流行病学的数据讲究“三间分布”,即人群分布.时间分布和空间分布.其中的“空间分布”最好是在地图上展示,才比较清楚.R软件集统计分析与高级绘图于大成,是最适合做这项工作了.关于地图的绘制过程,谢益辉.邱怡轩和陈丽云等人都早有文章讲述,开R地图中文教程之先河.由于目前指导毕业论文用到,因此研究了一下.本来因为网上教程很多,曾打消了写些文字的计划,但怡轩版主鼓励说“教程者众,整合者鲜”,所以才战胜拖延症,提起拙笔综述整合一下,并对DIY统计GIS地图提出了一点自己的想法. 1 地图GIS数据的来源与R

前几章对R语言的运行原理.基本语法.数据类型.环境部署等基础知识作了简单介绍,本节将结合具体案例进行验证测试. 案例场景:从互联网下载全国三甲医院数据,以地图作为背景,展现各医院在地图上的分布图.全国三甲医院数据来源 http://www.wxmp.cn/cms/detail-51610-23480-1.html  目录: map包研究 效果图 数据清洗 R开发 R脚本部署 map包研究: CRAN上地图的一个常用包就是maps (https://cran.r-project.org/web/p

解决方案有好几种: 网页版,无脑绘图,就是麻烦,没有写代码方便 极简版,gplots::venn 文艺版,venneuler,不好安装rJava,参见Y叔 酷炫版,VennDiagram 特别注意: 目前主流的韦恩图都只支持5个类别,多了不能使用韦恩图. UpSet某种程度上可以显示多于5个类别,但是结果不是很直观,不推荐. library(ComplexHeatmap) m = make_comb_mat(venn.list) UpSet(m) 1. 网页版的就不说了,非常简单,直接输入数据就

目前主要使用ggplot2做一些数据可视化的分析,但是ggplot2有个很大的缺陷是不支持3D作图,所以需要查找其他替代方案. 下面找到的两个替代方案不错,亲测可行,记录于此. 交互3D library(rgl) with(mtcars,{ plot3d(wt, disp, mpg, col="red", size=3) }) 效果图 静态3D library(scatterplot3d) with(mtcars,{ scatterplot3d(wt, # x-axis disp, #

R 绘制中国省市分布地图 library(maps) library(mapdata) library(maptools); getColor=function(mapdata,provname,provcol,othercol) { f=function(x,y) ifelse(x %in% y,which(y==x),0); colIndex=sapply(mapdata@data$NAME,f,provname); fg=c(othercol,provcol)[colIndex+1]; r

最近我一直尝试利用R绘制地图,我从网上找到了上百种不同的实现方法,然而其中却没有适用于我的数据的方法.最终,我从以下几个博客[1]中找到了灵感.我在整合这些资源的基础上,通过不断的试验和修正得到了一个较好地解决方案.这个方案就是本篇博文的主要内容. 本篇博文中展示了如何利用 ggplot2 来绘制分级统计地图,同时还介绍了如何更改图例.颜色等参数指标,以及如何导出图像文件. 数据预处理 绘制分级统计地图需要一些软件包,你最好确认你的电脑中已经安装并加载了它们.我们利用 maptools 库中的

R绘制地图原理: R使用一个个多边形(polygon)来表示每个区域,通过顺次连接GIS数据提供的每个区域多边形的坐标来逐点绘制这些多边形,所以理论上只要得到GIS数据就可绘制相应的地图. 地图绘制说明: 必须使用完整的中国地图(包含台湾及南海九段线): R中大部分包对于中国地图支持不佳,论文发表中需手动添加清楚明确的南海九段线. 1.maps包 R中内置地图包.但是这个包中的中国地图缺乏台湾.西沙.南沙群岛,所以不要拿来做中国地图. library(maps) map('usa') map('

用R画地图数据 首先,从这里下载中国地图的GIS数据,这是一个压缩包,完全解压后包含三个文件(bou2_4p.dbf.bou2_4p.shp和bou2_4p.shx),将这三个文件解压到同一个目录下. 用R绘制地图比较简单.比如画一下全国范围的区域,可以用如下代码: library(maptools) mydat = readShapePoly("china-province-border-data.tar/china/bou2_4p.shp") #地图包位置,根据自己的角标位置设置

使用R拟合分布 几个常用的概率函数介绍 这里,参考R语言实战,以及[Fitting Distribution with R]的附录. 一.认识各种分布的形态 1.1 连续型随机变量的分布 首先,我们来回顾一遍各类分布函数的表达式,及其关系. 先逐一介绍与标准正态分布相关的一些分布:正态分布,卡方分布,t− 分布,F−分布,Wishart 分布. 先上个图,一睹为快. 以上几个分布之间的关系如以下结构图所示. [广义线性模型导论3rd edition,p10] 1.1.1 正态分布 正态分布N(μ

详细内容见上一篇文章:http://www.cnblogs.com/lc1217/p/6514734.html 这里只是介绍下R语言中如何使用最小二乘法解决一次函数的线性回归问题. 代码如下:(数据同上一篇博客)(是不是很简单????) > x<-c(6.19,2.51,7.29,7.01,5.7,2.66,3.98,2.5,9.1,4.2) > y<-c(5.25,2.83,6.41,6.71,5.1,4.23,5.05,1.98,10.5,6.3) > lsfit(x,y

