Linux中fasta文件的拆分与合并 FASTA文件的拆分: (1)如果从一个文件a提取第11至20个序列存到另一个文件b: awk -v RS='>' 'NR>1{i++}i>=10&&i<=21{print ">"$0}' a.fasta|sed '/^$/d'>b.fasta (2)将某一文件a中每一条序列保存到一个文件中: awk '/^>/{f=++d".fasta"} {print > f

Linux合并文件命令: awk '{printf("%s\n",$0)}' YQ-*101?.txt >  123.txt   linux去除重复行命令:cat YQ-101.txt | sort | uniq > YQ-uniq-101.txt 

纯文本文件比较和合并工具一直是软件开发过程中比较重要的组成部分,vimdiff 能够在比较出来的多处差异之间快速定位,很容易的进行文件合并操作.在需要快速比较和合并少量文件的时候,vimdiff是很好的选择. vimdiff 基本用法: 首先保证系统中的diff命令是可用的.Vim的diff模式是依赖于diff命令的. 启动方法1. vimdiff file1 file2 …2. vim -d file1 file2 … 差异点跳转]c 下一个差异点[c 上一个差异点n]c 转到下面第n个差异点

存在file1.txt,其内容如下: H aa 0 0 1 -9 H bb 0 0 2 -9 H cc 0 0 2 -9 存在file2.txt,其内容如下: H aa 0 0 0 -9 asd qwe H bb 0 0 0 -9 fgh rty H cc 0 0 0 -9 jkl uio 现希望根据file1和file2相同的列字符合并文件,要求如下:1.如果两个文件的第二列相同,则将file2的第三列.第四列.第五列.第六列修改为file1对应的第三列.第四列.第五列.第六列内容:2.新文件

文件排序 seq: 产生一系列的数字; man seq查看其具体使用.我们这使用seq产生下游分析所用到的输入文件. # 产生从1到10的数,步长为1 $ seq 1 10 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 # 产生从1到10的数,步长为1,用空格分割 $ seq -s ' ' 1 10 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 # 产生从1到10的数,步长为2 # 如果有3个数,中间的数为步长,最后一个始终为最大值 $ seq -s ' ' 1 2 10 1 3 5 7 9 $ cat

--译自Linux3.9.5 Kernel Makefiles(内核目录documention/kbuild/makefiles.txt) kbuild(kernel build) 内核编译器 This document describes the Linux kernel Makefiles 本文档介绍了Linux内核的Makefile === Table of Contents === 目录 === 1 Overview === 1 概述 === 2 Who does what === 2

1.创建文件夹#!/bin/shmkdir -m 777 "%%1" 2.创建文件#!/bin/shtouch "%%1" 3.删除文件#!/bin/shrm -if "%%1" 4.删除文件夹#!/bin/shrm -rf "%%1" 5.删除一个目录下所有的文件夹#!/bin/bashdirec="%%1" #$(pwd)for dir2del in $direc/* ; doif [ -d $dir2

linux查看日志文件内容命令tail.cat.tac.head.echo tail -f test.log你会看到屏幕不断有内容被打印出来. 这时候中断第一个进程Ctrl-C, ---------------------------linux 如何显示一个文件的某几行(中间几行) 从第3000行开始,显示1000行.即显示3000~3999行cat filename | tail -n +3000 | head -n 1000 显示1000行到3000行cat filename| head -

linux查看日志文件内容命令tail.cat.tac.head.echo tail -f test.log你会看到屏幕不断有内容被打印出来. 这时候中断第一个进程Ctrl-C, ---------------------------linux 如何显示一个文件的某几行(中间几行) 从第3000行开始,显示1000行.即显示3000~3999行cat filename | tail -n +3000 | head -n 1000 显示1000行到3000行cat filename| head -

cat:基本是最常用的查看文件内容的linux命令. more 也是用来查看一个文件的内容.当文件内容太多,一屏幕不能占下,而你用cat肯定是看不前面的内容的,那么使用more就可以解决这个问题了.当看完一屏后按空格键继续看下一屏.但看完所有内容后就会退出.如果你想提前退出,只需按q键即可. less 作用跟more一样,但比more好在可以上翻,下翻.空格键同样可以翻页,而按"j"键可以向下移动(按一下就向下移动一行),按"k"键向上移动.在使用more和less

