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vcftools 拆分文件
2024-10-21
【BCFTOOLS】按样本拆分VCF文件
在对vcf的操作有这样三个软件: Vcftools:主要用于群体分析,文本处理的功能不是很强大,虽然这个软件也可以拆分样本,但是这种拆分不涉及文件的处理,只是保留在分析流程里. GATK .x:这个软件最大的问题就是需要参考基因组,而且序列长度各个方面都要与待处理的文件一致这样就给我们的数据处理带来一定的麻烦. Bcftools:涉及文本的处理,功能很强大,后续随着我的分析还要继续介绍. 利用Bcftools按样本拆分文件主要利用了“--view”这个软件包,主要代码如下: bcftools v
Linux split拆分文件
200 ? "200px" : this.width)!important;} --> 介绍 split可以将一个大文件拆分成指定大小的多个文件,并且拆分速度非常的快,拆分一个1G大小的文件花费不到1S的时间,如果手工在windows上面进行操作估计得卡死. 选项 Usage: split [OPTION]... [INPUT [PREFIX]] Output fixed-size pieces of INPUT to PREFIXaa, PREFIXab, ...; defau
linux_shell_拆分文件_多进程脚本
[需求场景]:一个10000w行的文件处理 ,多进程处理 比如启动100个进程同时处理. [方法]:拆分文件(split) ,制作shell脚本 执行后台进程 [demo]: 假设处理程序为 test.php , 需要接收参数 处理数据文件路径 加 传入参数 eg:part_01 1 [第二个参数用来辅助内部调用不同接口处理] [方法]: demo.data 1000w行 拆分 split -l 10000 demo.data part_ 执行结果 10
linux 拆分文件
split [OPTION]... [INPUT [PREFIX]] :根据行或者大小拆分文件 split file_name :默认把文件file_name拆分成xaa,xab,xac,...... 默认每1000行拆分一次,默认的"PREFIX"为"x",默认后缀为长度为2的字母,即aa,ab,ac,ad,ae,..... -a:后缀的长度 -b :指定拆分后文件的大小 -d : 后缀为数字,默认为00,01,02,03,04,...... -l :指定拆分后文
linux拆分文件
1.先看下文件总的行数: wc -l filename 我们现在来看看它具体的参数该怎么用: split支持自定义输出文件大小和输出文件行数两种模式,此外还可以定义每一行最大的值. -l 按输出文件行数 : input_file out_file -b 按输出文件大小 : input_file out_file(注意-b后边跟的数字需要换算成字节数) 注:out_file为输出文件的前缀 另外,还有 -d 和 -a 两个选项: -d 如果加上-d则后缀为数字,不加则默认为字母 -a 默认为2,意
split - 拆分文件
拆分文件 # 每个文件的行数为1000行 split -l 1000 test.txt # 将test文件拆分,20M一个文件 split -b 20M test.txt test文件拆分,并且文件名依次为 [前缀]aa, [前缀]ab, [前缀]ac等,默认的前缀是X (使用-d选项可以指定后缀为数字,如00,01,02..,而不是aa,ab,ac.)
casperjs在拆分文件后的中文乱码问题的解决
windows环境. capserjs的中文乱码使用phantom.outputEncoding="GBK";即可解决. 但当我们脚本很大,需要拆分时(参考http://docs.casperjs.org/en/latest/writing_modules.html),拆分到另一文件(example.js)时,中文却无法echo出来. 后来发现, example.js是我们用记事本建立的,编码为ANSI,改为UTF-8编码即可正确显示中文. 延伸,若任意脚本为ansi编码,echo中文
java 按内容拆分文件
文件内容为: BC************* **************** *************** BC************* **************** *************** 要将其拆分为文件一: BC************* **************** *************** 文件二: BC************* **************** *************** 文件i: BC************* **********
python_基础学习_02_拆分文件(spilt)
做爬虫经常会有这样的引用场景 ,原始网页存储格式为 url+\t+ html php 有个explode的 拆分文本行方法,比较方便直接接收列值 list($url,$html)=explode("\t",$line); echo $url."\t".$html."\n"; 与之对应的python写法 url,html = line.split("\t") print url+"test"+html 下面
使用hash拆分文件
package readImgUrl; import java.io.BufferedInputStream; import java.io.BufferedReader; import java.io.BufferedWriter; import java.io.File; import java.io.FileInputStream; import java.io.FileOutputStream; import java.io.FileReader; import java.io.File
