### miRNA特点 (1)广泛存在于真核生物中, 是一组不编码蛋白质的短序列RNA,它本身不具有开放阅读框架(ORF),并且由不同于mRNA的独立转录单位表达. (2)通常的长度为20-24 nt,但在3′端可以有1-2 个碱基的长度变化(对miRNA 的具体长度范围尚无统一标准). (3)成熟的miRNA , 5′端有磷酸基团, 3′端为羟基,且具有独特的序列特征.它们可以和上游或下游的序列不完全配对形成茎环结构. (4)miRNA5′端第一个碱基对U有强烈的倾向性,而对G却有抗性,但第2

生物信息学 GU也可以配对,即“wobble” pairing GU. Hairpin发夹结构,最少不能少于3个碱基.没有配对 Bulge 单侧配对 Loop双侧配对 假结,游离的leading edge与hairpin相结合.大部分软件不考虑此结构. 表示RNA5种结构: 如果有假结,则环形图会有交叉: 颜色代表稳定性: 但是RNA序列较长则得到正确的预测比较困难,因为配对可能性上升.所以采用150bp以内的序列预测比较准确. 常用方法: 1.共变化(进化)方法,基于相似性比对. 2.单序列预

庐州月光 如何提取一个转录本的3'UTR区域的序列 在做microRNA 和 mRNA 相互作用预测的时候,大家都知道microRNA 作用的靶点是位于mRNA 的3'UTR取,所以只需要提取mRNA 对应的3'UTR 区的序列去做分析即可: 那么如何提取一个mRNA的3'UTR区呢? 在UCSC数据库中,提供了3'UTR区序列的下载,以人类hg19为例, 利用table browser 浏览器选择对应的序列 链接:http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTables

MicroRNA in Control of Gene Expression:An Overview of Nuclear Functions微RNA控制基因表达:核功能概述 抽象:小的非编码RNA(ncRNA)能够以序列特异性方式控制基因表达的发现对生物学产生了巨大影响.最近的改进很高吞吐量排序和计算预测方法已经允许发现和几种类型的ncRNA的分类.基于它们的前体结构,生物发生途径和作用模式,ncRNA被分类为小干扰RNA(siRNAs),microRNAs(miRNA),PIWI相互作用的R

笔记转载于GitHub项目:https://github.com/NLP-LOVE/Introduction-NLP 5. 感知机分类与序列标注 第4章我们利用隐马尔可夫模型实现了第一个基于序列标注的中文分词器,然而效果并不理想.事实上,隐马尔可夫模型假设人们说的话仅仅取决于一个隐藏的{B.M,E,S序列,这个假设太单纯了,不符合语言规律.语言不是由这么简单的标签序列生成,语言含有更多特征,而隐马弥可夫模型没有捕捉到.隐马弥可夫模型能捕捉的特征仅限于两种: 其一,前一个标签是什么:其二,当前字符

原文地址 序列图主要用于展示对象之间交互的顺序. 序列图将交互关系表示为一个二维图.纵向是时间轴,时间沿竖线向下延伸.横向轴代表了在协作中各独立对象的类元角色.类元角色用生命线表示.当对象存在时,角色用一条虚线表示,当对象的过程处于激活状态时,生命线是一个双道线. 消息用从一个对象的生命线到另一个对象生命线的箭头表示.箭头以时间顺序在图中从上到下排列. 序列图中涉及的元素: 1. 生命线: 生命线名称可带下划线.当使用下划线时,意味着序列图中的生命线代表一个类的特定实例. 2. 同步消息 发送人

阅读目录: 概述 DeviceFamily-Type文件夹 DeviceFamily-Type扩展 InitializeComponent重载 结论 概述 Windows10-UWP(Universal Windows Platform)增加一个新特性设备序列(DeviceFamily)特定视图,它允许开发者为指定的设备序列定义指定的XAML显示,(Desktop.Mobile.tablet.Iot等). 如果你想为不同的设备序列显示较多不一样的UI时,它是非常有用的.当然,使用Relative

俗话说,自己写的代码,6个月后也是别人的代码……复习!复习!复习! 软件工程的一般开发过程:愿景分析.业务建模,需求分析,健壮性设计,关键设计,最终设计,实现…… 时序图也叫序列图(交互图),属于软件工程里的第二步——业务建模阶段里的图,业务建模要求我们把视角从系统转向组织,要站在客户的角度看问题,以达到清晰准确地“知彼”,术语就是从组织的角度来定位系统的价值,从而避免软件项目的失败,因为大量软件项目失败的原因都是一个——最终实现和用户需求不一致!故业务建模也叫组织建模,切记在业务建模和需求分析

初识python备忘: 序列:列表,字符串,元组len(d),d[id],del d[id],data in d函数:cmp(x,y),len(seq),list(seq)根据字符串创建列表,max(args),min(args),reversed(seq),sorted(seq),tuple(seq)列表方法:append()末尾添加对象,count()对象计数,extend()末尾添加列表,index()第一个匹配对象的位置,insert()插入对象,pop()移除对象,默认为末尾,remo

