在linux中用同一个版本的R 同时安装 Seurat 2 和 Seurat 3 Seurat  作为单细胞分析中的重量级R包,有多好用用,用过的人都知道.Seurat 分析流程基本涵盖了单细胞分析中的所有常见分析方法,包括filtering,tSNE,UMAP降维及画图等.还有一个重量级功能就是矫正不同实验之间的批次效应.然而Seurat 2和Seurat 3的矫正方法完全不一样,得到的结果也不一致.Seurat 2是基于CCA (典型相关性)的,可以矫正肿瘤,外周血及癌旁组织间由于实验带来的

受环境所迫,在一台Ubuntu server上安装多个实例MySQL. 手动安装MySQL 环境:Ubuntu server 11.10 64bit + mysql-5.5.17-linux2.6-x86_64.tar.gz http://www.iteye.com/topic/976422 http://xgbjmxn.iteye.com/blog/1207344 http://www.cnblogs.com/wuhou/archive/2008/09/28/1301071.html http

Jetty提供了一个Web服务器和javax.servlet容器,为SPDY.WebSocket.OSGi.JMX.JNDI.JAAS以及许多其它集成套件添加了支持.这些组件都是开源的,也可用于商业用途和分发. Jetty被广泛用于多种项目和产品,都可以在开发环境和生产环境中使用.Jetty可以很容易地嵌入到设备.工具.框架.应用服务器以及集群中.更多用途可参见Jetty网页.ubuntu 14.10 server上安装Jetty 9   sudo apt-get install openjdk

Compose简介 Compose是Docker官方的开源项目,负责对Docker容器集群的快速编排. Compose是定义和运行多个Docker容器的应用. 举例来说: 一个项目除了Tomcat容器外,还需要mysql服务容器,Compose允许用户通过一个单独的 docker-compose.yml模板文件来定义一组想关联的应用容器为一个项目. Ubuntu 上安装Compose 在linux上直接从官方GIthub上下载编译好的二进制文件即可. 官方Github: https://gith

此文是<.NET内存宝典>一书的售后服务系列文章之一. 在<.NET内存宝典>一书(目前我还在翻译本书,预计年底出版)的第3章 “内存测量”里的“Windows性能工具包”一节中,有提到: Windows性能工具包可以通过两种方式安装.这两种方式都依赖于安装两个较大的软件包中之一 — Windows评估和部署工具包或Windows SDK. 然而当我们跑到: 微软官网的“Windows 性能工具包” 微软官网的” Windows 评估和部署工具包” 却发现:Windows ADK(

由于要进行渗透测试,所以这两天就在搭LAMP的环境(过程及其痛苦) 这里分享一些我遇到的问题. 首先介绍一下我的使用环境  VM虚拟机,ubuntu 与主机NAT连接 由于之前一直使用的是kali(默认root权限),而ubuntu 默认并不是root权限,所以使用命令行时 请在命令行前加上 sudo        安装Apache2 首先,我们需要安装Apache 2 Web服务器. sudo apt-get install apache2 -y 之后验证apaqch2是否安装成功 ifcon

今天在部署ASP.NET网站时出现IIS 500.21错误.环境是Windows Server 2012 +IIS8 于是查找解决方案,发现网上的信息都说是需要重装.NET framerwork4.0即可,而我在执行那段重装4.0的命令之后还是失败. 发现原来是我在安装IIS时没有把Application Development 下的ASP.NET勾选导致的,这也提醒我们在安装的时候注意勾选这个(默认是不勾选的) 于是从服务管理其从新添加了ASP.NET这一选项,从而出现了标题中的错误. 起初以

一般就是打开server manager. 一直next到add feature 讲net3.5勾选 发现需要指定一个路径是什么 source\sxs之类的 下载microsoft-windows-netfx3-ondemand-package_421a25bf409692045d1cbfab0d99f8def8d95d3f.cab, 然后放到本地某个文件夹中 路径指到这里, 继续安装,直至成功

原始链接:http://serverfault.com/questions/270260/how-do-you-use-apt-get-to-only-install-critical-security-updates-on-ubuntu 只安装安全更新 grep 'security' /etc/apt/sources.list > /tmp/security.sources.list sudo apt-get upgrade -o Dir::Etc::SourceList=/tmp/secur

1. 安装php5.6 http://phpave.com/upgrade-to-php-56-on-ubuntu-1404-lts/ 按照这篇文章的顺序来做,可以安装最新5.6版本php 安装好了以后,要安装php的其他依赖,例如php5-curl等 2. 按照以下文章安装其他配置以及laravel https://www.digitalocean.com/community/tutorials/how-to-install-laravel-with-an-nginx-web-server-o

