eQTL | Expression quantitative trait loci | 数量性状位点 | 表达数量性状基因座
一篇通俗的文章:eQTL
Expression quantitative trait loci (eQTLs) are genomic loci that explain all or a fraction of variation in expression levels of mRNAs.
基因组位点,解释了基因表达的变化。
A quantitative trait locus (QTL) is a section of DNA (the locus) which correlates with variation in a phenotype (the quantitative trait).
身高,连续性状的控制位点。
QTL是数量性状位点,比如身高是一个数量性状,其对应的控制基因的位点就是一个数量性状位点,而eQTL就是控制数量性状表达位点,即能控制数量性状基因(如身高基因)表达水平高低的那些基因的位点。
都是位点,一个是常规数量性状,如身高;另一个就是基因表达性状,如Sox10基因的表达;都是在找一些与其具有强烈相关性的(snp)位点。
QTL定位的核心就是连锁。
eQTL | Expression quantitative trait loci | 数量性状位点 | 表达数量性状基因座的更多相关文章
- eQTL | Expression quantitative trait loci | 表达数量性状基因座 | QTL | 数量性状位点
到底什么是eQTL? eQTL和QTL之间有什么联系?为什么说QTL比eQTL难很多? QTL和GWAS有什么关系? GTEx数据库里的eQTL数据如何利用? 说eQTL之前必须先解释QTL,QTL, ...
- NCBI上查看SNP位点在哪个基因座上(locus)
首先,进入NCBI的主页网站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/variation/view/ 进入后,在下图红色框框位置输入目的SNP,比如rs608139 输完后,出现如下 ...
- eQTL
首先QTL是数量性状位点,比如身高是一个数量性状,其对应的控制基因的位点就是一个数量性状位点,而eQTL就是控制数量性状表达位点,即能控制数量性状基因(如身高基因)表达水平高低的那些基因的位点. 数量 ...
- variant变异 | Epigenome表观基因组 | Disease-susceptible gene 疾病易感基因
paper:cepip: context-dependent epigenomic weighting for prioritization of regulatory variants and di ...
- 全基因组选择育种(GS)简介
全基因组选择(Genomic selection, GS)是一种利用覆盖全基因组的高密度标记进行选择育种的新方法,可通过早期选择缩短世代间隔,提高育种值(Genomic Estimated Breed ...
- Targeted Learning R Packages for Causal Inference and Machine Learning(转)
Targeted learning methods build machine-learning-based estimators of parameters defined as features ...
- MongoDB with D3.js
MongoDB with D3.js I consider interactive data visualization to be the critical tool for exploration ...
- 用variant的数据来推导基因表达 | Imputation of Expression Using PrediXcan
一个工具的逻辑得足够完善.意义足够重大,才有资格发在NG上. A gene-based association method for mapping traits using reference tr ...
- RNA测序相对基因表达芯片有什么优势?
RNA测序相对基因表达芯片有什么优势? RNA-Seq和基因表达芯片相比,哪种方法更有优势?关键看适用不适用.那么RNA-Seq适用哪些研究方向?是否您的研究?来跟随本文了解一下RNA测序相对基因表达 ...
随机推荐
- 使用SSH框架遇到的错误总结
1.org.hibernate.exception.ConstraintViolationException: could not insert: 如果是主键是自增序列,映射文件 指定主键生成器< ...
- topcoder srm 495 div1
problem1 link 从前向后确定一下,然后再从后向前确定一下.一样的话就是可以确定的. problem2 link 首先将强连通分量缩点.理论上来说,只需要遍历所有入度为0的联通块中的一个即可 ...
- HTML DOM open() 方法
HTML DOM Window 对象 定义和用法 open() 方法用于打开一个新的浏览器窗口或查找一个已命名的窗口. 语法 window.open(URL,name,features,replace ...
- 【htop】Linux CentOS 6.5下安装htop进程管理工具
一.Htop的使用简介 This is htop, an interactive process viewer for Linux. It is a text-mode application (fo ...
- docker的安装和使用
docker在linux上安装我尝试了几次,都报错了,看到其它人的博客说明这也确实是个问题. 后来在朋友给安装了一个VMware虚拟机后,很方便地就在里面进行了安装. 概念理解: 仓库: 别人做好的现 ...
- maven web项目配置log4j,及log4j参数设置
本文为博主原创,转载须注明转载地址: 1.在maven项目中引入相关的依赖: 需要依赖的jar为: <!-- 配置日志 --> <dependency> <groupId ...
- 【译】第45节---EF6-索引属性
原文:http://www.entityframeworktutorial.net/entityframework6/index-attribute-in-code-first.aspx Entity ...
- [luogu]P1852跳跳棋
题目重点是每次不能跳过两个棋子 即对于每一个棋子的状态(a,b,c) (a<b<c) 最多有两种移动的方式 1.中间往两边跳 (a,b,c)-->(2b-a,a,c)或(a,c,2b ...
- 【Selenium2】【项目实战】
[public/login.py] from selenium import webdriverfrom selenium.webdriver.common.by import Byimport ti ...
- React创建组件的三种方式及其区别
内容转载于http://www.cnblogs.com/wonyun/p/5930333.html React推出后,出于不同的原因先后出现三种定义react组件的方式,殊途同归; 具体的三种方式: ...