interpro 通过整合多个蛋白相关的数据库，提供了一个方便的对蛋白序列进行功能注释的平台，功能注释的内容包括蛋白质家族预测，domain 和 结合位点预测

interoro 在整合多个数据库的同时，去掉了冗余，提供了一个统一的接口，用来对序列进行功能注释；而且还提供了interproscan 这样的命令行工具，可以方便的对

大规模的蛋白序列进行注释，目前， UniprotKB 和 Gene Ontology 就是使用 interproscan 对蛋白序列进行注释的。

interpro 数据库每两个月更新一次

interpro 的成员数据库包括：

CATH-Gene3D

CDD

MobiDB:

HAMAP:

PANTHER:

PIRSF:

PRINTS:

ProDom:

PROSITE:

SFLD:

SMART:

SUPERFAMILY:

TIGRFAMS:

Pfam

:

interpro 数据库的更多相关文章

  1. interproscan 软件对序列进行GO 注释

    interproscan 软件实际上将对输入的查询序列和interpro 数据库中的序列去比对,将比对上的序列对应的GO信息作为查询序列的GO注释 在interpro 数据库中,每条蛋白质序列有一个唯 ...

  2. JSP应用开发 -------- 电纸书(未完待续)

    http://www.educity.cn/jiaocheng/j9415.html JSP程序员常用的技术   第1章 JSP及其相关技术导航 [本章专家知识导学] JSP是一种编程语言,也是一种动 ...

  3. 生物信息大数据&数据库（NCBI、EBI、UCSC、TCGA）

    想系统的学习生信数据库可以先看一下北大的公开课,有一章专门讲的数据库与软件: -生物信息学:导论与方法 北大\ 生物信息数据库及软件资源 一个优秀的生信开发者能够解决如下问题: 如何鉴定一个重要的且没 ...

  4. nodejs进阶(6)—连接MySQL数据库

    1. 建库连库 连接MySQL数据库需要安装支持 npm install mysql 我们需要提前安装按mysql sever端 建一个数据库mydb1 mysql> CREATE DATABA ...

  5. GreenDao 数据库：使用Raw文件夹下的数据库文件以及数据库升级

    一.使用Raw文件夹下的数据库文件 在使用GreenDao框架时,数据库和数据表都是根据生成的框架代码来自动创建的,从生成的DaoMaster中的OpenHelper类可以看出: public sta ...

  6. ASP.NET MVC with Entity Framework and CSS一书翻译系列文章之第二章：利用模型类创建视图、控制器和数据库

    在这一章中,我们将直接进入项目,并且为产品和分类添加一些基本的模型类.我们将在Entity Framework的代码优先模式下,利用这些模型类创建一个数据库.我们还将学习如何在代码中创建数据库上下文类 ...

  7. Java MyBatis 插入数据库返回主键

    最近在搞一个电商系统中由于业务需求,需要在插入一条产品信息后返回产品Id,刚开始遇到一些坑,这里做下笔记,以防今后忘记. 类似下面这段代码一样获取插入后的主键 User user = new User ...

  8. 在SQL2008查找某数据库中的列是否存在某个值

    在SQL2008查找某数据库中的列是否存在某个值 --SQL2008查找某数据库中的列是否存在某个值 create proc spFind_Column_In_DB ( @type int,--类型: ...

  9. 分享一个SQLSERVER脚本（计算数据库中各个表的数据量和每行记录所占用空间）

    分享一个SQLSERVER脚本(计算数据库中各个表的数据量和每行记录所占用空间) 很多时候我们都需要计算数据库中各个表的数据量和每行记录所占用空间 这里共享一个脚本 CREATE TABLE #tab ...

随机推荐

  1. Asp.Net MVC App_Code无法识别

    Asp.Net MVC需要写公共类的时候 右击添加 App_Code 文件夹,新建类—>右击类—>属性,生成操作 —>选择 —>编译 Asp.Net MVC项目本身是个应用程序 ...

  2. Django admin 常用方法

    1.调整页面头部显示内容和页面标题 #admin.py admin.site.site_header = '广告业务系统' admin.site.site_title = '广告业务系统'

  3. Docker Dockerfile 基本结构详解

    dockerfike快速创建自定义的Docker镜像 一.目录 1.docker典型结构 2.指令介绍 3.创建docker镜像 二.结构 DockerFile分为四部分组成:基础镜像信.维护者信息. ...

  4. tf.square

    tf.square square( x, name=None ) 功能说明: 计算张量对应元素平方 参数列表: 参数名 必选 类型 说明 x 是 张量 是 half, float32, float64 ...

  5. 自定义NSOperation下载图片

    自定义NSOperation的话,只是需要将要下载图片的操作下载它的main方法里面,考虑到,图片下载完毕,需要回传到控制器里,这里可以采用block,也可以采用代理的方式实现,我采用的是代理的方式实 ...

  6. centos 配置subversion svn

    Subversion是一个自由,开源的版本控制系统. 1.安装: yum install subversion 2.配置 mkdir -p /var/svn/svnrepos #新建文件夹 svnad ...

  7. APMServ5.2.6 升级php5.2 到 5.3版本及Memcache升级！

    一.如何选择PHP5.3的VC9版本和VC6版本 VC6是什么?VC6就是legacy Visual Studio 6  compiler,就是使用这个编译器编译的.VC9是什么?VC9就是the V ...

  8. mysql 常用语句记录

    一.表的状态查询   (1)如果发现一个数据异常的大了,需要查看一下其中哪些表变大了,可以使用如下命令 SQL> SHOW TABLE STATUS FROM 数据库名 LIKE 数据表名;   ...

  9. Java并发编程：阻塞队列 <转>

    在前面几篇文章中,我们讨论了同步容器(Hashtable.Vector),也讨论了并发容器(ConcurrentHashMap.CopyOnWriteArrayList),这些工具都为我们编写多线程程 ...

  10. Android——SQLite数据库（二）升级数据库、增、删、改、查、事务

    xml <?xml version="1.0" encoding="utf-8"?> <LinearLayout xmlns:android= ...