https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tsa/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tsaguide                                                 ###TSA提交流程

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tbl2asn2/                                                ###

ftp://ftp.ncbi.nih.gov/toolbox/ncbi_tools/converters/by_program/tbl2asn/          ###tbl2asn工具下载页面,有win,linux版本

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK53709/#gbankquickstart.Submission_using_tbl2asn

https://wenku.baidu.com/view/1fac238f4431b90d6d85c750.html

http://downloads.asperasoft.com/

1、SUBMITTER

提交者的一些信息

2、GENE INFO

1):bioproject           PRJNA395283

2):biosample         SAMN07374786   SAMN07374806

3):SRA run accession

SRR5877206,SRR5877205,

SRR5877204,SRR5877203

4):assembly metadata

assembly method                             #组装方法

version or data program was run     #版本

description of assembly method      #组装方法描述

sequencing technology                    #测序平台

3、FILE

file type (默认)

       TSA submitter guide       #进入界面链接

structured comment template           #填写组装结构信息并下载    assembly.cmt           https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/structcomment/nongenomes/

template.stb                                     #联系人和数据所有者并下载   template.sbt            https://www.ncbi.nlm.nih.gov/WebSub/template.cgi

                                Reference title(文章)   :       

Publication status:A.Unpublished   B.In-press   C.Published

4、SEQUENCE

          上传*.sqn文件

          tbl2asn -t *.sbt -i *.fa -w *.cmt -M t -a s -j "[organism=...][moltype=mRNA][SRA=SRR...,SRR...][tech=TSA]"   具体参数根据实际情况填写,所给文件名一定要与文件夹中文件名字一致,且不能有空格,空格用_代替。

           

15、TSA数据上传(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tsaguide/#SP)的更多相关文章

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