服务器部署简介

之前学过一点点R shiny,但只是自己随便在本地R中试用,没试过部署服务器。最近老板要我写个小工具供用户使用,没搞过,头有点大。

一般地,可将shiny部署在shinyapps.io上,适合小工具,但免费数量有限,国外服务器访问慢,不宜公开部署。

部署示例代码:

####===========部署在shinyapps.io上============
# install.packages('rsconnect')
library(rsconnect) #新增token
rsconnect::setAccountInfo(name='testtools',
token='D244566F2D704DE8FA3F558B556D835B',
secret='/SmfgeahhjGdKczf8VZUaKRfYnsEjekEm92') setwd("./")
#试运行
shiny::runApp()
#部署
deployApp()
#部署完成自动弹出网页,名称是app.R的目录名

shinyapps.io部署可参考:

shinyapp 部署的两种方法

shinydashboard系列六:部署与加密

二是可以将shiny部署在本地的服务器或者云服务器上。通常的操作是在ubuntu或centos系统上安装R及Rstudio-server,然后再进行IP地址和端口的配置,但前提是需要root权限安装(Rstudio-server一般是root安装,创建普通新用户登录)。关于本地服务器部署可参考教程:

在服务器中使用R--RStudio Server

服务器上搭shinyApp:shiny-server配置及报错解决

Rstudio-server的安装与使用

如何使用Shiny Server部署R应用程序

安装R Shiny Server

windows打包部署

另一种方法就是将脚本及其依赖的所有文件和环境打包,利用工具封装部署在本地。

具体过程参考Lee Pang的建议,如下:

1. 部署基本框架

Shiny的运行需要R环境,浏览器以及脚本,因此封装需要R-Portable,GoogleChromePortable,以及前端页面脚本ui.R和服务端脚本server.R(或者整合为一个的app.R)。

下载R PortableGoogle Chrome Portable

新建文件夹test,将上述两个工具安装到test文件夹下,同时此目录下新建shiny文件夹,将shiny需要运行的脚本app.R以及脚本所需的资源文件夹www一起放入到shiny文件夹下,目前test文件夹下结构如下:

2.安装shiny脚本需要的依赖包

将以下代码添加到 test文件夹下的R-Portable/App/R-Portable/etc/Rprofile.site文件末尾中,目的为了将shiny所依赖的包安装到R-Portable的library中,而不影响原来系统R软件所安载的包。

.First = function(){
.libPaths(.Library)
}

打开 R-Portable.exe,安装shiny程序所依赖的包。安装后的包在R-Portable/library下:

.libPaths() #检测上面设置的R-Portable的Library是否可用
install.packages('shiny')
install.packages('shinydashboard')
install.packages('ggplot2')

3.创建运行shiny的程序

首先,创建一个名为runShinyApp.R的脚本,目的是:

  • 设置 .libPaths() 指向本地的R-Portable library库
  • 设置shiny运行打开的浏览器为本地安装的GoogleChromePortable
  • 运行shiny脚本app.R, runApp()
message('library paths:\n', paste('... ', .libPaths(), sep='', collapse='\n'))

chrome.portable = file.path(getwd(),
'GoogleChromePortable/App/Chrome-bin/chrome.exe') launch.browser = function(appUrl, browser.path=chrome.portable) {
message('Browser path: ', browser.path)
shell(sprintf('"%s" --app=%s', browser.path, appUrl))
} shiny::runApp('./shiny/', launch.browser=launch.browser)

然后,再创建一个名为run.vbs的shell脚本运行runShinyApp.R,内容如下:

Rexe           = "R-Portable\App\R-Portable\bin\Rscript.exe"
Ropts = "--no-save --no-environ --no-init-file --no-restore --no-Rconsole"
RScriptFile = "runShinyApp.R"
Outfile = "ShinyApp.log"
strCommand = Rexe & " " & Ropts & " " & RScriptFile & " 1> " & Outfile & " 2>&1" intWindowStyle = 0 ' Hide the window and activate another window.'
bWaitOnReturn = False ' continue running script after launching R ' ' the following is a Sub call, so no parentheses around arguments'
CreateObject("Wscript.Shell").Run strCommand, intWindowStyle, bWaitOnReturn

在windows中直接双击run.vbs即可调用以上程序实现界面展示。

最后,我们需要加如下一段代码到shiny程序的服务器端脚本server.R(或者app.R的server函数的结尾)中,目的是保证如果shiny::runApp()运行后网页关闭,则程序停止运行。

shinyServer(function(input, output, session){
session$onSessionEnded(function() {
stopApp()
})
})

以上操作完成了基本shiny本地的框架,test文件夹结构如下:



双击run.vbs ,正常情况下会打开shiny的网页展示,跟在R中运行显示的一样,如果没有显示,请检查ShinyApp.log。

如果想将此本地shiny发送给客户,则直接打包test文件夹,发送给客户后解压双击run.vbs即可,不过这样的文件比较大(通常上百兆),而且泄露了源码。

也可以制作安装包,使用InnoSetup工具生成可执行的.exe文件。

以上主要参考了Shiny本地网页部署与实现教程,感谢作者。

【报错解决】无法定位程序输入点EXTPTE_PTR于动态链接库

直接运行时,可能会遇到无法定位程序输入点EXTPTE_PTR于动态链接库的报错,这是Rcpp的版本错误,参考这个答案:https://blog.csdn.net/weixin_42815846/article/details/106972453

,重新安装R(但我已经是最新版本的R4.0.2了),不行。在评论中找到解决方法,即把我另一台电脑上的R3.6.1的Rcpp中的Rcpp.dll复制过来覆盖掉R-Portable library库中的Rcpp.dll。这个文件的路径在library\Rcpp\libs\x64文件夹下。

将小工具打包成exe可执行文件

先用InnoSetup试了下,但制作安装包的过程是必需有exe文件的,vbs文件加载不了。

主要参考这2篇:

Inno Setup生成安装包

Inno Setup打包教程

于是考虑直接将vbs文件转换为exe文件。网上查了下,先用vbsedit试了下,参考这个教程:VBS如何编译成exe文件 vbsedit如何使用,成功转换了,也可以调用,但个人觉得这个软件比较大,配置也不友好,不推荐。

试了下另一款软件vbs to exe,教程参考:VBS转化为exe可执行文件,使用非常简单。

将run.vbs转换为run.exe后,我再试着用Inno Setup将它打包成setup安装文件,成功了,但安装后还是调用不了run.exe,遂放弃安装模式。

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