r画图标签被省略了怎么办

2024-11-06

R绘图(3): 散点图添加文本注释

这里以火山图为例进行说明,在转录组分析中,火山图是很常见的一类图,纵轴表示p_value,横轴表示log (fold change).单一的散点图绘制很简单,火山图比较难处理的地方就是一些基因的注释,基因越多,加文本注释越困难,因为文字会堆在一起,看不清. 示例数据df1是转录组做差异表达后的部分结果,df2将logFC绝对值大于0.3的挑出来了. > head(df1) p_val avg_logFC class gene cd avg_logFC_new2 p_val_new 1 1.628

R画图

画图函数中的参数: 1.图形元素参数: pch:用于显示点的坐标,可以是一个字符,也可以是0到25的一个整数.如:pch=“+”,pch=1 lty:线条类型.如:lty=2,lty=1 lwd:线条宽度.如:lwd=2 col:点,线,文本,填充区域的颜色设置,col.axis, col.sub, col.main分别对应坐标轴标注,子标题,主标题颜色.如col=2, col.sub=2 font:字体设置.同上 cex:字符扩张率,这个值表示期望字符(包括绘图字符)大小相对默认大小的比率.

R画图——分屏

最近项目需求,用R画了一个九宫格的图,第一次画,将简化后的脚本呈现一下,不是有人说,既然做了,那就摆出来吧. *中文行为说明: args <- commandArgs(T) 调用命令行读取 file <- read.table(args[1]) 以表格形式读取第一个文件 my_len = length(args) 计算总文件数 a <- t(file[1]) 读取第一个文件第一列 #par(mfrow=c(3,3)) #绘制九宫格画布(3 x 3) nm = args[1] 定义画布的标

R画图中英文字体完美解决方案

在某些时候,需要在R画图中添加中文,但是默认情况下,R对中文的支持不好. 当用R画PDF图,并且图中有中文的时候,安装并加载如下包library(showtext)然后:showtext.auto(enable = TRUE)这句命令表示之后用上同样的字体.如果要添加字体:font.add('SimSun', regular = '/path/to/your/simsun.ttc')这个地方要注意,你必须给定指定的字体的位置.如果你使用的是MAC,可以打开 font book,查找你想要字体的位

R画图的颜色搭配

colors()函数列出当前已经支持的颜色名称 [19] "bisque3" "bisque4" "black" [22] "blanchedalmond" "blue" "blue2" [25] "blue3" "blue4" "blueviolet" [28] "brown" "brown1&q

H5中画图标签Canvas---画矩形，画线，画圆，渐变色，图形载入

一: 1.鼠标监视坐标值 <!DOCTYPE html> <head> <meta charset=UTF-8> <title>canvas的演示</title> <script src="D:\jquery\jquery-1.12.4.min.js""></script> </head> <body> <canvas id="tt" widt

隐函数画图with R

隐函数画图 with R 这个函数 sin(xsiny)-cos(ycosx)=0 图是这个样子怎么用R画出来呢?下面是代码 x<-y<-seq(-10,20,0.1) f<-function(x,y){sin(x*sin(y))-cos(y*cos(x))} z<-outer(x,y,f) contour(x,y,z) 用R画图结果展示第二个办法 implicitplot<-function(f,xrange=seq(-10,20,length=1000),yrange

R基本画图

参考内容:闻博,R语言的绘图功能及应用案例 https://wenku.baidu.com/view/80f22fa50029bd64783e2c22.html R画图是以函数操作为基本的画图模式. 画图函数可分为两种: 1.高级绘图函数:创建一个新的图形. 2.低级绘图函数:在现有图形上添加元素. 1.高级绘图函数: plot(x,y):以x元素为x轴,y元素为y轴作图,有多种type可供选择.p,散点图:l,线图:h,直方图:s,梯形图.等等. pie(x,label=names(x),.

R语言书籍的学习路线图

现在对R感兴趣的人越来越多,很多人都想快速的掌握R语言,然而,由于目前大部分高校都没有开设R语言课程,这就导致很多人不知道如何着手学习R语言. 对于初学R语言的人,最常见的方式是:遇到不会的地方,就跑到论坛上吼一嗓子,然后欣然or悲伤的离去,一直到遇到下一个问题再回来.当然,这不是最好的学习方式,最好的方式是——看书.目前,市面上介绍R语言的书籍很多,中文英文都有.那么,众多书籍中,一个生手应该从哪一本着手呢?入门之后如何才能把自己练就成某个方面的高手呢?相信这是很多人心中的疑问.有这种疑问的人

R语言一套内容从入门到放弃

[怪毛匠子整理] 1.下载 wget http://mirror.bjtu.edu.cn/cran/src/base/R-3/R-3.0.1.tar.gz 2.解压: tar -zxvf R-3.0.1.tar.gz cd R-3.0.1 3.安装 yum install readline-devel yum install libXt-devel ./configure 如果使用rJava需要加上 --enable-R-shlib ./configure --enable-R-shlib -

R语言：ggplot2精细化绘图——以实用商业化图表绘图为例

本文版权归http://www.cnblogs.com/weibaar 本文旨在介绍R语言中ggplot2包的一些精细化操作,主要适用于对R画图有一定了解,需要更精细化作图的人,尤其是那些刚从excel转ggplot2的各位,有比较频繁的作图需求的人.不讨论那些样式非常酷炫的图表,以实用的商业化图表为主.包括以下结构: 1.画图前的准备:自定义ggplot2格式刷 2.画图前的准备:数据塑形利器dplyr / tidyr介绍 3.常用的商业用图: 1)简单柱形图+文本(单一变量) 2)分面柱形图

