,整理工作和闲暇之余的点点滴滴.对于新知识点.新技术的涉猎会单独成文,对于与DICOM相关的知识统一放在了DICOM医学图像处理 专栏里,其实DICOM英文全称是Digital Imaging and Communications in Medicine,即医学数字成像和通信.这就表明DICOM标准至少应该分成图像处理和网路通信两大部分.之前也探讨

一 什么是DICOM?DICOM是Digital Imaging and Communication of Medicine的缩写,是美国放射学会(American College of Radiology,ACR)和美国电器制造商协会(National Electrical Manufacturers Association,NEMA)组织制定的专门用于医学图像的存储和传输的标准名称.经过十多年的发展,该标准已经被医疗设备生产商和医疗界广泛接受,在医疗仪器中得到普及和应用,带有DICOM接口的

转自:http://www.cnblogs.com/assassinx/archive/2013/05/18/3084854.html 说到底无非几个事情 :1传输语法确定 2数据元素读取 3 7fe0,0010元素 也就是图像数据处理.关于这整个过程已经不想多说了 在我的上上一篇博客里已经基本实现了. 当然还很有问题比如图像调窗就有bug 这个以后再说吧.众所周知dicom格式文件是由一个接一个连续的“数据元素”组成的. 这次我们只讲怎样去处理文件里一种特殊的数据元素:那就是VR为SQ类型的元

转自:http://www.cnblogs.com/assassinx/archive/2013/01/09/dicomViewer.html Dicom全称是医学数字图像与通讯,这里讲的暂不涉及通讯那方面的问题 只讲*.dcm 也就是diocm格式文件的读取,读取本身是没啥难度的 无非就是字节码数据流处理.只不过确实比较繁琐. 分析: 整体结构先是128字节所谓的导言部分,说俗点就是没啥意义的破数据 跳过就是了,然后是dataElement依次排列的方式 就是一个dataElement接一个d

背景: 从DICOM网络传输一文开始,相继介绍了C-ECHO.C-FIND.C-STORE.C-MOVE等DIMSE-C服务的简单实现,博文中的代码给出的实例都是基于fo-dicom库来实现的,原因只有一个:基于C#的fo-dicom库具有高封装性.对于初学者来说实现大多数的DIMSE-C.DIMSE-N服务几乎都是“傻瓜式”操作——构造C-XXX-RQ.N-XXX-RQ然后绑定相应的OnResponseReceived处理函数即可.本博文希望在前几篇预热的基础上,对比DCMTK.fo-dico

背景介绍: 近期项目需求,须要使用C#进行最新的UI和相关DICOM3.0医学图像模块的开发.在C++语言下,我使用的是应用最广泛的DCMTK开源库,在本专栏的起初阶段的大多数博文都是对DCMTK开源库的介绍和学习.眼下因为项目须要,现開始对mDCM开源库继续学习分析,因此本专栏接下来的文章会大多以mDCM开源库为例进行医学图像的解说,DCMTK因为是C++语言开发的,所以作为我学习和剖析mDCM开源库的原始根据,我们并未放弃对DCMTK开源库的学习,而是通过更加细致的研读和分析DCMTK的C+

医疗图像解析 Dicom 后缀: .dcm..DCM Dicom中规定的坐标系是以人坐标系为绝对坐标系的,规定X轴正向指向病人的左侧,Y轴正向指向病人的背部,Z轴正向指向病人的头部.但是,坐标点的位置,每个厂商都有自己的看法 下图展示了成像过程中对应的坐标系 成像坐标系 三视图 图片信息中的Tag说明 在DICOM中,是通过Image Position和Image Orientation来描述当前的图像和人体坐标系的相对位置的. 解析举例 import dicom import pylab im

Dicom格式文件解析器   Dicom全称是医学数字图像与通讯,这里讲的暂不涉及通讯那方面的问题 只讲*.dcm 也就是diocm格式文件的读取,读取本身是没啥难度的 无非就是字节码数据流处理.只不过确实比较繁琐.好了 正题 分析 整体结构先是128字节所谓的导言部分,说俗点就是没啥意义的破数据 跳过就是了,然后是dataElement依次排列的方式 就是一个dataElement接一个dataElement的方式排到文件结尾 通俗的讲dataElement就是指tag 就是破Dicom标准里

背景: 如前一篇专栏博文所述,借助于CGI或FastCGI技术转发浏览器发送过来的用户请求,启动本地的DCMTK和CxImage库响应.然后将处理结果转换成常规图像返回到浏览器来实现Web PACS.本博文通过实际的代码測试来验证这一模式的可行性,同一时候对C语言编写CGI脚本提出了一些问题. 难题: 计划參照DCMTK自带工具dcm2pnm.exe的源代码.通过DicomImage将DCM文件转换成BMP文件,然后利用CGI技术返回到浏览器.实现一次简单的WEB PACS的影像传输模拟.详细的

