折腾这么多都是白瞎,STAR就有输出没有别对上的pair-end reads的功能 参见:How To Filter Mapped Reads With Samtools I had the same issue but with Paired End Reads, and I solved using samtools and bamToFastq. You can find bamToFastq here: https://code.google.com/p/hydra-sv/ If you

2014-12-03 by muzi Docker image = Java class Docker container = Java object 前言 5月份的时候,当我还是一个大学生的时候,有个网友问我,你有研究Docker吗?当时我连Docker是什么都不知道.谷歌之后,对Docker产生兴趣,但是一直没有时间去学习.这个周终于将这个学习计划列入了Todolist.所以我花了3天时间,认真地把这<Docker 从入门到实践>看完并实践了一遍,收获颇丰.虽然我的导师以及我自己还是觉得我

Day1 T1 toy 本题考查你会不会编程. //toy //by Cydiater //2016.11.19 #include <iostream> #include <cstdlib> #include <cstdio> #include <cstring> #include <string> #include <algorithm> #include <queue> #include <map> #in

The Python Tutorial (Python 2.7.11) 的中文翻译版本.Python Tutorial 为初学 Python 必备官方教程,本教程适用于 Python 2.7.X 系列. 在线阅读 » Fork Me » The Python Tutorial (Python 3.5.1) 的中文翻译版本.Python Tutorial 为初学 Python 必备官方教程,本教程适用于 Python 3.5.x. 在线阅读 » Fork Me » Flask 是一个轻量级的 We

程序崩溃经历 其实在很早之前就想写这篇文章了,一直拖到现在. 程序崩溃经历1 平时开发测试的时候好好的,结果上线几天发现有崩溃的问题,其实责任大部分在我身上. 我的责任: 过分信赖文档,没进行容错处理,也就是没有对数据进行相应的判断处理. 下面附上代码,说明崩溃的原因 因第三方公司提供的数据错乱导致有时候创建字典的时候个别value为nil才导致的崩溃 //宏#define CStringToOcString(cstr) [NSString stringWithCString:cstr enco

参考资料: SAMtools(官网) SAM Spec v1.4 (SAM格式 说明书) (重要) samtools-1.3.1 使用手册 (SAMtools软件说明书) samtools常用命令详解(博客园) SAM格式定义(博耘生物) samtools使用方法(plob) 这个学习急不来,而且比对非常重要,先把上面的官方SAM/BAM格式说明文件看透`Sequence Alignment/Map Format Specification` SAMtools解决的问题 非常多序列(read),

先看下 SaveViewState 的源码: // Answer any state this control or its descendants want to save on freeze. // The format for saving is Triplet(myState, ArrayList childIDs, ArrayList childStates), // where myState or childStates and childIDs may be null. inte

前言 前段时间在开发一个广播的功能,网上也自己找了一些库,没有发现非常好用的,于是自己抽时间写了一个,在 Github 上发布一天收获六十多个 star,这里首先感谢大家在微博上的转发,使得 TXScrollLabelView 被更多需要的人知道,同时也非常感谢大家的吐槽及建议,使之诞生 TXScrollLabelView v1.1.1 版本,在此版本中针对大家在微博上的吐槽和建议进行改善,并优化.目前已支持 CocoaPods,后续会支持 Carthage.Github 地址: TXScrol

一个泛型类就是具有一个或者多个类型变量的类. 我们可以只关注泛型,而不会为数据存储的细节而烦恼 . java泛型(一).泛型的基本介绍和使用 http://blog.csdn.net/lonelyroamer/article/details/7864531 泛型的内部原理:类型擦除以及类型擦除带来的问题 http://blog.csdn.net/lonelyroamer/article/details/7868820 java泛型(三).通配符的使用 http://blog.csdn.net/l

cassandra 服务启动流程 1.  setup 1)   CassandraDaemon ->main publicstaticvoidmain(String[]args) { instance.activate(); } 2)   系统參数初始化 配置文件的读取和解析都是在org.apache.cassandra.config.DatabaseDescriptor 类中完毕的,这个类的作用很easy.就是读取配置文件里各个配置项所定义的值,经过简单的验证,符合条件就将其值赋给 Datab

1. 前言 最近又重新复习了一遍支持向量机(SVM).其实个人感觉SVM整体可以分成三个部分: 1. SVM理论本身:包括最大间隔超平面(Maximum Margin Classifier),拉格朗日对偶(Lagrange Duality),支持向量(Support Vector),核函数(Kernel)的引入,松弛变量的软间隔优化(Outliers),最小序列优化(Sequential Minimal Optimization)等. 2. 核方法(Kernel):其实核方法的发展是可以独立于S

前言 本文有配套视频,可以酌情观看. 文中内容因各人理解不同,可能会有所偏差,欢迎朋友们联系我. 文中所有内容仅供学习交流之用,不可用于商业用途,如因此引起的相关法律法规责任,与我无关. 如文中内容对您造成不便,烦请联系 277511806@qq.com 处理,谢谢. 转载麻烦注明出处,谢谢. 本篇资源:链接: https://pan.baidu.com/s/1jIbW2n8 密码: wqe4 从这篇开始我们就将源码托管到 github 上,需要源码的 点我下载,喜欢的话记得点下星星,谢谢! A