1251: 序列终结者 Time Limit: 20 Sec  Memory Limit: 162 MBSubmit: 3778  Solved: 1583[Submit][Status][Discuss] Description 网上有许多题,就是给定一个序列,要你支持几种操作:A.B.C.D.一看另一道题,又是一个序列 要支持几种操作:D.C.B.A.尤其是我们这里的某人,出模拟试题,居然还出了一道这样的,真是没技术含量……这样 我也出一道题,我出这一道的目的是为了让大家以后做这种题目有一个

显然n方算法在比赛中是没有什么用的(不会这么容易就过的),所以nlogn的算法尤为重要. 分析: 开2个数组,一个a记原数,f[k]表示长度为f的不下降子序列末尾元素的最小值,tot表示当前已知的最长子序列的长度 考虑进来一个数a[i], 1.如果a[i]>=f[tot],那么接上去即可 2.如果这个元素小于f[tot]呢?说明它不能接在最后一个后面了.那我们就看一下它该接在谁后面. 准确的说,并不是接在谁后面.而是替换掉谁.因为它接在前面的谁后面都是没有意义的,再接也超不过最长的tot,所以是

Check whether the original sequence org can be uniquely reconstructed from the sequences in seqs. The org sequence is a permutation of the integers from 1 to n, with 1 ≤ n ≤ 104. Reconstruction means building a shortest common supersequence of the se

Given a binary tree, find the length of the longest consecutive sequence path. The path refers to any sequence of nodes from some starting node to any node in the tree along the parent-child connections. The longest consecutive path need to be from p

All DNA is composed of a series of nucleotides abbreviated as A, C, G, and T, for example: "ACGAATTCCG". When studying DNA, it is sometimes useful to identify repeated sequences within the DNA. Write a function to find all the 10-letter-long seq

Given an unsorted array of integers, find the length of the longest consecutive elements sequence. For example, Given [100, 4, 200, 1, 3, 2], The longest consecutive elements sequence is [1, 2, 3, 4]. Return its length: 4. Your algorithm should run i

The set [1,2,3,…,n] contains a total of n! unique permutations. By listing and labeling all of the permutations in order,We get the following sequence (ie, for n = 3): "123" "132" "213" "231" "312" "3

create sequence name increment by x //x为增长间隔 start with x //x为初始值 maxvalue x //x为最大值 minvalue x //x为最小值 cycle //循环使用,到达最大值或者最小值时,从新建立对象 cache x //制定存入缓存(也就是内存)序列值的个数 序列是一数据库对象,利用它可生成唯一的整数.一般使用序列自动地生成主码值.一个序列的值是由特别的Oracle程序自动生成.如果不设定cycle循环的话,每一个序列号是唯

题目描述 Description "神州"载人飞船的发射成功让小可可非常激动,他立志长大后要成为一名宇航员假期一始,他就报名参加了"小小宇航员夏令营",在这里小可可不仅学到了丰富的宇航知识,还参与解决了一些模拟飞行中发现的问题,今天指导老师交给他一个任务,在这次模拟飞行的路线上有N个行星,暂且称它们为一个行星序列,并将他们从1至n标号,在宇宙未知力量的作用下这N个行星的质量是不断变化的,所以他们对飞船产生的引力也会不断变化,小可可的任务就是在飞行途中计算这个行星序列

//给定N个整数序列{A1,A2,A3...An},求函数f(i,j)=(k=i~j)Ak的求和 # include<stdio.h> void main() { ,sum1; ]={,-,,,,,-,,,-};//数组要定义的时候直接全部赋值 //int a[10];!!!!! // a[10]={1,-2,3,4,5,6, //给定N个整数序列{A1,A2,A3...An},求函数f(i,j)=(k=i~j)Ak的求和 # include<stdio.h> void main(

[BZOJ1251]序列终结者 试题描述 网上有许多题,就是给定一个序列,要你支持几种操作:A.B.C.D.一看另一道题,又是一个序列 要支持几种操作:D.C.B.A.尤其是我们这里的某人,出模拟试题,居然还出了一道这样的,真是没技术含量--这样 我也出一道题,我出这一道的目的是为了让大家以后做这种题目有一个"库"可以依靠,没有什么其他的意思.这道题目 就叫序列终结者吧. [问题描述] 给定一个长度为N的序列,每个序列的元素是一个整数(废话).要支持以下三种操作: 1. 将[L,R]这

转载链接:http://www.cnblogs.com/zhangyoushugz/archive/2012/11/09/2762720.html 众所周知,在之前的sqlserver版本中,一般采用GUID或者identity来作为标示符,但是identity是一个表对象,只能保证在一张表里面的序列,当我们遇到以下情况时, 表1 ID 订单类型 价格 1 火车票 200 4 飞机票 2000 5 船票 600 表2 ID 订单类型 价格 2 酒店 400 3 公园门票 170 6 租车费用 3