JCVI的seqid文件怎么定位染色体

2024-11-04

【比较基因组】McScan jcvi比较两个基因组共线性细节记录

目录软件的安装基因组的准备一些细节建议和示例软件的安装 Python版McScan(jcvi工具包):https://github.com/tanghaibao/jcvi 以前只有python2,现在已有python3版本,建议用py3.安装可用pip: pip install jcvi ##或开发版 pip install git+git://github.com/tanghaibao/jcvi.git pip可能会安装很慢.建议还是用conda,要快很多,最好新建环境. conda

使用MAP文件快速定位程序崩溃代码行（转）

使用MAP文件快速定位程序崩溃代码行 =========================================================== 作者: lzmfeng(http://lzmfeng.itpub.net)发表于:2006.04.19 17:16分类: 摆脱程序出处:http://lzmfeng.itpub.net/post/15253/70530-------------------------------------------------------------

Vim 打开文件同时定位到某一行

在linux下,当后台某一行报警出错后,想用vim打开文件同时定位到某一行, Vim +某一行 filename 即可.

利用.dSYM跟.app文件准确定位Crash位置

本文转载至 http://blog.csdn.net/lvxiangan/article/details/28102629 利用.dSYM和.app文件准确定位Crash位置首先,确保在release(Ad Hoc或者App Store)一个版本时,保存了对应的xxx.app和xxx.dSYM文件. 其次,验证xxx.crash.xxx.app和xxx.dSYM三者的uuid是否一致. 验证方法: 1)查看xxx.app的uuid. $ dwarfdump --uuid mobi

2-vim-打开和新建文件-01-打开/新建文件/打开定位到文件指定行

1.新建或打开文件命令: vim 文件名在终端中输入vi在后面跟上文件名即可. 如果文件已经存在,会直接打开文件. 如果文件不存在,会新建一个文件. 2.打开文件并定位到文件指定行. 命令: vim 文件名 +行数例:打开hello.py文件并定位到12行. 注: 如果只带+而不指定行号,会直接定位到文件末尾. 命令: vim 文件名 + 例:打开hello.py文件并定位到末尾.

QT文件夹定位（网友提供）

#ifndef FOLDERFINDER_H #define FOLDERFINDER_H#include <QDir>class FolderFinder{public: QString absoluteFolderPath; //要转换的绝对路径 QString FolderPath; //要定位的文件夹名称 FolderFinder(const QString & filePath,const QString & folderPath) {

android 拍照上传文件原生定位

最近公司需要一个android拍照上传和定位功能的的单一功能页面,一开始选择ionic cordova angular的一套H5框架,但是遇到和上传文件报错的问题,bug找了一天没找到原因,怀疑是ionic版本问题,但是不重要了,不过有想继续研究问题的代码给你们,加油呀 git@github.com:tsxylhs/ionic-image-upload.git 因为赶的急临时抱佛脚,一天的时间将android入门然后写了这个Demo 希望大家共同学习,全栈就得有个全栈的样子你说对不,现在说正事

Doris开发手记3：利用CoreDump文件快速定位Doris的查询问题

Apache Doris的BE部分是由C++编写,当出现一些内存越界,非法访问的问题时会导致BE进程的Crash.这部分的问题常常较难排查,同时也很难快速定位到对应的触发SQL,给使用者带来较大的困扰.所以下面会介绍通过Linux的CoreDump快速定位到问题SQL,并复现问题的方式. 1.查看日志当BE进程Crash的时候,可以先查看be.out日志,确认是否存在stack trace的记录.当BE出现进程Crash的时,都会将运行时的堆栈打印到be.out文件中,一般如下图所示: 但是由

Delphi dbf文件如何定位记录（即设置Table的RecNum属性来移动到该记录号）

Delphi的table的RecNum属性,可以用来定位记录,如:self.Table1.RecNum:=23;即可以让数据库记录移动到23号记录上,但这种作用仅限于Paradox数据库,而不是dBASE数据库.如何解决这个问题,可以如下处理: unit DBTables; ... procedure TBDEDataSet.SetRecNo(Value: Integer); begin CheckBrowseMode; if (FRecNoStatus = rnParadox) and (Va

【转】利用.dSYM和.app文件准确定位Crash位置

http://blog.csdn.net/jinzhu117/article/details/20615991 首先,确保在release(Ad Hoc或者App Store)一个版本时,保存了对应的xxx.app和xxx.dSYM文件. 其次,验证xxx.crash.xxx.app和xxx.dSYM三者的uuid是否一致. 验证方法: 1)查看xxx.app的uuid. [plain] copy $ dwarfdump --uuid mobileguard.app/mobileguard

Visual Staudio 2015 打开指定文件，定位到指定文件目录下

Visual Staudio 2015 项目定位文件位置每次使用的Visual Staudio 2015 写代码的时候总是打开了.cs文件或xaml文件时, 还要手动去找该文件位置,每次都要翻好大一堆目录,其实是有快捷方式的,在此记录一下. 打开VS2015-工具-选项-项目和解决方案- 勾选“在解决方案资源管理器中跟踪活动项” 即可.

