sam格式怎么修改内容

2024-10-20

sam格式详细说明

原文链接 https://www.jianshu.com/p/386f520e5de1 The SAM Format Specification(sam格式说明) 1 The SAM Format Specification sam是一种序列比对后的输出格式,以tab作为分隔符,包括头部信息和比对信息.其中头部信息必须在比对信息之前.头部信息的开头是@,但是比对行不是.每一个比对行有11个重要的比对信息元素,如果比对位置和校准信息等. 1.1 An example FCC0YG3ACXX:2:1

git教程：查看文件状态与修改内容

转载:时光机穿梭我们已经成功地添加并提交了一个readme.txt文件,现在,是时候继续工作了,于是,我们继续修改readme.txt文件,改成如下内容: Git is a distributed version control system. Git is free software. 现在,运行git status命令看看结果: $ git status On branch master Changes not staged for commit: (use "git add <fi

Git以及github的使用方法（三），git status查看工作区的状态，git diff查看具体修改内容

我们已经成功地添加并提交了一个readme.txt文件,现在,是时候继续工作了,于是,我们继续修改readme.txt文件,改成如下内容: Git is a distributed version control system. Git is free software. 现在,运行git status命令看看结果: $ git status On branch master Changes not staged for commit: (use "git add <file>...

解读sam格式文件

1,SAM文件格式介绍 SAM(The Sequence Alignment / Map format)格式,即序列比对文件的格式,详细介绍文档:http://samtools.github.io/hts-specs/SAMv1.pdf SAM文件由两部分组成,头部区和主体区,都以tab分列.头部区:以’@'开始,体现了比对的一些总体信息.比如比对的SAM格式版本,比对的参考序列,比对使用的软件等.主体区:比对结果,每一个比对结果是一行,有11个主列和一个可选列. 2,头部区简要介绍 @HD V

od 查看特殊格式的文件内容

用户通常使用od命令查看特殊格式的文件内容.通过指定该命令的不同选项可以以十进制.八进制.十六进制和ASCII码来显示文件. 语法: od ［选项］文件- 命令中各选项的含义: - A 指定地址基数,包括: d 十进制 o 八进制(系统默认值) x 十六进制 n 不打印位移值 - t 指定数据的显示格式,主要的参数有: c ASCII字符或反斜杠序列 d 有符号十进制数 f 浮点数 o 八进制(系统默认值为02) u 无符号十进制数 x 十六进制数除了选项c以外的其他选项后面都可以跟一个十进

SAM格式及比对工具之 samtools 使用方法

参考资料: SAMtools(官网) SAM Spec v1.4 (SAM格式说明书) (重要) samtools-1.3.1 使用手册 (SAMtools软件说明书) samtools常用命令详解(博客园) SAM格式定义(博耘生物) samtools使用方法(plob) 这个学习急不来,而且比对非常重要,先把上面的官方SAM/BAM格式说明文件看透`Sequence Alignment/Map Format Specification` SAMtools解决的问题非常多序列(read),

POI根据EXCEL模板，修改内容导出新EXCEL （只支持HSSF）

package excelPoiTest; import java.io.File; import java.io.FileInputStream; import java.io.FileOutputStream; import java.io.IOException; import org.apache.poi.hssf.usermodel.HSSFCell; import org.apache.poi.hssf.usermodel.HSSFSheet; import org.apache.p

Oracle 中利用闪回查询确定某表在某时间点之后的修改内容，并恢复至该时间点

Oracle 中利用闪回查询确定某表在某时间点之后的修改内容: 1.查看 DELETE 及 UPDATE 操作修改的数据: SQL> SELECT * FROM tab AS OF TIMESTAMP to_timestamp('time_point', 'yyyy-mm-dd hh24:mi:ss') MINUS SELECT * FROM tab; 其中将查询得 tab 表在 time_point 时点之后因 DELETE 及 UPDATE 操作修改的数据. 2.查看 INSERT 操作修

内容写到 csv 格式的文件中及读取 csv 格式的文件内容

<?php/*把内容写到 csv 格式的文件中基本思路是:1.用 $fp = fopen("filename", 'mode')打开一个csv文件,可以是打开时才建立的2.用putcsv($fp, $array); 读取 csv 格式的文件内容基本思路是:1.用$fp = fopen("file.csv", "mode") 打开一个csv文件;2.用fgetcsv($fp[,....])读取里面的内容,返回是数组形式,[,..]可选参数

Example011表单中修改内容

<!DOCTYPE html> <html lang="en"> <head> <meta charset="UTF-8"> <title>实例011表单中修改内容的方法</title> </head> <body>  <in

dedecms中{dede:myad name='about'/} 修改内容

网站首页index.htm中调用这个命令,显示一段文字,但是想要修改内容.所以想知道这个命令指定的文件内容在哪里寻找或者指定内容在哪里修改? 匿名 | 浏览 6036 次发布于2014-02-19 15:00 最佳答案您这是调用系统的广告标签. 1,后台广告管理 2,修改您对应的广告就行,或者 3,新建广告 4,按照提示步骤建立文字,或图片,或动画, 5,完成后系统会提示您该广告的调用标签 6复制插入模板相应位置,好了.

