rrplup计算GEBV值

2024-10-31

【GS模型】全基因组选择之rrBLUP

目录 1. 理论 2. 实操 2.1 rrBLUP包简介 2.2 实操 3. 补充说明关于模型关于交叉验证参考资料 1. 理论 rrBLUP是基因组选择最常用的模型之一,也是间接法模型的代表.回顾一下,所谓间接法是指:在参考群中估计标记效应,再结合预测群的基因型信息将标记效应累加,最终获得预测群的个体估计育种值.而直接法则是指:将个体作为随机效应,参考群体和预测群体遗传信息构建的亲缘关系矩阵作为方差协方差矩阵,通过迭代法估计方差组分,进而求解混合模型获取待预测个体的估计育种值.简言之,直接

geotrellis使用（十七）使用缓冲区分析的方式解决单瓦片计算边缘值问题

Geotrellis系列文章链接地址http://www.cnblogs.com/shoufengwei/p/5619419.html 目录前言需求分析实现方案总结一.前言最近真的是日理千机,但是再忙也要抽出时间进行总结.上一篇文章讲了使用缓冲区分析的方式解决投影变换中边缘数据值计算的问题(见geotrellis使用(十六)使用缓冲区分析的方式解决投影变换中边缘数据值计算的问题).实际中往往还有一种需求就是对单个瓦片进行操作,比如求坡度等,如果这时候直接计算,同样会出现

treetable 前台累计计算树值提交后台

treetable 累计计算树值效果图 html 代码 <!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd"> <html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml"> <head> &l

ylbtech-Unitity-cs:计算阶乘值

ylbtech-Unitity-cs:计算阶乘值 1.A,效果图返回顶部 1.B,源代码返回顶部 1.B.1, using System; namespace Functions { public class Factorial { // “Calc”静态方法为传入的指定整数 // 计算阶乘值: public static int Calc(int i) { ) ? : (i * Calc(i-))); } } } 1.B.2, 1.C,下载地址返回顶部作者:ylbtech出处:http:

C#计算时间差值

/// <summary> /// 计算时间差值 /// </summary> /// <param name="DateTime1"></param> /// <param name="DateTime2"></param> /// <returns></returns> private string DateDiff(DateTime DateTime1, DateT

利用Python计算π的值，并显示进度条

利用Python计算π的值,并显示进度条第一步:下载tqdm 第二步;编写代码 from math import * from tqdm import tqdm from time import * total,s,n,t=0.0,1,1.0,1.0 clock() while(fabs(t)>=1e-6): total+=t n+=2 s=-s t=s/n k=total*4 print("π值是{:.10f} 运行时间为{:.4f}秒".

excel计算时间差值

excel计算时间差值 2018/10/1 10:59:00 减去 2018/9/21 1:05:13 获取多少天. 如1.2天.这种. ==

使用不同的方法计算TF-IDF值

摘要这篇文章主要介绍了计算TF-IDF的不同方法实现,主要有三种方法: 用gensim库来计算tfidf值用sklearn库来计算tfidf值用python手动实现tfidf的计算总结之所以做了这方面的总结是因为最近在研究word2vec,然后涉及到了基于word2vec的文本表示方法.你用word2vec训练好的模型可以得到词的向量,然后我们可以利用这些词向量表示句子向量. 1. 一般处理方法是把句子里涉及到的单词用word2vec模型训练得到词向量,然后把这些向量加起来再除以单词数

百度词汇检索，计算PMI值

'''词汇检索百度返回值,并且计算PMI值的类''' from bs4 import BeautifulSoup import requests import re import pandas as pd import time import numpy as np class PMI(): def __init__(self): self.url = 'https://www.baidu.com/s?wd=' #self.vocab = vocab def getHtml(self, url)

C#实现像Git那样计算Hash值

从Git Tip of the Week: Objects一文中得知,Git是这样计算提交内容的Hash值的: Hash算法用的是SHA1 计算前,会在内容前面添加"blob 内容长度\0",\0表示的是空字符(NUL). 计算出来的Hash值是40位16进制序列(40-character hexadecimal sequence). 比如提交一个空文件,Git计算出来的Hash值是e69de29bb2d1d6434b8b29ae775ad8c2e48c5391,实际计算的内容是&qu

[编程] C语言循环结构计算π的值

公式: 分析:首先,系数为正数的项的分母是4n-3(n为正数项的项数),为负数的项的分母为4n-1(n为负数项的项数),即分母的变化规律是1.3.5.7...的奇数数列,则第n项的分母为2n-1,第10000项的分母为2*10000-1. 代码: #include <stdio.h> int main(){ //计算π的值 int i; int z; double f; ; ;i<=;i++){ //取模 z=i%; //每项 f=(/(*i-); //z等于0的时候是负数 ){ f=-