前端学习笔记--CSS布局--文件流定位

1.概述 2.文档流定位:从上到下,从左到右代码: <!DOCTYPE html> <html lang="en"> <head> <meta charset="UTF-8"> <title>Document</title> <style type="text/css"> *{ margin: 0; padding: 0;/* 去掉默认样式*/ } #nav{

用windbg查看dmp文件，定位bug位置

windbg + .dmp + .pdb + 源代码,可以看到是哪个代码崩溃的设置符号文件所在路径 File->Symbol File Path... 在输入框中填入.pdb文件所在的文件夹路径设置源代码路径 File->Source File Path... 在输入框中填入源代码所在的文件夹路径然后,打开.dmp文件,随后在列出一堆信息的后面,点击!Analysis-V超链接, 分析出具体出bug的代码未知

统计进程打开了多少文件，定位too many open files

[root@ostack1 ~]# lsof -p 18628 | wc -l 114

如何定位Release 版本中程序崩溃的位置 ---利用map文件拦截windows崩溃函数

1 案例描述作为Windows程序员,平时最担心见到的事情可能就是程序发生了崩溃(异常),这时Windows会提示该程序执行了非法操作,即将关闭.请与您的供应商联系.呵呵,这句微软的“名言”,恐怕是程序员最怕见也最常见的东西了. 在一个大型软件的测试过程中,初期出现程序崩溃似乎成了不可避免的事.其实测试中出现程序崩溃并不可怕,反而是测试的成功.作为开发的我们更需要关心的是程序中的哪个函数或哪一行导致了系统崩溃,这样才能有针对性的进行改正. 本文描述了自己总结的几种定位崩溃的办法.

VS2008通过 map 和 cod 文件定位崩溃代码行

VS 2005/2008使用map文件查找程序崩溃原因一般程序崩溃可以通过debug,找到程序在那一行代码崩溃了,最近编一个多线程的程序,都不知道在那发生错误,多线程并发,又不好单行调试,终于找到一个比较好的方法来找原因,通过生成map文件,由于2005取消map文件生成行号信息(vc6.0下是可以生成行号信息的,不知道microsoft怎么想的,在2005上取消了),只能定位在那个函数发生崩溃.这里可以通过生成cod文件,即机器码这一文件,具体定位在那一行崩溃. 首先配置vc2005生成ma

core文件无堆栈信息定位的思路

首先需要介绍一下,阅读此文需要有基本的汇编知识. 1.rbp(基址寄存器),rsp(堆栈寄存器),rip(指令寄存器). 2.程序执行时,没有遇到函数调用时,IP自增长,遇到函数调用时, 需要保存bp,ip寄存器到栈上,函数调用结束时,恢复.(这个过程的细节需要很清楚) (注:因此需要简单描述一下,函数调用时的步骤. 第一,将函数执行完成后的下一条指令的地址存放进当前rsp的位置,(即结束时,ret命令利用此信息恢复rip) 第二,进入函数后,保存当前rsp到rbp寄存器中,原因是rsp需要随时

第9.9节 Python文件随机读写定位操作方法seek

类似于C语言,Python也提供了文件位置定位的操作方法seek. 一. 语法 seek(offset, whence=SEEK_SET) 语法释义: 1)offset :将文件当前操作位置移动偏移量offset指定的字节数,移动开始位置由whence指定 2)whence:指从文件哪个位置开始进行定位,即参照位置,有如下取值: 二. 注意只有采用二进制模式打开的文件,才允许使用从文件末尾和文件当前位置进行偏移定位,非二进制的文本文件,不允许使用基于文件末尾和文件当前位置进行偏移定位.因此文本

[APUE]系统数据文件与信息

一.口令文件 UNIX口令文件包含下表中的各个字段,这些字段包含在由于历史原因,口令文件是/bin/passwd,而且是一个文本文件,每一行都包括了上表中的七个字段,字段之间用":"分隔,例如一个文件中可能有以下三行: root:jheVopR58x9Fx:0:1:The superuser:/:/bin/sh n o b o d y : * : 6 5 5 3 4 : 6 5 5 3 4 : : / : stevens:3hKVD8R58r9Fx:224:20:Richard St

Java:IO流与文件基础

Java:IO流与文件基础说明: 本章内容将会持续更新,大家可以关注一下并给我提供建议,谢谢啦. 走进流什么是流流:从源到目的地的字节的有序序列. 在Java中,可以从其中读取一个字节序列的对象称作输入流,可以向其中写入一个字节序列的对象称作输出流. ☑ 这些字节序列的来源可以是:文件.网络连接.内存块等. ☑ 抽象类InputStream和OutputStream是构成输入/输出(I/O)的基础. ☑ 因为面向字节的流不便于处理以Unicode形式存储的信息(字符),所以从抽象类Re

JCVI的seqid文件怎么定位染色体

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