目录 一. 任务说明 二. 重点提示 三. 示例代码 四. hover高亮的实现思路 示例代码托管在:http://www.github.com/dashnowords/blogs 博客园地址:<大史住在大前端>原创博文目录 华为云社区地址:[你要的前端打怪升级指南] 一. 任务说明 使用原生canvasAPI绘制饼图(南丁格尔玫瑰).(截图以及数据来自于百度Echarts官方示例库[查看示例链接]). 二. 重点提示 南丁格尔玫瑰图的画法有很多种,Echarts中提供的以半径或面积两种不同模

参考:大学生mooc 北京理工大学的python程序与设计课程 蟒蛇绘制代码如下: #pythonDraw.py import turtle turtle.setup(650,350,200,200) turtle.penup() turtle.fd(-250) turtle.pendown() turtle.pensize(25) turtle.pencolor("purple") turtle.seth(-40) for i in range(4): turtle.circle(4

R语言  ggplot2包的学习   分析数据要做的第一件事情,就是观察它.对于每个变量,哪些值是最常见的?值域是大是小?是否有异常观测? ggplot2图形之基本语法: ggplot2的核心理念是将绘图与数据分离,数据相关的绘图与数据无关的绘图分离ggplot2是按图层作图ggplot2保有命令式作图的调整函数,使其更具灵活性ggplot2将常见的统计变换融入到了绘图中.ggplot的绘图有以下几个特点:第一,有明确的起始(以ggplot函数开始)与终止(一句语句一幅图):其二,图层之间的叠加

生存分析与R 2018年05月19日 19:55:06 走在码农路上的医学狗 阅读数:4399更多 个人分类: R语言   版权声明:本文为博主原创文章,未经博主允许不得转载. https://blog.csdn.net/weixin_40466280/article/details/80377317 生存分析与R 生存分析是将事件的结果和出现这一结果所经历的时间结合起来分析的一类统计分析方法.不仅考虑事件是否出现,而且还考虑事件出现的时间长短,因此这类方法也被称为事件时间分析(time-to-

function TheStudy;%函数名 close all;%关闭所有床头 DD={'Sun','Mon','Tue','Wed','Thu','Fri','Sat'};%日历表头文字 figure;%打开一个窗口 %绘制窗口中的图标 uicontrol(gcf,'style','text','unit','normalized','position',[0.12,0.9,0.4,0.08],... 'ForegroundColor',[0.4,0.9,0.8],'BackgroundCo

https://www.harding.edu/fmccown/r/   这个网站上有壮观的 R 绘制的实际图形 下面只记录自己感兴趣的内容 单变量绘图下包含 1. 带状图 2. 茎叶图 3. 直方图 4. 箱线图 5. 时序图 #====================================================== # 总统经济报告 year=: # 居民失业率 unemploy = c(5.5, 6.7, 5.5, 5.7, 5.2, 4.5, 3.8, 3.8, 3.

绘制奥运五环主要涉及到Python中的turtle绘图库运用: turtle.forward(distance) 向当前画笔方向移动distance像素长度 turtle.backward(distance) 向当前画笔相反方向移动distance像素长度 turtle.right(degree) 顺时针移动degree° turtle.left(degree) 逆时针移动degree° turtle.pendown() 移动时绘制图形,缺省时也为绘制 turtle.goto(x,y) 将画笔移

项目中须要用到全国各个城市的景点坐标范围.须要人工审核各个景点的数据正确性和各个景点之间的距离分布.首先想到的就是使用R绘制每一个景点的多边形区域. 首先通过python,依据数据生成R画图代码,当然这里的R画图代码很easy.利用原始数据拼接成R代码才是耗费工作量最大的工作,详细过程比較繁琐,此处略去. 生成的R画图代码示比例如以下: pdf("嘉兴.png"); png(file="嘉兴.png") pdf(file="嘉兴.pdf", fa

4.1 R绘图概述 以下两个函数,可以分别展示二维,三维图形的示例: >demo(graphics) >demo(persp) R提供了多种绘图相关的命令,可分成三类: 高级绘图命令:在图形设备上产生一个新的图区,它可能包括坐标轴.标签.标题等. 低级绘图命令:在一个己经存在的图形上加上更多的图形元素,如额外的点.线和标签. 交互式图形命令:允许交互式地用鼠标在一个已经存在的图形.上添加图形信息或者提取图形信息. 使用R语言作图,主要按照以下步骤进行: ①取原始数据,准备好绘图需要的变量. ②

turtle库的使用 概述:turtle(海龟)库是turtle绘图体系的python实现 turtle库的理解: -有一只海龟,其实在窗体正中心,在画布上游走 -走过的轨迹形成了绘制的图形 -海龟由程序控制,可以变换颜色,改变宽度 turtle的绘图窗体 turtle.setup(width,height,startx,starty) -setup()设置窗体大小位置 -4个参数中后两个可选 -setup()不是必须的 例如: turtle.setup(800,800,0,0) turtle.