算法笔记_031:计算中值和选择问题（Java）

目录 1 问题描述 2 解决方案 2.1 计算中值问题 2.2 选择问题 1 问题描述中值问题是求一个n个数列表中某一数组下标k,它要求该下标元素比列表中的一半元素大,又比另一半元素小,这个中间的值被称为中值. 选择问题是求一个n个数列表的第k个最小元素的问题. 2 解决方案 2.1 计算中值问题本文使用Lomuto划分算法思想,此处引用<算法设计与分析基础>第三版上一段文字介绍及配图,具体如下: 具体实现代码如下: package com.liuzhen.chapter4; pub

C 语言 clock() 函数，例：计算多项式值

C 语言 clock() 函数,例:计算多项式值 /** * clock(): 捕捉从程序开始运行到 clock() 被调用时所耗费的时间. * 这个时间单位是 clock tick, 即"时钟打点". * 常数 CLK_TCK: 机器时钟每秒所走的始终打点数. * In Macintosh or C99, CLK_TCK == CLOCKS_PER_SEC * http://www.cplusplus.com/reference/ctime/CLOCKS_PER_SEC/ */ 我把

一起talk C栗子吧（第三十四回：C语言实例--巧用溢出计算最值）

各位看官们.大家好,上一回中咱们说的是巧用移位的样例,这一回咱们说的样例是:巧用溢出计算最值. 闲话休提,言归正转.让我们一起talk C栗子吧! 大家都知道,程序中的变量都有一个取值范围,这个范围也计算机和编译器都有关系. 我们举个实际的例子进行说明:在32位的计算机上,假设使用4个字节存储int类型的变量也就是说使用了32位的存储空间. 这时int类型变量的取值范围是:负2的32次方到正2的32次方-1,详细的数值是-2147483648到2147483647. 假设把不在这个范围内的数值

R语言计算IV值

更多大数据分析.建模等内容请关注公众号<bigdatamodeling> 在对变量分箱后,需要计算变量的重要性,IV是评估变量区分度或重要性的统计量之一,R语言计算IV值的代码如下: CalcIV <- function(df_bin, key_var, y_var){ N_0<-table(df_bin[, y_var])[1] N_1<-table(df_bin[, y_var])[2] iv_c<-NULL var_c<-NULL for (col in c

Python计算IV值

更多大数据分析.建模等内容请关注公众号<bigdatamodeling> 在对变量分箱后,需要计算变量的重要性,IV是评估变量区分度或重要性的统计量之一,python计算IV值的代码如下: def CalcIV(Xvar, Yvar): N_0 = np.sum(Yvar==0) N_1 = np.sum(Yvar==1) N_0_group = np.zeros(np.unique(Xvar).shape) N_1_group = np.zeros(np.unique(Xvar).shape

KMP算法计算next值和nextVal值

KMP算法: 给定一个主串S及一个模式串P,判断模式串是否为主串的子串:若是,返回匹配的第一个元素的位置(序号从1开始),否则返回0: 这里先不写算法,仅仅计算next和nextVal值那么计算时只用到子串,也就是模式串这里模式串为:abaabcac 第一步将模式串写上序号,我们这里从1开始(有的从0开始,建议充1开始) 然后计算出maxL值,列出从第一个开始的子串,找出相等的前缀和后缀的个数如果2>看不懂的话,看3>, 2>计算maxL值所以maxL值如果这个看不懂的话, 看

Windows下计算md5值

目录 Windows下计算md5值 1.linux 下计算md5值 2.Windows下计算md5值 Windows下计算md5值 1.linux 下计算md5值 [root@master yl]# md5sum CentOS-74-x86_64-1810.iso 6aab82e407bded0f611842952cd5067d CentOS-74-x86_64-xdja-v1.1.iso 2.Windows下计算md5值 certutil -hashfile filename MD5 wind

C++：利用如下公式，编写函数计算∏的值，直到最后一项的绝对值小于e,主程序接收从键盘输入的e，输出∏的值（保留5位小数）。 ∏/4 = 1-1/3+1/5-1/7...

利用如下公式,编写函数计算∏的值,直到最后一项的绝对值小于e,主程序接收从键盘输入的e,输出∏的值(保留5位小数). ∏/4 = 1-1/3+1/5-1/7... #include <iostream> #include<cmath> #include<iomanip> using namespace std; float f(float); int main() { float e = 0.0; cin >> e; cout << fixed&

不要对md5file.read()计算md5值

最近遇到的一个问题,我使用以下代码对备份文件计算MD5值: # md5file=open("%s" % outputpath, 'rb') # md5=hashlib.md5(md5file.read()).hexdigest() # md5file.close() 导致了部分备份节点的guestagent被kill,发生了oom现象. 后来调查原因:是因为被计算的文件大小过大,上面的代码需要将文件全部读到内存中才能计算MD5.当此文件过大时,会导致内存超出配额,触发了oom. 现在已

计算KS值的标准代码

计算KS值的标准代码 from scipy.stats import ks_2samp get_ks = lambda y_pred,y_true: ks_2samp(y_pred[y_true==1], y_pred[y_true!=1]).statistic get_ks(x,y)

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