用Canvas制作简单的画图工具

今天用Canvas制作了一个画图工具,非常简单,功能也不是很多,主要有背景网格,画线,画圆,画矩形和画圆角矩形,也用到了canvas的一些基本知识,在这里一一列举. 1.线段的绘制: 如何绘制真正的1像素的线段? 如果在像素边界处绘制一条1像素宽的垂直线段,那么canvas的绘图环境对象会试着将半个像素画在边界中线的右边,将另外半个像素画在边界中线的左边.然而,在一个整像素的范围内绘制半个像素宽的线段是不可能的,,所以左右两个方向上的半像素都被扩展为1像素.如图所示本来我们想要将线段绘制在深灰

springMVC之<context:annotation-config />标签

springMVC的配置文件中经常见到<context:annotation-config/>,那么这句话的作用到底是什么呢? 现在的注解非常方便,但是系统如何才能识别注解呢,这就需要相应的处理程序了,springMVC使用AnnotationBeanPostProcessor让系统能够识别相应的注解例如:如果你想使用Autowired注解,那么必须先在spring容器中声明AutoWiredAnnotationBeanPostProccessor的实例,如要使用@Required注解就必须

CentOS 6.5 无网环境安装R及Rstudio的方法的方法

在生产环节,一般是不联网的,下面介绍在无望环境如何安装R及R-studio 1. 安装CentOS for R语言的基础环境 1.1 libpng,X11,libjpeg等支持 yum -y install gcc gcc-c++ autoconf libjpeg libjpeg-devel libpng libpng-devel freetype freetype-devel libxml2 libxml2-devel zlib zlib-devel glibc glibc-devel gl

Js获取标签高度

能力有限:问个问题,标签相对页面高度,是怎么写? 鼠标的横坐标,X轴: event.clientX; 鼠标的竖坐标,Y轴: event.clientY; 网页可见区域宽: document.body.clientWidth; 网页可见区域高: document.body.clientHeight; 网页可见区域高(包括边线的宽): document.body.offsetHeight; 网页正文全文宽: document.body.scrollWidth; 网页正文

R实战读书笔记四

第三章图形入门本章概要 1 创建和保存图形 2 定义符号.线.颜色和坐标轴 3 文本标注 4 掌控图形维数 5 多幅图合在一起本章所介绍内容概括例如以下. 一图胜千字,人们从视觉层更易获取和理解信息. 图形工作 R具有很强大的画图功能.看以下代码. > attach(mtcars) > plot(wt, mpg) > abline(lm(mpg~wt)) > title("Regression of MPG on Weight") > detach(

R绘图字体解决方案（转）

COS论坛里面经常会遇到的一个问题就是绘图时中文字体怎么解决.最初,一个流行的方法是使用family = "GB1",但一般这样做出来的图比较难看,而且并没有完全解决问题.后来发现了Cairo包,喜大普奔,但后来又发现它选字体的时候不太明确,也就是说我不知道怎样才能选中我想要的那个字体.再然后,Winston Chang写了extrafont包,功能很完善,但需要系统里面安装Ghostscript.我是懒人,不想花时间在配置Ghostscript上,于是写了一个叫做showtext的包

R语言学习路线和常用数据挖掘包（转）

对于初学R语言的人,最常见的方式是:遇到不会的地方,就跑到论坛上吼一嗓子,然后欣然or悲伤的离去,一直到遇到下一个问题再回来.当然,这不是最好的学习方式,最好的方式是——看书.目前,市面上介绍R语言的书籍很多,中文英文都有.那么,众多书籍中,一个生手应该从哪一本着手呢?入门之后如何才能把自己练就成某个方面的高手呢?相信这是很多人心中的疑问.有这种疑问的人有福了,因为笔者将根据自己的经历总结一下R语言书籍的学习路线图以使Ruser少走些弯路. 本文分为6个部分,分别介绍初级入门,高级入门,绘图与可

获取的输入内容，没有被P标签包裹的文本和元素进行处理

<!DOCTYPE html> <html lang="en"> <head> <meta charset="UTF-8"> <title>将没有p标签的元素补充</title> </head> <body> <textarea id="text" style="width: 600px;height: 300px">

R语言学习路线图-转帖

本文分为6个部分,分别介绍初级入门,高级入门,绘图与可视化,计量经济学,时间序列分析,金融等. 1.初级入门 <An Introduction to R>,这是官方的入门小册子.其有中文版,由丁国徽翻译,译名为<R导论>.<R4Beginners>,这本小册子有中文版应该叫<R入门>.除此之外,还可以去读刘思喆的<153分钟学会R>. 这本书收集了R初学者提问频率最高的153个问题.为什么叫153分钟呢?因为最初作者写了153个问题,阅读一个问题

R语言缺点

R的优点:免费,开源,体积小.缺点:对大文本处理差,另外一个也在于开源,package如果出错,烦死你.当你跑比较大的simulation,对效率有要求的时候,有时还是不得不用C,这可能是10小时和10分钟的差别,毫不夸张.SAS流行于公司,R流行于研究机构和大学数据分析不是单纯的靠软件来做的,需要很好的数学基础. 统计学工具各有千秋.https://englianhu.wordpress.com/statistics/学了R,可以免去学spss,matalab,ucinet等等众多的软件,可以

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