转:https://www.cnblogs.com/zdz8207/p/linux-log-tail-cat-tac.html linux查看日志文件内容命令tail.cat.tac.head.echo tail -f test.log你会看到屏幕不断有内容被打印出来. 这时候中断第一个进程Ctrl-C, ---------------------------linux 如何显示一个文件的某几行(中间几行) 从第3000行开始,显示1000行.即显示3000~3999行cat filename

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linux中删除文件内空白行的几种方法 有时你可能需要在 Linux 中删除某个文件中的空行.如果是的,你可以使用下面方法中的其中一个.有很多方法可以做到,但我在这里只是列举一些简单的方法. 你可能已经知道 grep.awk 和 sed 命令是专门用来处理文本数据的工具. 下列 5 种方法可以做到. ◈ sed:过滤和替换文本的流编辑器. ◈ grep:输出匹配到的行. ◈ cat:合并文件并打印内容到标准输出. ◈ tr:替换或删除字符. ◈ awk:awk 工具用于执行 awk 语言编写的程

vimdiff 快速比较和合并少量文件 原文:http://www.cnblogs.com/abeen/p/4255754.html 纯文本文件比较和合并工具一直是软件开发过程中比较重要的组成部分,vimdiff 能够在比较出来的多处差异之间快速定位,很容易的进行文件合并操作.在需要快速比较和合并少量文件的时候,vimdiff是很好的选择. vimdiff 基本用法: 首先保证系统中的diff命令是可用的.Vim的diff模式是依赖于diff命令的. 启动方法1. vimdiff file1 f

  版权:  凌云物网智科实验室< www.iot-yun.com > 声明:  本文档由凌云物网智科实验室郭工编著! 作者:  郭文学< QQ: 281143292  guowenxue@gmail.com>  版本:  v1.0.0   1. Device Tree简介     Linus Torvalds在2011年3月17日的ARM Linux邮件列表宣称“this whole ARM thing is a fucking pain in the ass”,引发ARM Li

linux命令截取文件最后n行(所有命令) tail -n a.txt > b.txt 联想:系统信息 arch 显示机器的处理器架构(1) uname -m 显示机器的处理器架构(2) uname -r 显示正在使用的内核版本 dmidecode -q 显示硬件系统部件 - (SMBIOS / DMI) hdparm -i /dev/hda 罗列一个磁盘的架构特性 hdparm -tT /dev/sda 在磁盘上执行测试性读取操作 cat /proc/cpuinfo 显示CPU info的信息

  在认识ImageMagick之前,我***的图像浏览软件是KuickShow,截图软件是KSnapShot,这两款软件都是KDE附带的软件,用起来也是蛮方便的.在一次偶然的机会中,我遇到了ImageMagick,才发现Linux竟然有如此功能强大的图像软件. 你将会发现,大部分的操作,你只要在终端下动动键盘即可,省得你用鼠标点来点去. 下面,我对ImageMagick的主要功能做一个简单的介绍,其中覆盖的大都是人们常用的一些功能,如果你要全面的了解它的知识,你可以看看它的man手册. con

1.1文件夹创建-复制-移动-重命名-删除1.创建文件夹mkdir zjbdir 2.复制文件/文件夹复制文件到:当前目录cp -r zjbdir  zjbdir201600819复制文件到:当前目录下的putdir/dirson目录中cp -r zjbdir  ./putdir/dirson复制文件到:指定目录下cp -r zjbdir  /home备注:-r 递归复制命令(复制子目录信息) 3.文件/文件夹移动(即在当前目录下将文件删除了)移动文件到:当前目录mv zjbdir2016008