Git 查询某次历史提交的修改内容

在工作时,有时候想查看某次的提交修改了哪些的内容. 我们首先可以git log显示历史的提交列表: 之后我们用git show <commit-hashId> 便可以显示某次提交的修改内容同样 git show <commit-hashId> filename 可以显示某次提交的某个内容的修改信息.

纸壳CMS（ZKEACMS）体验升级，快速创建页面，直接在页面中修改内容

关于纸壳CMS 纸壳CMS又名 ZKEACMS Core 是ZKEACMS的 .net core 版本,可运行在 .net core 1.1 平台上.是一个开源的CMS. 纸壳CMS对于 ZKEACMS 是一个完整的迁移,并且加入了许多新的功能. 项目官方网站 http://www.zkea.net 项目地址 http://www.zkea.net/zkeacms/zkeacmscore 新功能介绍 1. 快速创建页面为了可以快速的创建页面,纸壳CMS内置了一些通用页面作为模板,在创建页面的时

BAM/SAM格式

本质上就是二进制压缩的SAM文件,大部分生物信息学流程都需要这个格式,为了节省存储空间以及方便索引. # BiocInstaller::biocLite('Rsamtools') library(Rsamtools) test_bam_file <- 'data/CHIP-seq.bam' #fileter bam filter <- FilterRules(list(MinWidth = function(x) width(x$seq) > 35)) res <- scanBam

Ecms7.5版CK编辑器保留word格式如何修改

7.5版的编辑器默认会清除多余的word代码,如果要保留word格式怎么修改? CKeditor编辑器默认复制会清除多余word代码,如果要保留word格式可以按下面修改配置: 修改 /e/admin/ecmseditor/infoeditor/config.js(后台) 和 /e/data/ecmseditor/infoeditor/config.js(前台) 文件, 找到: config.toolbar = 'full'; 在这行下面加: config.pasteFromWordRemove

SVN查看项目修改记录及修改内容

工具/原料 svn 一,查看修改记录 1 选择要查看的文件夹,打开之后在空白的地方右键. 2 选择svn里面的"查看日志".show_Log 3 在弹出的日志框里,可以看到,你可以选择要查看的时间,以及修改的作者名,选择其中的一条记录,可以看到这个作者在这个时间点具体做了什么操作,是修改还是新增. 二,查看修改内容在下方方框内,选择具体的修改文件,右键弹出框里选择"与前一个版本进行比较".就可以看到这个版本和上个版本的区别了.或者:双击下面的内容 2 如下

Jquary入门（修改内容）

1. 使用JQ时需要先引用 JQ 包: 其他的JQ代码需要写在引用标签的下面如下图[基本格式] JQ中是纯代码没有判断没有循环如果有时间间隔和延迟则使用JS 代码详见下面例题因为代码放在最后所以 JQ 可以加$(document).ready 也可以不加 <!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/

Git 提交修改内容和查看被修改的内容

我们将仓库里的readme.txt文件修改一下,改成如下内容: Git is a distributed version control systemGit is free software. 运行git status命令查看一下结果: $ git statusOn branch masterChanges not staged for commit: (use "git add <file>..." to update what will be committed) (u

夺命雷公狗---DEDECMS----23dedecms修改内容页面展示的信息

我们在网站上不管点击那个影视作品的A连接都是进入到一个同样的页面,因为他们是一个模版文件: 我们还没有对这个模版进行任何的修改,所以我们要在内容模版增加标签取出对应的影视作品,而且导航条也是按照模版上的显示出来的,我们先来干掉导航条: 这样我们的导航条基本上就完工了,然后就去改下面红框部分的内容了: 在内容页里面dede他们的团队也给了我们流了一个取出东西的标签{dede:field.字段名/},这个方法可以取出不管是存放在主表或者附加表里面的字段信息. 废话不多说开始修改: 然后我们在后台更新

html body的属性格式控制标签内容容器标签超链接标签图片标签表格

一.body的属性 <body bgcolor 页面背景色 background 背景壁纸.图片 text文字颜色 topmargin上边距 leftmargin左边距 rightmargin 右边距 bottommargin下边距></body> 二.格式控制标签 <font color颜色="" face字体="" size大小=""></font> <b></b>

sam格式怎么修改内容

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