Theano2.1.17-基础知识之剖析theano的函数
来自:http://deeplearning.net/software/theano/tutorial/profiling.html
Profiling Theano function
note:该方法是用来代替旧的ProfileMode.不要再使用ProfileMode了。
在检查错误的同时,另一个重要的任务就是剖析你的代码。你会用到theano 的flags 或者参数,然后将它们传递给 theano.function。
最简单的剖析theano函数的方式就是使用下面介绍的theano flags。当进程存在的时候,它们会将信息输出到stdout(标准输出流)。
使用 ProfileMode 是一个三步过程
开启这个分析器是很简单的,只需要用到 flag config.profile.
确保内存分析器用到theano 的flag: config.profile_memory 和 config.profile.
为了能够在theano优化的时候进行分析,使用theano 的flag: config.profile_optimizer 和 config.profile.
你可以使用theano 的flags profiling.n_apply、profiling.n_ops 和profiling.min_memory_size 来修改打印信息的数量。
分析器会对每个theano函数进行分析,而且会分析打印出的分析的总和。每个分析包含4个部分:全局信息,类信息,ops信息和apply节点信息。
在全局部分, “Message” 就是theano函数的名称, theano.function() 有一个可选的参数 name 而这个默认是为None。对name进行有意义的赋值有助于你分析许多theano函数
。在这个部分中,我们同样看到函数调用的次数和在所有这些调用上花费的总的时间。花费在Function.fn.__call__ 上和在块中的时间分析有助于理解theano的开销。
同样的,我们看到在编译过程的两个阶段上时间的花费:优化(修改graph使得能够更加的稳定/快速) 和链接(编译c 代码并可以被python调用).
类,ops和apply节点部分有着相同的信息:关于运行的apply节点的信息。ops部分会从apply部分得到有用的信息然后融合那些有着相同op的apply节点。如果在graph中两个apply节点有着两个相同的ops,那么它们会被融合。一些节点比如逐元素,如果它们的参数不同的话(被执行的标量),就不相等了。 所以类部分会比ops部分融合更多的apply节点。
这里就是一个当我们禁用某些theano优化来更加直观清晰的理解不同的部分之间的差异的一个例子。在当所有的优化都启用的时候,那么在graph中就只剩下一个op了。
note:
为了剖析在gpu上内存使用的高峰情况,你需要:
* 在文件中 theano/sandbox/cuda/cuda_ndarray.cu, 设置宏
COMPUTE_GPU_MEM_USED to 1.
* 然后调用 theano.sandbox.cuda.theano_allocated()
它返回一个有着2个int值的元组.第一个值就是指示当前的gpu分配给theano的内存;第二个就是theano占用gpu内存使用的峰值。
不要总是开启这个宏,这会减慢内存分配和释放。而且还会减慢计算速度,所以会影响到速度分析。所以不要在这些情况下开启这个。
运行这个例子:
THEANO_FLAGS=optimizer_excluding=fusion:inplace,profile=True python doc/tutorial/profiling_example.py
输出:
Function profiling
==================
Message: None
Time in 1 calls to Function.__call__: 5.698204e-05s
Time in Function.fn.__call__: 1.192093e-05s (20.921%)
Time in thunks: 6.198883e-06s (10.879%)
Total compile time: 3.642474e+00s
Theano Optimizer time: 7.326508e-02s
Theano validate time: 3.712177e-04s
Theano Linker time (includes C, CUDA code generation/compiling): 9.584920e-01s Class
---
<% time> <sum %> <apply time> <time per call> <type> <#call> <#apply> <Class name>
100.0% 100.0% 0.000s 2.07e-06s C 3 3 <class 'theano.tensor.elemwise.Elemwise'>
... (remaining 0 Classes account for 0.00%(0.00s) of the runtime) Ops
---
<% time> <sum %> <apply time> <time per call> <type> <#call> <#apply> <Op name>
65.4% 65.4% 0.000s 2.03e-06s C 2 2 Elemwise{add,no_inplace}
34.6% 100.0% 0.000s 2.15e-06s C 1 1 Elemwise{mul,no_inplace}
... (remaining 0 Ops account for 0.00%(0.00s) of the runtime) Apply
------
<% time> <sum %> <apply time> <time per call> <#call> <id> <Apply name>
50.0% 50.0% 0.000s 3.10e-06s 1 0 Elemwise{add,no_inplace}(x, y)
34.6% 84.6% 0.000s 2.15e-06s 1 2 Elemwise{mul,no_inplace}(TensorConstant{(1,) of 2.0}, Elemwise{add,no_inplace}.0)
15.4% 100.0% 0.000s 9.54e-07s 1 1 Elemwise{add,no_inplace}(Elemwise{add,no_inplace}.0, z)
... (remaining 0 Apply instances account for 0.00%(0.00s) of the runtime)
参考资料:
[1]官网:http://deeplearning.net/software/theano/tutorial/profiling.html
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