为什么要做热更新 当一个App发布之后,突然发现了一个严重bug需要进行紧急修复,这时候公司各方就会忙得焦头烂额:重新打包App.测试.向各个应用市场和渠道换包.提示用户升级.用户下载.覆盖安装. 重点是还会有原来的版本遗留,无论你怎么提示都有人放弃治疗,不愿意升级,强制不能使用体验又足够糟糕到让人不能启齿. 如果这是一个影响公司收入或者体验影响极其不好的Bug,那完蛋了,可能公司老板会对整个技术团队的技术能力丧失信心,其对技术人员的伤害是致命的. 最后最致命的是: 有时候仅仅是因为不小心写错了

创建用户 groupadd -g 800 tibcouseradd -u 801 -g tibco -d /home/tibco/ -s /bin/bash tibco 目前关于sharedatastore的方案是使用NAS. 创建准备使用的nfs目录,并赋权限 cd / mkdir/mqdata chown -R tibco:tibco  /mqdata 安装TIBCO   (TIBCO支持绿色安装,即直接从原来的机器上拷贝tibco目录从新创建配置文件即可使用.) cd /opt/softw

正如在上一篇文章中写道:"据我所知,现在RocketMQ还没有中文文档.我打算自己试着在github上开一个项目,自行翻译."我这几天抽空翻译了文档的前3个小节,发现翻译真的不是一件容易的事情,即便只是翻译这种语言复杂程度较低的技术文档. 翻译文档有很多好处,首先一点就是可以提升阅读英文文档的水平.现在很多开源项目都是国外的,即便是国内的开源项目,为了国际化影响也是先出英文文档,眼前的例子就是RocketMQ.然后,就是翻译文档分享出来,能够帮助一些英文水平还有待提高的开发者朋友们,让

以前只是知道3次握手和4次挥手,但是对于其在连接和断开时的各个状态却不是很懂,今天就来看一下握手和挥手时的状态转换图: 1.三次握手和四次挥手时的状态转换图: 实线表示应用程序: 应用层首先发SYN的请求信号,应用层处于SYN_SENT的状态,当服务器端发送ACK应答,并且服务器端发送给它SYN请求时,处于数据传输状态(ESTABLISHED).当客户端关闭的时候(发送FIN),客户端变成FIN_WAIT_1的状态,当收到ACK时,变成FIN_WAIT_2的状态,当接收到服务器端的FIN时,变成

MaxCompute 是阿里EB级计算平台,经过十年磨砺,它成为阿里巴巴集团数据中台的计算核心和阿里云大数据的基础服务.去年MaxCompute 做了哪些工作,这些工作背后的原因是什么?大数据市场进入普惠+红海的新阶段,如何与生态发展共赢?人工智能进入井喷阶段,如何支持与借力?本文从过去一年的总结,核心技术概览,以及每条技术线路未来展望等几个方面做一个概述. BigData 概念在上世纪90年代被提出,随 Google 的3篇经典论文(GFS,BigTable,MapReduce)奠基,已经发展

前言 只有光头才能变强. 文本已收录至我的GitHub仓库,欢迎Star:https://github.com/ZhongFuCheng3y/3y 在上一篇中已经讲解了如何从零搭建一个SpringBoot+SpringData JPA的环境,测试接口的时候也成功获取得到数据了. 带你搭一个SpringBoot+SpringData JPA的Demo 我的目的是做一个十分简易的管理系统,这就得有页面,下面我继续来讲讲我是怎么快速搭一个管理系统的. ps:由于是简易版,我的目的是能够快速搭建,而不在

1. 分解问题的角度: fix 某一维度,尝试另一维度上的所有可能   a. 可能是array的(i, j)pointers, b. 可能是矩形的长与宽, c. 可能是tree的每一个subtree, d. 可能是情景题的每一对pair...2. 求所有解的, 暴力上backtracking吧3. 如果问最短/最少的, 先想BFS.DP这对好基友:忘了bfs了4. 如果环相关/重复访问, DFS + visited state雄起:忘了visited了5. 如果问连通性, 静态靠DFS/BFS,

openshift封装了k8s,在网络上结合ovs实现了多租户隔离,对外提供服务时报文需要经过ovs的tun0接口.下面就如何通过tun0访问pod(172.30.0.0/16)进行解析(下图来自理解OpenShift(3):网络之 SDN,删除了原图的IP) openshift版本如下: # openshift version openshift v3.6.173.0.5 kubernetes v1.6.1+5115d708d7 etcd 首先在查看openshift上pod(该pod为ela

vuejs可以说是近2年多以来最火的前端框架,随之而来就产生了非常多的组件库,我们来看看其中比较著名和人气旺盛的几个 1. Vuetify-符合material design设计理念, star数量7k+,比较适合于PC上的web应用 2. vuematerial符合google material design理念