目录 1.conda安装 2.配置RepBase 3.RepeatMasker避坑 4.RepeatProteinMask避坑 5.RepeatModeler避坑 6.自定义重复序列库 后记 1.conda安装 conda安装虽然简单,但还是有很多坑,而且很多都是隐形的坑. # conda install -c bioconda repeatmasker conda install -c bioconda repeatmodeler repeatmodeler依赖于repeatmasker,因此

Ubuntu部署python3.5的开发和运行环境 1 概述 由于最近项目全部由python2.x转向 python3.x(使用目前最新的 python3.5.1) ,之前的云主机的的默认python版本都面临升级,故进行了升级后将相应的步骤记录下来,作为学习笔记吧. 服务器运行环境: ubuntu 14 LTS Server 本安装方式具有如下特点: 不影响已经有的python环境 增量式安装 完全隔离的沙盒环境 甚至可以不需要root权限 2 下载 在python官网下载指定平台下的pyth

Atitit linux获取项目运行环境版本 1.1. Nginx版本1 1.2. Php版本1 1.3. Mysql版本2 1.4. Redis版本2 1.1. Nginx版本 [root@iZ25rn0winyZ ~]# nginx -v nginx version: nginx/1.6.3 1.2. Php版本 3.查看php的版本信息,如果是通过yum,或者是rpm包安装的,可以使用rpm -qa |grep php来查看: [root@iZ25rn0winyZ ~]# rpm -qa

本系列文章将介绍Docker的有关知识: (1)Docker 安装及基本用法 (2)Docker 镜像 (3)Docker 容器的隔离性 - 使用 Linux namespace 隔离容器的运行环境 (4)Docker 容器的隔离性 - 使用 cgroups 限制容器使用的资源 (5)Docker 网络 1. 基础知识:Linux namespace 的概念 Linux 内核从版本 2.4.19 开始陆续引入了 namespace 的概念.其目的是将某个特定的全局系统资源(global syst

Python 2/3 安装与运行环境设置: 1.Python 软件源:https://www.python.org/    下载Win版本 https://www.python.org/downloads/windows/ 2.安装在同一个目录 c:\python 下的两个子目录,或者是两个一级目录,由你决定.环境 path 只能设置一个路径? 安装后会在 系统%windwos%中安装一个 py.exe 与 pyw.exe 文件作为 两个版本 python.exe 的启动文件. $>  py -

这周末体验了一下挺火的Docker技术,记录学习笔记. >Docker是干什么的 Docker 是一个基于Linux容器(LXC-linux container)的高级容器引擎,基于go语言开发,源代码托管在 Github 上, 遵从Apache2.0协议开源.Docker的目标是实现轻量级的操作系统虚拟化解决方案. 学习Docker首先要了解几个概念: 镜像—Docker的镜像和常见的系统ISO镜像类似,包含了应用程序的信息: 容器—容器相当于一个可以运行起来的虚拟机,应用程序运行在容器中,D

服务器运行环境(LNMP)安装说明 因为公司需要一套流程标准,所以写了如下步骤. 先下载文件environment.tar,将文件上传到服务器. 使用命令解压文件,tar xvf environment.tar. cd进入解压目录,运行命令sh install.sh. 安装完成后台打开浏览器访问http://ip/,访问成功表示安装完成. 软件版本: memcached 1.4.25 mysql 5.6 php 5.6 Tengine 2.1.2 安装后目录说明: tengine /use/lo

对于新入门的开发者,如何安装 Ruby和Ruby Gems 的运行环境可能会是个问题,本页主要介绍如何用一条靠谱的路子快速安装 Ruby 开发环境.此安装方法同样适用于产品环境! 系统需求 首先确定操作系统环境,不建议在 Windows 上面搞,所以你需要用: Mac OS X 任意 Linux 发行版本(Ubuntu,CentOS, Redhat, ArchLinux ...) 强烈新手使用 Ubuntu 省掉不必要的麻烦! 以下代码区域,带有 $ 打头的表示需要在控制台(终端)下面执行(不包

序言 最近尝试完整搭建一个Web项目的运行环境,总结一下这几个月学到的知识点. 后面的文章主要包括一下几个内容: A. 搭建一个Linux服务器,用来部署Redis.Mongo等数据存储环境: B. 搭建一个Windows Server 2008,用IIS来部署Web项目:   接下来进入主题,本篇主要介绍用虚拟机部署测试环境的时候, 如何配置相关的网络连接.   一.用VM安装一个win7客户端.ubuntu服务器.windows server 2008服务器 这里就不介绍怎么安装了,网上有很

9款一键快速搭建PHP运行环境的好工具 胡倡萌 2011/02/19 网络资源 77,063 1     内容提要: 建立一个PHP网站,首先需要搭建PHP的开发和运行环境,对于PHP初学者也是一个难题,下面介绍部分一站式PHP环境搭建安装程序.小编推荐使用APMServ或者phpnow. 一键搭建PHP运行环境工具 1.APMServ http://apmserv.s135.com/国内研发,功能强大,操作简单,无需安装,只需鼠标一点,即可在自己的电脑上傻瓜全自动搭建一个完美的PHP的Web服

