All DNA is composed of a series of nucleotides abbreviated as A, C, G, and T, for example: "ACGAATTCCG". When studying DNA, it is sometimes useful to identify repeated sequences within the DNA.

Write a function to find all the 10-letter-long sequences (substrings) that occur more than once in a DNA molecule.

For example,

Given s = "AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT",

Return:
["AAAAACCCCC", "CCCCCAAAAA"].

问题:给定一个字符串序列,代表 DNA 序列,求其中有重复出现的长度为 10 的子序列。

题目中的例子都是不重叠的重复字串,实际上相互重叠的字串也是要统计进去,例如11位的 "AAAAAAAAAA" 就包含两个长度为 10 的"AAAAAAAAAA" 的重复子序列。这一点是题目没有说清楚的。

明确题目后,实现思路也比较简单:

  • 将 s 中所有长度为 10 的连续子字符串放入 map<string, int> ss_cnt 中,数各个连续字符串出现的的次数
  • 将 [0, 9] 视为窗口,将 ss_cnt 中窗口字符串对于的 value 减 1 ,然后判断 ss_cnt 中是否还存在一个 窗口字符串, 若存在则表示窗口字符串是重复的。
  • 将窗口向右移动一个,继续重复第二步,直至窗口移至最右端
     /**
* 重复子字符串 可以重叠。
*/
vector<string> findRepeatedDnaSequences(string s) {
unordered_set<string> res; unordered_map<string, int> ss_cnt; int len = ; for (int i = ; i + len - < s.size(); i++) {
string str = s.substr(i, len);
ss_cnt[str]++;
} int i = ;
while (i + len - < s.size()) { string cur = s.substr(i, len);
ss_cnt[cur]--; if (ss_cnt[cur] > ) {
res.insert(cur);
} ss_cnt[cur]++;
i++;
} vector<string> result; unordered_set<string>::iterator s_iter;
for (s_iter = res.begin(); s_iter != res.end(); s_iter++) {
result.push_back(*s_iter);
} return result;
}

[LeetCode] 187. Repeated DNA Sequences 解题思路的更多相关文章

  1. Java for LeetCode 187 Repeated DNA Sequences

    All DNA is composed of a series of nucleotides abbreviated as A, C, G, and T, for example: "ACG ...

  2. 【LeetCode】187. Repeated DNA Sequences 解题报告(Python)

    作者: 负雪明烛 id: fuxuemingzhu 个人博客: http://fuxuemingzhu.cn/ 题目地址: https://leetcode.com/problems/repeated ...

  3. [LeetCode] 187. Repeated DNA Sequences 求重复的DNA序列

    All DNA is composed of a series of nucleotides abbreviated as A, C, G, and T, for example: "ACG ...

  4. 【LeetCode】Repeated DNA Sequences 解题报告

    [题目] All DNA is composed of a series of nucleotides abbreviated as A, C, G, and T, for example: &quo ...

  5. leetcode 187. Repeated DNA Sequences 求重复的DNA串 ---------- java

    All DNA is composed of a series of nucleotides abbreviated as A, C, G, and T, for example: "ACG ...

  6. [LeetCode#187]Repeated DNA Sequences

    Problem: All DNA is composed of a series of nucleotides abbreviated as A, C, G, and T, for example: ...

  7. [leetcode]187. Repeated DNA Sequences寻找DNA中重复出现的子串

    很重要的一道题 题型适合在面试的时候考 位操作和哈希表结合 public List<String> findRepeatedDnaSequences(String s) { /* 寻找出现 ...

  8. 【LeetCode】187. Repeated DNA Sequences

    题目: All DNA is composed of a series of nucleotides abbreviated as A, C, G, and T, for example: " ...

  9. 【leetcode】Repeated DNA Sequences(middle)★

    All DNA is composed of a series of nucleotides abbreviated as A, C, G, and T, for example: "ACG ...

随机推荐

  1. 那些年不错的Android开源项目(转)

    第一部分 个性化控件(View) 主要介绍那些不错个性化的View,包括ListView.ActionBar.Menu.ViewPager.Gallery.GridView.ImageView.Pro ...

  2. HDU 3037(Lucas定理)

    对于很大的组合数不能用C(n, m) = C(n - 1, m) + C(n-1, m -1)来求,这里就用到Lucas定理. 模板题: hdu3037:模板如下: #include <cstd ...

  3. QT pro文件解析

    在QT中使用qmake自动生成pro文件,如果要自己定制工程选项,则需要自行修改pro文件. pro文件有以下关键字:TEMPLATE.TARGET.DESTDIR.DEPENDPATH.INCLUD ...

  4. 基于CANVAS与MD5的客户端生成验证码

    好久没写东西,工作太忙了!不想服务端请求太多,搞了个这玩意儿,不过项目中并不会用上,还是使用服务端生成的机制(会安全多少呢?):我就想问个问题,除了图像识别来破解这样的简单验证码外,针对我这种例子,可 ...

  5. css.day03

    css的分类(位置): css层叠样式表 1.内嵌 样式表 2.行内样式表 3. 外连 css选择器分类 基础选择器 标签 id选择器 类选择器 复合选择器 交集选择器(标签指定式)  span.on ...

  6. 关于IO学习的几个函数

    这是最近学到的几个关于IO文件操作的几个小算法,今天总结出来. 1. 删除一个给定的目录,这上目录不为空目录,使用递归来实现 public void test04(File file) { File[ ...

  7. (转帖) 有限狀態機FSM coding style整理 (SOC) (Verilog)

    来源:http://www.codesoso.net/Record/101092_95120_21.html 来源:http://www.cnblogs.com/oomusou/archive/201 ...

  8. iOS微信支付

    SDK接入 服务器签名版本 官方已经是建议使用服务器签名来接入微信支付,实际上从安全上考虑,确实是每个客户端不应该知道RAS密钥,也不需要每个客户端都写一遍签名的算法. 服务端接入流程文档:https ...

  9. MYSQL :逗号分隔串表,分解成竖表

    DROP TEMPORARY TABLE IF EXISTS Temp_Num ; CREATE TEMPORARY TABLE Temp_Num ( xh INT PRIMARY KEY ); -- ...

  10. C语言零移位操作

    给定一个整形数组要求把其中的零元素移动到数组的末尾 非零元顺序保持不变 以下采用两种方法实现 #include <stdlib.h> #include <stdio.h> #i ...