maftools做突变瀑布图

2024-11-07

maftools | 从头开始绘制发表级oncoplot（瀑布图）

本文首发于微信公众号 **“ 生信补给站 ”** ,期待您的关注!!! 原文链接:https://mp.weixin.qq.com/s/G-0PtaoO6bYuhx_D_Rlrlw 对于组学数据的分析和展示来说,maftools算是一个宝藏“R包”,可用于MAF格式的组学数据的汇总,分析和可视化展示. 随着癌症基因组学的进步, 突变注释格式+Specification) (MAF) 被广泛用于存储检测到的somatic variants.The Cancer Genome Atlas 项目对

教你用Python创建瀑布图

介绍对于绘制某些类型的数据来说,瀑布图是一种十分有用的工具.不足为奇的是,我们可以使用Pandas和matplotlib创建一个可重复的瀑布图. 在往下进行之前,我想先告诉大家我指代的是哪种类型的图表.我将建立一个维基百科文章中描述的2D瀑布图. 这种图表的一个典型的用处是显示开始值和结束值之间起“桥梁”作用的+和-的值.因为这个原因,财务人员有时会将其称为一个桥梁.跟我之前所采用的其他例子相似,这种类型的绘图在Excel中不容易生成,当然肯定有生成它的方法,但是不容易记住. 关于瀑布图需要记

ComplexHeatmap|根据excel表绘制突变景观图（oncoplot）

本文首发于“生信补给站”:https://mp.weixin.qq.com/s/8kz2oKvUQrCR2_HWYXQT4g 如果有maf格式的文件,可以直接oncoplot包绘制瀑布图,有多种展示和统计maftools | 从头开始绘制发表级oncoplot(瀑布图)和maftools|TCGA肿瘤突变数据的汇总,分析和可视化,如果只有多个样本的基因突变与否的excel,不用担心,也可以用complexheatmap包绘制. 这个包功能很强大,本次只简单的介绍如何绘制基因组景观图(瀑布图).

Excel催化剂图表系列之品味IBCS瀑布图观察企业利润构成

IBCS图表,每个细节都值得反复琢磨参悟,此篇给大家送上详尽的瀑布图方式下的利润数据观察.请不要拿Excel2016版提供的瀑布图与IBCS版的瀑布图作对比,那完全不是一个级别的,可以类比为拿一辆经济型小车和一辆特拉斯来对比,没有可比性. Excel原生的设计图表从来都只有被吐槽的份千呼万唤出来的Excel新图表,真的好用么?真的够用么?从来对图表有点追求的人都很不屑于用Excel原生图表出来的效果,颜色丑,看多两眼就显呆板,就连新出的一堆瀑布图.树状图.漏斗图等也不出例外. 当一般普通用户用

Tableau绘制漏斗图、甘特图、瀑布图、镶边面积图、阴影坡度图

Tableau绘制漏斗图.甘特图.瀑布图.镶边面积图.阴影坡度图本文首发于博客冰山一树Sankey,去博客浏览效果更好.直接右上角搜索该标题即可一. 漏斗图数据源 1.1 分色直条漏斗图 (1)导入数据 (2)将[数量]拖到行这一栏,将[阶段]拖到标记下的颜色选项卡吗,之后对数量进行降序排列. (3)把[数量]拖到标记下的大小选项卡,视图设置为整个视图 (4)把[阶段],[数量]拖到标签选项卡,并对数量进行快速表计算--合计百分比. (5)下面的图形由于太少而导致无法显示标签,对此可手动的

compass做雪碧图

由于最近没什么时间好好写博文,我把用sass做雪碧图的关键点贴出来方便自己记忆: config.rb注释 # Set this to the root of your project when deployed: #配置服务器路径 http_path = "http//:www.baidu.com/" #配置css sass images javascripts路径 css_dir = "public/stylesheets" sass_dir = "pu

ComponentOne的C1Chart做饼状图怎么显示其百分比

问题:ComponentOne的C1Chart做饼状图怎么显示每部分的百分比描述: 我用C1Chart做饼状图的时候,不知道怎么显示其百分比在对应的区域上,求解. 目前做的效果(附加代码所生成的饼状图),没有百分比,如图所示. 现在的需求是:需要显示每部分具体百分比在饼状图型上,效果如图所示. 我对C1Chart不是很熟悉,个人感觉C1Chart应该提供了此功能,但是尚未找到. 希望大家能帮忙解决下,十分感谢. 附加部分代码: private void InitReducePie(Hashta

看懂 Fiddler 的瀑布图

最近准备给组内的新同学们分享下 Fiddler 这枚神器,可以讲的地方太多,我打算把一节课讲不完的内容写在博客上,大家可以随便看看.今天先介绍下 Fiddler 的瀑布图. 每个网络请求都会经历域名解析.建立连接.发送请求.接受数据等阶段.把多个请求以时间作为 X 轴,用图表的形式展现出来,就形成了瀑布图.在 Fiddler 中,只要在左侧选中一些请求,右侧选择"Timeline"标签,就可以看到这些请求的瀑布图,如下(点击查看大图): 看到这张图,你是否可以回答这些问题: 图标的 Y

用js和jQuery做轮播图

Javascript或jQuery做轮播图 css样式 <style> a{ text-decoration:none; } .naver{ width: 100%; position:relative; } .images{ position:relative; width: 100%; height: 400px; } .images img{ position:absolute; left: 0; top: 0; width: 100%; height: 400px; opacity:

解决“用PicGo-2.3.0-beta5 + GitHub做博客图床，github仓库图片文件不显示”的问题记录（备忘）

解决"用PicGo-2.3.0-beta5 + GitHub做博客图床,github仓库图片文件不显示"的问题记录(备忘) 历时几个小时百度,终于靠自己理解解决了GitHub仓库图片无法显示的问题,感谢百度!!!感谢互联网!!! 还好我没放弃看下图,遇到这种情况不要慌,如果你百度看到我这篇文章,那么恭喜你,你会节省大量百度时间!偷着乐吧,哈哈哈哈解决方案: 修改本地HOSTS文件对Github网站加载的资源域名解析,具体操作如下: 如何修改本地hosts文件呢?别急,我教你!

