15、TSA数据上传(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tsaguide/#SP)
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tsa/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tsaguide ###TSA提交流程
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tbl2asn2/ ###
ftp://ftp.ncbi.nih.gov/toolbox/ncbi_tools/converters/by_program/tbl2asn/ ###tbl2asn工具下载页面,有win,linux版本
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK53709/#gbankquickstart.Submission_using_tbl2asn
https://wenku.baidu.com/view/1fac238f4431b90d6d85c750.html
http://downloads.asperasoft.com/
1、SUBMITTER
提交者的一些信息
2、GENE INFO
1):bioproject PRJNA395283
2):biosample SAMN07374786 SAMN07374806
3):SRA run accession
SRR5877206,SRR5877205,
SRR5877204,SRR5877203
4):assembly metadata
assembly method #组装方法
version or data program was run #版本
description of assembly method #组装方法描述
sequencing technology #测序平台
3、FILE
file type (默认)
TSA submitter guide #进入界面链接
structured comment template #填写组装结构信息并下载 assembly.cmt https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/structcomment/nongenomes/
template.stb #联系人和数据所有者并下载 template.sbt https://www.ncbi.nlm.nih.gov/WebSub/template.cgi
Reference title(文章) :
Publication status:A.Unpublished B.In-press C.Published
4、SEQUENCE
上传*.sqn文件
tbl2asn -t *.sbt -i *.fa -w *.cmt -M t -a s -j "[organism=...][moltype=mRNA][SRA=SRR...,SRR...][tech=TSA]" 具体参数根据实际情况填写,所给文件名一定要与文件夹中文件名字一致,且不能有空格,空格用_代替。

15、TSA数据上传(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tsaguide/#SP)的更多相关文章
- 8、SRR数据下载https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.8.2/
1.prefetch SRRxxxxxx -/ncbi/public/sra 2.fastq-dump --split-files xxxxxxsra 3.SRA.SAM以及Fastq ...
- 12、geo数据上传
1.注册一个NCBI账户 注册geo账户(老用户和新用户): https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/submitter/ 有3个月的时间 GEO DataSets > ...
- 如何优化 FineUI 控件库的性能,减少 80% 的数据上传量!
在开始正文之前,请帮忙为当前排名前 10 唯一的 .Net 开源软件 FineUI 投一票: 投票地址: https://code.csdn.net/2013OSSurvey/gitop/codevo ...
- 个人永久性免费-Excel催化剂功能第20波-Excel与Sqlserver零门槛交互-数据上传篇
Excel作为众多数据存储的交换介质,在不同的系统内的数据很少可以很连贯地进行整合分析,一般的业务系统都会提供导出Excel作为标配功能供用户使用系统内生成的数据. 此时最大的问题是,Excel很维去 ...
- 【AllJoyn专题】基于AllJoyn和Yeelink的传感器数据上传与指令下行的研究
接触高通物联网框架AllJoyn不太久,但确是被深深地吸引了.在我看来,促进我深入学习的原因有三点:一.AllJoyn开源,对开源的软硬件总会有种莫名的喜爱,虽然或许不会都深入下去:二.顺应潮流,物联 ...
- 云中树莓派(2):将传感器数据上传到 AWS IoT 并利用Kibana进行展示
云中树莓派(1):环境准备 云中树莓派(2):将传感器数据上传到AWS IoT 并利用Kibana进行展示 1. 传感器安装及配置 1.1 DHT22 安装 DHT22 是一款温度与湿度传感器,它有3 ...
- Linux本地数据上传到阿里云OSS
这篇文章主要是介绍如何将服务器本地的数据上传到阿里云OSS的指定bucket中,最重要的参考文档是数据迁移单机部署.我第一次上传数据到OSS上时,步骤要比前面的链接中介绍的要麻烦,ossimport工 ...
- java实现access数据上传
一. --springMvc实现上传 https://blog.csdn.net/qian_ch/article/details/69258465 --转换成spring64位上传 https://b ...
- 关于数据上传阿里云MaxCompute调研
1.背景 当前的数据存储基于mysql库表存储形式,目前已经无法满足愈加增大的数据存储需求,新项目基于Maxcompute数据仓库架构,需要将统计日志上传Maxcompute,本文对Maxcomput ...
随机推荐
- 前端绘图方式Canvas和SVG的区别
Canvas和SVG是html5中支持2种可视化技术,都是可以在画布上绘制图形和放入图片.下面来介绍和分析一下他们. 一.Canvas 和 SVG 简介 1.什么是Canvas? Canvas 是H5 ...
- android OTA升级包制作【转】
本文转载自:http://www.thinksaas.cn/topics/0/445/445670.html 0.签名 java -Xmx2048m -jar out/host/linux-x86/f ...
- Linux电源管理(5)_Hibernate和Sleep功能介绍【转】
本文转载自:http://www.wowotech.net/pm_subsystem/std_str_func.html 1. 前言 Hibernate和Sleep两个功能是Linux Generic ...
- <linux是怎么跑的?>傻瓜视角看linux引导启动过程
每天开机关机,除了“等”之外,你得了解你的操作系统开机的时候真正做了什么? 一. 书上都是这么讲的 CPU自身初始化:硬件初始工作,以PC/IP寄存器跳转到BIOS首地址为结束标志. ->加电自 ...
- 彻底搞懂word-break、word-wrap、white-space
原文链接: https://juejin.im/post/5b8905456fb9a01a105966b4 white-space.word-break.word-wrap(overflow-wrap ...
- vue-cli3 set vue.config.js
//config目录下index.js配置文件// see http://vuejs-templates.github.io/webpack for documentation.// path是nod ...
- 2015 ETSI NFV用例指南
译者简介:忍忍鱼,曾经从SDNLAB获取了很多知识,现在努力为SDNLAB贡献自己的力量.爱学习,求进步!SDNLAB,么么哒! ETSI NFV ISG已经确定了9个潜在的NFV用例.本章节简单介绍 ...
- redis实现session共享,哨兵
一.Redis介绍 1.redis是key-value的存储系统,属于非关系型数据库 2.特点:支持数据持久化,可以让数据在内存中保存到磁盘里(memcached:数据存在内存里,如果服务重启,数据会 ...
- CSS cursor 属性--css html 鼠标手型,鼠标形状,鼠标效果,样式
css鼠标手型cursor中hand与pointer Example:CSS鼠标手型效果 <a href="#" style="cursor:hand"& ...
- 第二章 python基础(三)
第十六节 MySQLdb win64位安装python-mysqldb1.2.5 ubuntu下安装MySQLdb sudo apt-get install python-MySQLdb 导入MySQ ...