第一步:使用ppa/源方式安装,安装ppa sudo add-apt-repository ppa:webupd8team/java sudo apt-get update 第二步:安装 oracle-java8-installer sudo apt-get install oracle-java8-installer 提示:1. 执行以上命令,系统会提示是否同意java binary license等等,只有选择同意,才能继续后续安装. 2. 下载jdk 需要大约需要30分钟左右,而且因网络状

首先更新一下源: sudo apt-get update 如果你不知道Postgresql具体的包的名称,可以使用一下语句进行查找: apt-cache search ^Postgresql 使用上述搜索,可以查到当前可安装的Postgresql版本,使用apt-get进行安装: sudo apt-get install postgresql-9.3 使用apt-get install安装时,会自动安装好其依赖的各个库(安装过程会提示,选Y即可). 安装完成之后运行psql,会提示如下错误: b

Installation Do I need to install pip? pip is already installed if you are using Python 2 >=2.7.9 or Python 3 >=3.4 downloaded from python.org or if you are working in a Virtual Environment created by virtualenv or pyvenv. Just make sure to upgrade

Install-WindowsFeature Net-Framework-Core -source \\network\share\sxs

1.R的安装 1.1首先添加镜像源 # Ctrl+Alt+T打开终端 $ sudo gedit /etc/apt/sources.list # 加入新镜像源 回车之后会自动跳出一个文本框,然后在相似的地方输入 deb http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu trusty/ 加载镜像源还可以使用以下方法: deb https://<my.favorite.cran.mirror>/bin/linux/ubuntu xenial/ deb https://

在 Ubuntu 14.04 Server 上安装过程是最简单的, 其满足了安装 Docker的所有要求,只需要执行如下安装脚本即可. 如果你有可能,请使用14.04版本的Ubuntu, 避免给自己挖坑. 安装 1 curl -sSL https://get.docker.io/ubuntu/ | sudo sh 测试 1 sudo docker run -i -t ubuntu /bin/bash 这一步会进入容器并运行一个交互式SHELL.你可以安装一些软件, 比如 apt-get inst

网页版Rstudio︱RStudio Server多人在线协作开发 想了解一下RStudio Server,太给力的应用,可以说成是代码分布式运行,可以节省时间,放大空间. RStudio是一个非常优秀的R语言IDE. RStudio除了在各种系统中有桌面版本外还有Server版,它可以装载在linux主机上,用户可以通过浏览器远程登录使用R进行数据分析.笔者在之前也曾经折腾过好几回都没成功,不过今天运气不错居然实现了. 最近更新(2016-11-29): R︱Linux+Rstudio Ser

前提条件: 确保ubuntu服务器上 已经安装 java 8 或更高版本,安装java8可以参考我的另一篇博文 通过 ppa 在ubuntu server 上安装java 8 java -version java version "1.8.0_191"Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.8.0_191-b12)Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 25.191-b12, mixed mode) 第

Apache Hadoop的服务的部署比較繁琐.须要手工编辑配置文件.下载依赖包等.Cloudera Manager以GUI的方式的管理CDH集群,提供向导式的安装步骤.因为须要对Hive,HBase,Impala,Spark进行功能測试,就採用了Cloudera Manager方式进行安装. Cloudera Manager提供两种软件包安装源,Package 和 Parcel: Package就是一个个rpm文件.以yum的方式组织起来. Parcel是rpm包的压缩格式.以.parcel结

linux系统上安装java   如何在ubuntu server上安装java(jre或jdk),主要注意以下几点: 1.下载你想要的java版本压缩包. JRE下载:http://java.com/en/download/manual.jsp: JDK下载:http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/jdk7-downloads-1880260.html 2.假设下载的是jdk,将jdk的压缩包jdk-7u17-linux-

在2018年年初,Jenkins X首次发布,它由Apache Groovy语言的创建者Jame Strachan创建.Jenkins X 是一个高度集成化的 CI/CD 平台,基于 Jenkins 和 Kubernetes 实现,旨在解决微服务体系架构下的云原生应用的持续交付的问题,简化整个云原生应用的开发.运行和部署过程.仅需一条Jenkins X命令,管理员可以创建一个Kubernetes集群,并安装用于管理应用程序.创建流水线并部署一个应用程序到不同的环境中的工具. Jenkin X还是