目前有很多的数据库都存储了蛋白序列,比如NCBI Refseq, protein, swissprot 等,在各个数据库之间,或者是在某个数据库中,蛋白序列有大量冗余:为了方便使用,ncbi 构建了nr 库, 全称是 RefSeq non-redundant proteins: Non-redundant protein sequences from GenPept,  Swissprot, PIR, PDF, PDB, and NCBI RefSeq 完整的nr 数据库的蛋白序列和预先构建好的

目录 1.准备本地数据库文件 1.1 NR库下载 1.2 Taxonomy数据库下载 2.按物种拆分NR库 2.1 第一步:获得Aceesson和分类物种的对应关系 2.2 第二步:获得分类物种的序列 2.3 第三步:建库和比对 1.准备本地数据库文件 NR(Non-Redundant Protein Sequence Database)非冗余蛋白库,是所有GenBank+EMBL+DDBJ+PDB中的非冗余蛋白序列.Taxonomy物种分类数据库,包括大于7万余个物种的名字和系谱,这些物种都至

mysql执行的sql脚本中注释怎么写? mysql 服务器支持 # 到该行结束.-- 到该行结束 以及 /* 行中间或多个行 */ 的注释方格: mysql; # 这个注释直到该行结束 mysql; -- 这个注释直到该行结束 mysql ; mysql+ /* 这是一个 多行注释的形式 */ ; 注意 -- (双长划) 注释风格要求在两个长划后至少有一个空格! 尽管服务器理解刚才描述的注释句法,但 MySQL 客户端的语法分析在 /* ... */ 注释方式上还有所限止: 单引号和双引号被用

项目里新建表时model,mapper以及mapper.xml基本都是用Mybatis Generator(以下简称为MBG)自动生成的,但是MBG自动生成的model的注释实在有点非人类,至少中国人是完全接受不了的,在配置中禁用掉注释吧,倒是简单了,可是生成的model类光秃秃的,啥都没有,字段方法没有注释,使用很不方便,别人看也不知道这个字段是啥含义,到最后还是要自己添加,一张表多点几十个字段,特么添加累死了,不能这么干,得想法子,百度了一下网上,基本有两种方法,第一种,就是直接修改MGB的

原理 通过反射实体所在程序集,得到枚举值列表,再通过sql获取数据库表结构,两者拼接成sql. 规范 实体枚举字段最好也加上Description特性,方便多次更新: 代码 实体定义 public partial class ProviderContract : Entity<int> { /// <summary> /// 自增Id /// </summary> [Column("Id")] public override int Id { get

//修改注释 alter table user comment = '我要修改注释'; //新建表设定表注释及解释说明. create table AuthUser( ID ) primary key auto_increment comment '主键', NAME ) comment '姓名', CREATE_TIME date comment '创建时间' )comment = '用户信息表';

参考链接: FTP README 如何下载 NCBI NR NT数据库? 下载blast:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+ 先了解BLAST Databases:BLAST FTP Site   如何下载NCBI blast数据库? NCBI提供了一个非常智能化的脚本update_blastdb.pl来自动下载所有blast数据库. 脚本使用方法: perl update_blastdb.pl nr 有哪些可供下载的blast

C#可以通过反射读取类的字段/方法等,可是该如何获取该字段的XML注释? 具体目的:有一个实体类,页面需要有一个与其对应的table,样式大体为 <tr> <td>地东经</td> <td> <input id='txt_Longitude' type='text' class='form-control' name='Longitude' /></td> <td>北纬</td> <td> <

本人虽然不是专业开发人员,也非专业出身,但一直使用C#堆码,解决自己日常的小问题.包括自己的研究,也是用C#来实现和测试.对C#是情有独钟.虽然C#的很多高级技术不会用,也不太懂,但总归是知道,耳闻目染,都多多少少了解一点.因为研究开源组件和技术比较多的原因,经常翻别人的代码(大部分是国外的),免不了要翻译,所以我也是经常翻译和总结,例如我前2个翻译的一些机器学习的文章: [原创].NET平台机器学习组件-Infer.NET连载(一)介绍 [原创].NET平台机器学习组件-Infer.NET连载

MariaDB之基于Percona Xtrabackup备份大数据库[完整备份与增量备份] 1.Xtrabackup的安装 percona-xtrabackup-2.2.3-4982.el6.x86_64.rpm lftp 172.16.0.1:/pub/Sources/6.x86_64/Percona> get percona-xtrabackup-2.2.3-4982.el6.x86_64.rpm     yum -y install percona-xtrabackup-2.2.3-498

