断断续续使用simpleitk处理CT和X光图片有些时间了，但是学的知识都比较零散，没有形成系统的概念，于是对着SimpleITK的英文文档https://simpleitk.readthedocs.io/en/master/index.html学习一遍，再结合自己的一点经验，做一点总结。

SimpleITK是ITK的简化接口，使用起来更加方便，有多种语言接口，我平时用的都是python版，安装比较简单，pip install SimpleITK即可

SimpleITK是专门处理医学影像的软件，在SimpleITK中，图像的概念与我们在计算机视觉中常用的RGB图像差异很大，后者只是一个多维矩阵，是一个数学上的概念，而在SimpleITK中，图像是一种物理实体，图像中的每一个像素都是物理空间中的一个点，不光有着像素值，还有着坐标，间距，方向等概念

下图是一个直观的解释

size：图像在各维度的像素个数

spacing：图像各维度上像素之间的距离（物理层面的，有单位，一般为mm)

physical extent：图像在物理空间中的大小

Origin：图像原点的坐标（物理层面的，有单位，一般为mm，与spacing保持一致）

direction：采用方向余弦矩阵，也就是图像自身坐标系相对于世界坐标系（固定不动的）的角度，再直白点就是新坐标系在原坐标系上各个方向的投影，百度百科https://baike.baidu.com/item/方向余弦

为了强调此处的图像不仅仅是一个数字组成的矩阵，用图说话

两幅图的内容能看出来是一样的，但是像素间距不同

再看

两幅图内容一样，但是方向和坐标原点都不同，在SimpleITK中是不同的图像

SimpleITK学习（一）基本概念的更多相关文章

  1. Oracle RAC学习笔记:基本概念及入门

    Oracle RAC学习笔记:基本概念及入门 2010年04月19日 10:39 来源:书童的博客 作者:书童 编辑:晓熊 [技术开发 技术文章]    oracle 10g real applica ...

  2. Java IO学习笔记：概念与原理

    Java IO学习笔记:概念与原理   一.概念   Java中对文件的操作是以流的方式进行的.流是Java内存中的一组有序数据序列.Java将数据从源(文件.内存.键盘.网络)读入到内存 中,形成了 ...

  3. Prolog学习：基本概念 and Asp.net与Dojo交互：仪器仪表实现

    Asp.net与Dojo交互:仪器仪表实现 项目中需要用到仪器仪表的界面来显示实时的采集信息值,于是便遍地寻找,参考了fusionchart和anychart之后,发现都是收费的,破解的又没有这些功能 ...

  4. Python学习：基本概念

    Python学习:基本概念 一,python的特点: 1,python应用场景多;爬虫,网站,数据挖掘,可视化演示. 2,python运行速度慢,但如果CPU够强,这差距并不明显. 3,严格的缩进式编 ...

  5. Docker学习之基本概念

    Docker学习之基本概念 作为一个后端noder,不了解docker有点说不过去,这节开始,学习一些docker层面的东西. 什么是docker Docker最初是dotCloud公司创始人Solo ...

  6. Hadoop YARN学习之核心概念（2）

    Hadoop YARN学习之核心概念(2) 1. Hadoop 2.X YARN引入的新服务 1.1 新的ResourceManager纯碎作为资源调度器,是集群资源的唯一仲裁者: 1.2 用户应用程 ...

  7. jQuery学习笔记之概念（1）

    jQuery学习笔记之概念(1) ----------------------学习目录-------------------- 1.概念 2.特点 3.选择器 4.DOM操作 5.事件 6.jQuer ...

  8. （一）Netty源码学习笔记之概念解读

    尊重原创,转载注明出处,原文地址:http://www.cnblogs.com/cishengchongyan/p/6121065.html  博主最近在做网络相关的项目,因此有契机学习netty,先 ...

  9. 菜鸟学习WCF笔记-概念

    背景 WCF这个词语一直不陌生,以前也使用过多次在实际的项目中,但是一直没有时间来做个系统的学习,最近抽点时间,看看 蒋金楠的<WCF全面解析>学习下,顺带做些笔记,如有错误,欢迎各路大神 ...

随机推荐

  1. python 的输入和输出

    内置函数:raw_inpurt('place input') print getpass  隐藏输入密码 import getpass pwd = getpass.getpass("> ...

  2. transition与animation的区别

    transition需要事件触发,animation可以直接自动触发,而且功能上更为强大,包括可以设置不同时间段的动画规则,还有状态的控制,事件等等.

  3. aspnetcore的那些actionresult们

    比MVC5多了n个actionresult,傻傻分不清,整理了下,妈妈再也不用担心了 https://docs.asp.net/projects/api/en/latest/autoapi/Micro ...

  4. UVa 1608 Non-boring sequences (分治)

    题意:给你一个长度为n序列,如果这个任意连续子序列的中都有至少出现一次的元素,那么就称这个序列是不无聊的,判断这个序列是不是无聊的. 析:首先如果整个序列中有一个只出过一次的元素,假设是第 p 个,那 ...

  5. 七）oracle 2 mysql

    /* Navicat MySQL Data Transfer Source Server : localhost Source Server Version : 50527 Source Host : ...

  6. Atcoder 2159 連結 / Connectivity(并查集+map乱搞)

    問題文N 個の都市があり.K 本の道路と L 本の鉄道が都市の間に伸びています. i 番目の道路は pi 番目と qi 番目の都市を双方向に結び. i 番目の鉄道は ri 番目と si 番目の都市を双 ...

  7. opencv——pcb上寻找mark点（拟合椭圆的方法）

    #include "stdafx.h" // FitCircle.cpp : 定义控制台应用程序的入口 #include "cv.h" #include &qu ...

  8. memcached整理の分布式集群算法

    memcached如何实现分布式? memcached是一个“分布式内存对象缓存系统”,然而memcached并不像mongodb那样,允许配置多个节点,且节点之间“自动分配数据”,就是说memcac ...

  9. java学习（六）面向对象 final关键字 多态

    1.被fnial修饰的方法不能被重写,常见的为修饰类,方法,变量 /* final可以修饰类,方法,变量 特点: final可以修饰类,该类不能被继承. final可以修饰方法,该方法不能被重写.(覆 ...

  10. MVC4 Filter (筛选器)

    Filter,在MVC中我们通常将Filter定义成Attribute特性 来供Controller 或者Action 方法调用. FilterAttribute 是所有Filter 的基类. 而 F ...