RandomAccessFile拆分合并文件
import java.io.FileInputStream; import java.io.IOException; import java.io.InputStream; import java.io.RandomAccessFile; import java.io.SequenceInputStream; import java.util.Vector; public class RandonFileAccessTest { public static void main(String[]
C#文件的拆分与合并操作示例
C#文件的拆分与合并操作示例代码. 全局变量定义 ;//文件大小 //拆分.合并的文件数 int count; FileInfo splitFile; string splitFliePath; FileStream splitFileStream; FileInfo joinFile; string joinFliePath; FileStream joinFileStream; 拆分文件操作 private void CheckSplit_Click(object sender, Event
WPS 2019 多个sheet表拆分成独立的excel文件
参考: https://www.cnblogs.com/hackxiyu/p/8945975.html 场景:将多个sheet表拆分成独立的excel文件 一.安装VB工具: 默认情况下:wps -- 开发工具 --- VB 编辑器是灰选状态(即不可用状态),此时需要先安装vb工具:VBA For WPS 2019 安装步骤依次为:vcredist_x86.exe.Vba71.msi.Vba71_1033.MSI.Vba71_2052.msi 二.操作步骤: 点击 [开发工具]-->[vba编辑
excel多个sheet表拆分成独立的excel文件
一.问题: 公司做一个项目,给的用户上报文是一个包含多个sheet页的excel文件, 但是在实际处理报文数据的时候需要拆分excel文件为多个独立的报文excel文件 二.解决: (1)一个一个的复制,新建文件,生成新的sheet文件,sheet多的时候很麻烦 (2)使用office的宏工具来自动化拆分文件 三.操作步骤: 注意:本操作以wps为例,其它的请自行测试 (1)下载[wps vba宏插件] (2)点击 [开发工具]-->[vba编辑器]-->[插入]-->[模块] (3)复
linux - 文件拆分
核心: split 例如,把一个文件以10万行为单位拆分文件, 并且以perfix作为前缀,3位数数字,从000开始递增 split -l 100000 filename.txt -d -a 3 perfix
split分割(拆分)文件
split分割(拆分)文件 需求:指定文件大小拆分文件 # ll -h test/ |grep vmcore -rw-r--r-- 1 root root 12G 12月 7 00:20 vmcore 工具:split 操作过程: # split -b 900M vmcore # ll -h 总用量 23G -rw-r--r-- 1 root root 1.3K 12月 7 00:25 md5.txt -rw-r--r-- 1 root root 12G 12月 7 00:20 vmc
NDK学习笔记-文件的拆分与合并
文件的拆分与合并在开发中经常会用到,上传或是下载的时候都有这样的运用 文件拆分的思路 将文件大小拆分为n个文件 那么,每个文件的大小就是等大小的 如果文件大小被n除不尽,那么就使用n+1个文件来拆分 最后一个文件的大小就是整除不尽的那一部分数据 文件合并的思路 将拆分出来的全部文件胺顺序读取 挨个数据写入到指定文件中 所有文件数据写入完毕 那么合并就完成了 代码实现 布局文件(activity_main.xml) <LinearLayout xmlns:android="http://sc
C# 合并和拆分PDF文件
一.合并和拆分PDF文件的方式 PDF文件使用了工业标准的压缩算法,易于传输与储存.它还是页独立的,一个PDF文件包含一个或多个"页",可以单独处理各页,特别适合多处理器系统的工作.PDF文件结构主要可以分为四个部分:首部.文件体.交叉引用表.尾部.PDF操作类非常多,如下图所示,常用的操作PDF文件的类库有:Spire.Pdf.iTextSharp. 二.使用 Spire.Pdf 合并和拆分PDF文件 使用 Nuget 添加Spire.Pdf 类库,然后添加如下代码: 1 /// &
split命令_Linux split命令:切割(拆分)文件
<Linux就该这么学>是一本基于最新Linux系统编写的入门必读书籍,内容面向零基础读者,由浅入深渐进式教学,销量保持国内第一,年销售量预期超过10万本.点此免费在线阅读. 15 分钟之后,我要去朋友家聚会.我打算从我的台式机上把一部 700MB 大小的美国大片拷贝出来,带到朋友家去看,可是我的两个优盘都只有 512MB,这让我如何是好? 别急,用 10 分钟赶快来认识一下我们的 split 拆分小能手,一切问题将迎刃而解.当遇到大文件而苦不堪言的时候,split 就会像天使一样解救我们于水
python拆分CANLog
通过CANOE 导出的log通常有很多个ID的数据,如何才能找到某一个ID下的特殊的信号?利用python可以简单的进行这个步骤,代码如下: 说明: 最终的效果是将log信息,分不同的ID进行拆分,并单独生成文件log_id.csv的文件夹. 1. 需要输入输入文件夹 2. 生成_out文件夹. 3. 没有错误处理 4. 采用"[A-F|\d]{3}"匹配CAN ID #log analy about CAN Signal for CANOE import os import re I
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