Github地址:https://github.com/pardom/ActiveAndroid 前言 我一般在Android开发中,几乎用不到SQLlite,因为一些小数据就直接使用Preferences保存了,最近涉及到了消息推送历史,或者涉及到信息历史方面的东西,所以就需要用到了android的SQLlite,为了不重复造轮子,果断上github寻找轮子. GreenDAO虽然效率最高,但由于每次都要手动生成代码,比较麻烦,所以弃用. Couchbase也有Android版本,同时支持配合

原文:小程序大智慧,sqlserver 注释提取工具 开篇背景 我习惯在写表的创建脚本时将注释直接写在脚本里,比如 /*账套*/ CREATE TABLE [dbo].[AccountingBook] ( [IDNO] NVARCHAR (255) NOT NULL, /*ID*/ [BH] NVARCHAR (255) NULL, /*业务编号*/ [Name] NVARCHAR (255) NOT NULL, /*名称*/ [Decription] NVARCHAR (255) NULL,

小程序大智慧,sqlserver 注释提取工具 开篇背景 我习惯在写表的创建脚本时将注释直接写在脚本里,比如 ? /*账套*/ CREATE TABLE [dbo].[AccountingBook] (     [IDNO]          NVARCHAR (255) NOT NULL,    /*ID*/     [BH]            NVARCHAR (255) NULL,        /*业务编号*/     [Name]          NVARCHAR (255) N

代码注释是架起程序设计者与程序阅读者之间的通信桥梁,最大限度的提高团队开发合作效率.也是程序代码可维护性的重要环节之一.所以我们不是为写注释而写注释.下面说一下Javadoc注释规范以及楼主在J2EE项目开发使用的代码注释规范,供大家参考下. 1. Javadoc注释规范 javadoc是Sun公司提供的一个技术,它从程序源代码中抽取类.方法.成员等注释形成一个和源代码配套的API帮助文档. javadoc命令是用来生成自己API文档的,使用方式:在dos中在目标文件所在目录输入javadoc

优化思路: 1.检查数据表结构,改善不完善设计 2.跑一遍主要业务,收集常用的数据库查询SQL 3.分析查询SQL,适当拆分,添加索引等优化查询 4.优化SQL的同时,优化代码逻辑 5.添加本地缓存和redis缓存 6.增加数据库硬件配置和增加读写分离 检查数据表结构 看数据表结构设计是否合理. 尽可能不要使用NULL值 建表的时候如果不对创建的值设置默认值,MYSQL设置默认都会为NULL. NULL使得索引维护更加复杂,强烈建议对索引列设置NOT NULL NOT IN.!=等负向条件查询在

背景 “那啥,你过来一下!” “怎么了?我代码都单元测试了的,没出问题啊!”我一脸懵逼跑到运维大佬旁边. “你看看!你看看!多少条报警,赶快优化一下!”运维大佬短信列表里面好多MySQL CPU 100%报警短信.再看看项目名称不就是我前几天刚发布的项目吗!? 我心底一沉,赶快赔上笑脸.“这个一定优化,马上优化!那个,能不能看下数据库监控日志...” 运维大佬又数落了我几句,然后调开了数据库监控日志. 那家伙...每秒300多的连接数,几乎快要封顶的全表扫描数,还有大红色CPU警报... “那个

博客园一位微软MVP的文章 http://www.cnblogs.com/asxinyu/p/4383402.html#autoid-0-0-0 摘录: 我这里说的奇葩,并不是脱离三种方式,而是其注释的位置,但是在浏览一段开源的代码的时候,发现了这个注释,当时吃惊,然后是思考,先看看: 上面一段代码包括了前面提到的3种注释方式,红色框里面的就是我说的 奇葩注释,用的是 /* */块方式,写在数组定义的中间,毫无疑问,这肯定是可以运行的.只是以前没想到可以这样,可能局限于自己的思维方式. 根据我的

Django框架,models.py模块,数据库操作——创建表.数据类型.索引.admin后台,补充Django目录说明以及全局配置文件配置 数据库配置 django默认支持sqlite,mysql, oracle,postgresql数据库. 1,django默认使用sqlite的数据库,默认自带sqlite的数据库驱动   引擎名称:django.db.backends.sqlite3 在全局配置文件settings.py可以看到确认配置使用的sqlite数据库 # Database # h

第1章 redis存储系统 1.1 redis概述 REmote DIctionary Server(Redis)是一个基于key-value键值对的持久化数据库存储系统.redis和大名鼎鼎的Memcached缓存服务软件很像,但是redis支持的数据存储类型比memcached更丰富,包括strings(字符串),lists(列表),sets(集合)和sorted sets(有序集合)等. 这些数据类型支持push/pop,add/remove及取交集,并集和差集及更丰富的操作,而且这些操作

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