interpro 数据库
interpro 通过整合多个蛋白相关的数据库,提供了一个方便的对蛋白序列进行功能注释的平台,功能注释的内容包括蛋白质家族预测,domain 和 结合位点预测
interoro 在整合多个数据库的同时,去掉了冗余,提供了一个统一的接口,用来对序列进行功能注释;而且还提供了interproscan 这样的命令行工具,可以方便的对
大规模的蛋白序列进行注释,目前, UniprotKB 和 Gene Ontology 就是使用 interproscan 对蛋白序列进行注释的。
interpro 数据库每两个月更新一次
interpro 的成员数据库包括:
CATH-Gene3D
CDD
MobiDB:
HAMAP:
PANTHER:
PIRSF:
PRINTS:
ProDom:
PROSITE:
SFLD:
SMART:
SUPERFAMILY:
TIGRFAMS:
Pfam
:
interpro 数据库的更多相关文章
- interproscan 软件对序列进行GO 注释
interproscan 软件实际上将对输入的查询序列和interpro 数据库中的序列去比对,将比对上的序列对应的GO信息作为查询序列的GO注释 在interpro 数据库中,每条蛋白质序列有一个唯 ...
- JSP应用开发 -------- 电纸书(未完待续)
http://www.educity.cn/jiaocheng/j9415.html JSP程序员常用的技术 第1章 JSP及其相关技术导航 [本章专家知识导学] JSP是一种编程语言,也是一种动 ...
- 生物信息大数据&数据库(NCBI、EBI、UCSC、TCGA)
想系统的学习生信数据库可以先看一下北大的公开课,有一章专门讲的数据库与软件: -生物信息学:导论与方法 北大\ 生物信息数据库及软件资源 一个优秀的生信开发者能够解决如下问题: 如何鉴定一个重要的且没 ...
- nodejs进阶(6)—连接MySQL数据库
1. 建库连库 连接MySQL数据库需要安装支持 npm install mysql 我们需要提前安装按mysql sever端 建一个数据库mydb1 mysql> CREATE DATABA ...
- GreenDao 数据库:使用Raw文件夹下的数据库文件以及数据库升级
一.使用Raw文件夹下的数据库文件 在使用GreenDao框架时,数据库和数据表都是根据生成的框架代码来自动创建的,从生成的DaoMaster中的OpenHelper类可以看出: public sta ...
- ASP.NET MVC with Entity Framework and CSS一书翻译系列文章之第二章:利用模型类创建视图、控制器和数据库
在这一章中,我们将直接进入项目,并且为产品和分类添加一些基本的模型类.我们将在Entity Framework的代码优先模式下,利用这些模型类创建一个数据库.我们还将学习如何在代码中创建数据库上下文类 ...
- Java MyBatis 插入数据库返回主键
最近在搞一个电商系统中由于业务需求,需要在插入一条产品信息后返回产品Id,刚开始遇到一些坑,这里做下笔记,以防今后忘记. 类似下面这段代码一样获取插入后的主键 User user = new User ...
- 在SQL2008查找某数据库中的列是否存在某个值
在SQL2008查找某数据库中的列是否存在某个值 --SQL2008查找某数据库中的列是否存在某个值 create proc spFind_Column_In_DB ( @type int,--类型: ...
- 分享一个SQLSERVER脚本(计算数据库中各个表的数据量和每行记录所占用空间)
分享一个SQLSERVER脚本(计算数据库中各个表的数据量和每行记录所占用空间) 很多时候我们都需要计算数据库中各个表的数据量和每行记录所占用空间 这里共享一个脚本 CREATE TABLE #tab ...
随机推荐
- 【教程】鼠标右键新建添加RTF文档
鼠标右键新建添加RTF文档 今天想将空间日志作个本地备份,但是苦于找不到适合的文本工具,因为一般的文本编辑工具都不支持贴图. 虽然word就可以满足我们的需求,但文件格式不用doc而是rtf 而 ...
- Logstash写入MongoDB数据库
1. 列出logstash-plugins bin/logstash-plugin list****** logstash-output-kafkalogstash-output-nagioslogs ...
- window.opener方法的使用 js 跨域
用到了这个方法: window.opener.location.reload() 与 window.opener.location.href=window.opener.location.href 都 ...
- Leetcode:Scramble String 解题报告
Scramble String Given a string s1, we may represent it as a binary tree by partitioning it to two no ...
- Android开发(九)——ViewFlipper实现图片轮播
图片轮播的实现方法有很多,主要有View.ViewFilpper.ViewFilpper系统自带的一个多页面管理控件,它可以实现子界面的自动切换. 首先 需要为ViewFlipper加入View (1 ...
- 1. 决策树(Decision Tree)-决策树原理
1. 决策树(Decision Tree)-决策树原理 2. 决策树(Decision Tree)-ID3.C4.5.CART比较 1. 前言 决策树是一种基本的分类和回归方法.决策树呈树形结构,在分 ...
- ios label 简单的长按复制文本信息
在iOS开发过程中,有时候会用到UILabel展示的内容,那么就设计到点击UILabel复制它上面展示的内容的功能,也就是Label长按复制功能.网上有很多种给Label添加长按复制功能的方法,这里我 ...
- vue-router "path" is required in a route configuration
启用了动态路由,一直提示这个错误,页面打开也是空白,后来发现原来是component参数错误. 正确的写法为: component: () => import ('@/views/own-spa ...
- go语言可变参数的坑
0x00 前提 对可变参数不了解的同学,可以先看这篇文章可变参数终极指南 0x01 第一个坑 不能通过空接口类型向可变参数传递一个普通的切片 ,需要将普通切片转换为空接口切片 0x02 第二个坑 可变 ...
- 封装篇——图片模块(Glide)
如今市面上差点儿全部的app都用到了图片,图片模块的开发是app开发中不可缺少的一块工作, 开源的力量是强大的.好多优秀的第三方项目能够任君使用,帮助我们提高效率.而且不须要反复造轮子,这边我採用的是 ...