简单excel饼状图怎么做，bi工具怎么做饼状图

饼状图是为了在一个整体体现个体所占的比例,比如一块蛋糕每人各分多大份.了解了饼状图的含义,就来学习饼状图怎么做吧. 首先,我们准备excel表格饼状图的初始数据然后选择excel表格上方的插入,选择图表中的饼状图,其中excel饼状图有饼图.复合饼图.复合条饼图.圆环图和三维饼图,选择饼状图之后可以选择样式,效果如下 excel简单饼状图讲完了,bi工具在数据分析领域非常火,顺便讲讲bi工具怎么做饼状图这里选用思迈特软件Smartbi作为教学工具,不为别的,只是因为太好用了.首先进入Smar

用 CSS 做轮播图

对于用 css 实现一个轮播图的缘由,是那时候刚开始接触前端,完全还不懂 js.但是有一个项目(就是一个用来应付面试的作品)需要做一个轮播的效果,当时第一反应就是用 css3 自定义动画 -webkit-animation.做出来的效果自己觉得还可以,唯一的不足就是鼠标点击切换 banner 图和指定到某个图.如果项目中不需要切换变换图片的需求,用 css3 做,何尝不是一种办法.不多说,先上代码: html 代码如下: <div class="test"> <a h

用FusionChartsFree做饼状图、柱状图、折线图的实例

1.先来看看要进行表现的页面:myChart.jsp <%@ page language="java" contentType="text/html; charset=utf-8" pageEncoding="utf-8"%><!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/

用highchaarts做股票分时图

1.首先向社区致敬给予灵感参考: https://bbs.hcharts.cn/thread-1985-1-1.html(给予参考的的例子js配置代码未进行压缩,可以清楚看到配置信息) 2.公司是金融数据公司,业务需要,需要在web页面展示大量图表(highcharts 居多,d3一部分项目项目用到),但是网上没有现成的用highcharts 做成的股票分时图,我就参考我们的大客户京东金融的部分页面效果,https://fund.jd.com/detail/101925.htm,和云财经ht

React Native 如何做轮播图 react-native-swiper

//:仿饿了么github:https://github.com/stoneWeb/elm-react-native 欢迎各位同学加入: React-Native群:397885169 大前端群:544587175 大神超多,热情无私帮助解决各种问题. 最近项目需求需要用到轮播图,所以写两Demo练练手,不过效果不太理想,希望大牛予以指正. 不多说,先上图. 这种轮播很常见,但是一个问题是,总感觉有点卡的感觉,最气人的是,你滑动到哪里,他就听到哪里,给用户感觉很不爽! 下面我分享一下该轮播的代码

报告撰写，linux使用gimp简单做gif动图

我想把我的系统菜单完整记录下来,方便查看,如果单纯使用文字比较单调,使用屏幕截图,需要依次打开多个图像查看也不是很方便,就想到了使用动画的形式展示.由于本人的系统一直使用Linux系统,为了一张gif动画再去回到windows中看微软的脸色,这不是我的风格.因此以下环境都是在Manjaro Linux下,屏幕截图.图像处理等均是.整个过程需要三个软件:gimp.spectacle和linux了,如果没有这些,以下文字对你没有任何用处,不要浪费时间了. 一.预备处理: 如果你已经安装了linux,

用avalon框架怎么做轮播图?

avalon这个框架其实特别的小众,做个轮播图呢?在github上的例子只有一个,而且功能特别的少,有的引入的插件与avalon里面的指令又不兼容,所以找了一个owl-carousel,目前实现了移动端的自动轮播和手滑动,其中导航点还在尝试~ <div class="page-banner owl-carousel owl-theme owl-loaded owl-drag" id="slideshow" style="max-width: 37.5

从零开始教你做高保真原型图+UI 设计规范

编者按:<从零开始设计App>系列到这篇已经是第三期了,上期是低保真原型图,这期@Sophia的玲珑阁聊聊如何从零开始制作高保真原型图和UI 设计规范. 往期回顾: <设计师怎样从零开始设计一款APP?> <从零开始设计一款APP之如何做原型图> Hi-fi 输出上篇文章提到,在Hi-fi阶段大概可以分为前期.中期和后期三个阶段.这篇文章就是对Hi-fi阶段的详细解说. 前期前期的主要任务是hero screen(主功能页面)的尝试设计,通过它进行视觉风格上的确定

echarts做飞线图

先上图,要不感觉没有说服力: 飞线图应该是大屏中很常见的一种了,通常你可以很轻易的用datav做一个飞线图,而且datav做的大屏逼格真的很高,本身也是开源免费的项目,开箱即用,上手简单……行了回归正题,我们使用echarts自己配置一个飞线图.当然echarts配置起来也不复杂,只要查看下面对应几个属性的配置就ok了 geo serise 里的effectScatter serise 里的lines 三个配置,geo画地图,effectScatter在地图上画散点图,lines画线集,熟悉ec

jQuery做轮播图

这是我自己做的一个简单的轮播图,效果图如下: 我觉得轮播图中最主要的是要理解到图片为什么会滑动,是怎么控制的.上面这个我自己做的,是搭好的一个结构,在无序列表中插入需要的图片.然后在插入图片的后面添加一个空的无序列表,作为轮播图中下方的小点. <div class="box"> <ul class="imageList"> <li><img src="img/轮播1.jpg"/></li>

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