Mysql优化已经讲过很多篇教程了,而且网上也很多相关内容,但是本文我们是讲Linux下Mysql运行环境如何进行优化,有些地方与以往有所不同,也具有参考价值.具体mysql教程 如下: 一.修改Linux默认的IO调度算法. linux默认的IO调度算法为cfq,需要修改为dealine,如果是SSD或者PCIe-SSD设备,需要修改为noop,可以使用下面两种修改方式. 1.在线动态修改,重启失效. echo “deadline” > /sys/block/sda/queue/schedul

1. 前提条件 安装了Docker的64位Linux 操作系统 Linux操作系统镜像 Linux版本的JDK压缩包 Linux版本的Tomcat压缩包 2. 启动容器 容器是在镜像的基础上来运行的,一旦容器启动了,我们就可以登录到容器中,安装自己所需的软件或应用程序. 启动命令:(docker run <相关参数> <镜像 ID> <初始命令>) docker run -i -t -v /root/software/:/mnt/software/ 25c5298b1a

--------------------------------------- 博文作者:迦壹 博客标题:Mac10.9用brew搭建Eclipse4.4+Maven3.2.3+JDK1.8运行环境 博客地址:http://idoall.org/home.php?mod=space&uid=1&do=blog&id=560 转载声明:可以转载, 但必须以超链接形式标明文章原始出处和作者信息及版权声明,谢谢合作! -----------------------------------

是什么 我们经常会在命令行用到诸如mysql.python等命令,特点是一旦输入后,会进入命令本身的交互运行环境.示例: [root@iZ25vs3mckhZ ~]# python Python 2.6.6 (r266:84292, Jan 22 2014, 09:42:36) [GCC 4.4.7 20120313 (Red Hat 4.4.7-4)] on linux2 Type "help", "copyright", "credits"

微软的Windows Server 2012发布后,第一时间进行了简单的试用,非常不错,特写了个简易的PHP环境搭建教程.先来欣赏下Win2012的登录界面吧第一步我们需要安装IIS81.点击任务栏最左边第一个图标,打开任务管理器,会看到一个"添加角色和功能"的入口,点开2.选择"基于角色或基于功能的安装",然后点击下一步3.在服务器选择界面选择当前服务器,并点击下一步4.服务器角色选择界面我们选择IIS,并点击下一步5.接下来需要连续多点两次下一步,然后来到&qu

一.操作系统环境 操作系统版本选择 CentOS/RHRL/ORACLE Linux 5.x/6.x x86_64 发行版 建议磁盘分区规则 MySQL 运行环境建议规范 挂载点 大小 分区类型 分区用途 /boot 100M 系统默认即可 /boo swap 4G-16G swap swap /opt 20G xfs 安装应用软件应用程序安装在 /opt/app/ 下的子目录,例如 /opt/app/mysql-5.5.37 / 40G ,最小不低于 20G 系统默认即可 / /home 第一

(一)SDK 的下载与安装 1． 下载SDK 为了建立基于SDK 的Java 运行环境,需要先下载Sun 的免费SDK 软件包.SDK 包含了一整套开发工具,其中包含对编程最有用的是Java 编译器.Applet 查看器和Java 解释器. 2． 安装SDK 运行下载的“j2sdk-1_6_x_-windows-i586.exe”软件包,可安装SDK,在安装过程中可以设置安装路径及选择组件,默认的组件选择是全部安装. 3． SDK 中的主要文件夹和文件 安装成功后,安装目录中,bin 文件夹中包

在Windows 8 的IIS(8.0)中搭建PHP运行环境: 一:安装IIS服务器 1.进入控制面板>>程序和功能>>打开或关闭Windows 功能,找到Internet信息服务,记得选中CGI这一项 2.安装完成后在浏览器中打开localhost,查看是否能显示IIS的欢迎页面: 二:下载安装配置PHP环境 1.下载PHP,官网地址:http://windows.php.net/download/, 2.将下载的zip压缩包解压到D盘下,解压后为E:\php; 3.进入控制面板

安装Eclipse插件成功后,需要配置JBPM6的运行环境: 1. 第一步先将下载的jbpm6目录中的“jbpm-6.0.1.Final-bin.zip”找到,并解压缩到D盘根目录备用. 2. 第二步打开Eclipse->Preferences 会弹出一个对话框,在文本框中搜索到"JBPM". 3. 第三步配置installed jbpm Runtimes路径,点开后,点击“Add”按钮,Name写上:“Jbpm6_Runtimes”,Path:浏览到“jbpm-6.0.1.Fi

最近项目从windows搬到linux,由于项目组成员有限并且有其它紧急的任务需要处理,因而这个任务就落到我的头上了.下面记录下centos最小版本安装nginx+tomcat+mysql+java的运行环境. centos7 minimal安装 参考:http://www.tecmint.com/centos-7-installation/ 安装java 下载Java,可到oracle官网获取相应的连接 wget http://download.oracle.com/otn-pub/java/

LNMP作为php流行的运行环境,而最近需要搭建一个内部的php论坛.记录下LNMP的安装: 1.安装mysql 请参考:centos7 安装mysql5.7.11注意事项 2.安装php yum install php 3.安装php依赖库 yum install php-fpm php-cli php-mysql php-gd php-ldap php-odbc php-pdo php-pecl-memcache php-pear php-mbstring php-xml php-xmlrp