背景: 上一篇博文简单翻译了Orthanc官网给出的CodeProject上“利用Orthanc Plugin SDK开发WADO插件”的博文,其中提到了Orthanc从0.8.0版本之后支持快速查询,而原本的WADO请求需要是直接借助于Orthanc内部的REST API逐级定位.那么为什么之前的Orthanc必须要逐级来定位WADO请求的Instance呢?新版本中又是如何进行改进的呢?此篇博文通过分析Orthanc内嵌的SQLite数据库,来剖析Orthanc的RESTful API机制,

  目录(?)[-] 背景 DICOM Print服务数据流 DICOM Print服务各部分关系 DICOM Print服务具体实现   背景: 昨天专栏中发表了一篇关于DICOM Print的博文DICOM:DICOM Print服务中PresentationContext协商之 MetaSOPClass与SOPClass对比分析,文章从部署中遇到的实际情况出发,对DICOM Print中的连接协商(Association Negotiation)进行了剖析,本文可看做是上一篇博文的补充,重

加入实验室后,经过张老师的介绍,有幸与某公司合共共同完成某个项目,在此项目中我主要负责的是三维 pdf 报告生成.Dicom图像上亮度.对比度调整以及 Dicom图像三维重建.今天主要介绍一下完成Dicom图像三维重建的过程以及自己的心得体会.实现Dicom三维图像重建最主要用的VTK(Visualization Toolkit,也就是可视化工具包),由于今天的主题不是有关VTK,所以有关VTK的学习(包括VTK介绍.使用.实列),可以参考此链接:https://blog.csdn.net/wi

看 DICOM 标准有一段时间了,前面几篇也介绍了一下 DIMSE-C 消息服务,具体参看Dicom 学习笔记-Dicom 消息服务(DIMSE-C/DIMSE-N),本文就介绍一下 DICOM 标准中的一个重要服务- Worklist 服务. Worklist 服务简介   首先来看一下 DICOM 标准中的说明: A worklist is the structure to present information related to a particular set of tasks. I

SimpleITK 和 Nibabel 区别在于:(nii图像可以看成2维,也可以看成三维) SimpleITK读取数据是(X,Y,Z)显示,Nibabel读取图像是(Z,Y,X)显示,也就是Nibabel加载的图像会旋转90°,其中X表示通道数,即切片层数.详情 import SimpleITK as sitk import skimage.io as io def read_img(path): img = sitk.ReadImage(path) data = sitk.GetArrayF

在处理医疗数据时,经常要跟DICOM文件打交道.在使用Python处理时,不得不提常用的pydicom模块. import pydicom DICOM文件读取 pydicom.read_file()读取dicom文件信息: dcm = pydicom.read_file(dicom_path) pydicom.dcmread()读取dicom文件信息: dcm = pydicom.dcmread(dicom_path) 以上两种方法得到的dcm没有区别. 输出dicom中某个信息: print(

经常有人问这种问题,用了些时间java之后,发现这俩玩意除了一小部分壳子长的还有能稍微凑合上,基本上没什么相似之处,可以说也就是马甲层面上的相似吧,还是比较短的马甲... 一般C#多用于业务系统的开发,快速实现,微软官方的各种封装,各种语法糖,使得c#在语义语法层面上更人性化,开发思路更专注于业务逻辑,对技术的实现并不需要关心的很细(当然这是指初级的入门程度),不过也带来的一些缺陷,当表面上的功夫不能满足的时候,.net程序员就不得不去了解微软封装起来的东西,所以我认识的.net程序员几乎人手一

jqery的语法和js的语法一样,算是把js升级了一下,这两种语法可以一起使用,只不过是用jqery更加方便 一个页面想要使用jqery的话,先要引入一下jqery包,jqery包从网上下一个就可以,一般用带有min的,是压缩版的,如果还要引用其他js文件的话,一定要juery包在上面,其他的引用放在他下面 先来看看如果使用Juery的话,怎么来引用Juery包 这样来引用,然后就可以用Juery方法了 和js的语法一样,都是写在<script type = "text/javascrip

来微信支付有2年多了,从2年前的互联网模式转变为O2O模式,主要的场景是跟线下的商户去打交道,不像以往的互联网模式,有产品经理提需求,我们帮忙去解决问题. 转型后是这样的,团队成员更多需要去寻找业务的方向,思考能为商户或者业务做点什么来体现其身价值,这样的转变是机会也是挑战,我一直相信在特别的环境下能迅速磨练出了跨岗位技能和综合素质,然而一路走来也发现了自己的短板(所谓的产品思维),并非想提升就可以,有时候感到自己很无能. 于是这样熬过来,暗示自己保持积极乐观的心态,平时使用一些通用的方法来提醒