15、TSA数据上传(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tsaguide/#SP)
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tsa/
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tsaguide ###TSA提交流程
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tbl2asn2/ ###
ftp://ftp.ncbi.nih.gov/toolbox/ncbi_tools/converters/by_program/tbl2asn/ ###tbl2asn工具下载页面,有win,linux版本
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK53709/#gbankquickstart.Submission_using_tbl2asn
https://wenku.baidu.com/view/1fac238f4431b90d6d85c750.html
http://downloads.asperasoft.com/
1、SUBMITTER
提交者的一些信息
2、GENE INFO
1):bioproject PRJNA395283
2):biosample SAMN07374786 SAMN07374806
3):SRA run accession
SRR5877206,SRR5877205,
SRR5877204,SRR5877203
4):assembly metadata
assembly method #组装方法
version or data program was run #版本
description of assembly method #组装方法描述
sequencing technology #测序平台
3、FILE
file type (默认)
TSA submitter guide #进入界面链接
structured comment template #填写组装结构信息并下载 assembly.cmt https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/structcomment/nongenomes/
template.stb #联系人和数据所有者并下载 template.sbt https://www.ncbi.nlm.nih.gov/WebSub/template.cgi
Reference title(文章) :
Publication status:A.Unpublished B.In-press C.Published
4、SEQUENCE
上传*.sqn文件
tbl2asn -t *.sbt -i *.fa -w *.cmt -M t -a s -j "[organism=...][moltype=mRNA][SRA=SRR...,SRR...][tech=TSA]" 具体参数根据实际情况填写,所给文件名一定要与文件夹中文件名字一致,且不能有空格,空格用_代替。

15、TSA数据上传(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tsaguide/#SP)的更多相关文章
- 8、SRR数据下载https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.8.2/
1.prefetch SRRxxxxxx -/ncbi/public/sra 2.fastq-dump --split-files xxxxxxsra 3.SRA.SAM以及Fastq ...
- 12、geo数据上传
1.注册一个NCBI账户 注册geo账户(老用户和新用户): https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/submitter/ 有3个月的时间 GEO DataSets > ...
- 如何优化 FineUI 控件库的性能,减少 80% 的数据上传量!
在开始正文之前,请帮忙为当前排名前 10 唯一的 .Net 开源软件 FineUI 投一票: 投票地址: https://code.csdn.net/2013OSSurvey/gitop/codevo ...
- 个人永久性免费-Excel催化剂功能第20波-Excel与Sqlserver零门槛交互-数据上传篇
Excel作为众多数据存储的交换介质,在不同的系统内的数据很少可以很连贯地进行整合分析,一般的业务系统都会提供导出Excel作为标配功能供用户使用系统内生成的数据. 此时最大的问题是,Excel很维去 ...
- 【AllJoyn专题】基于AllJoyn和Yeelink的传感器数据上传与指令下行的研究
接触高通物联网框架AllJoyn不太久,但确是被深深地吸引了.在我看来,促进我深入学习的原因有三点:一.AllJoyn开源,对开源的软硬件总会有种莫名的喜爱,虽然或许不会都深入下去:二.顺应潮流,物联 ...
- 云中树莓派(2):将传感器数据上传到 AWS IoT 并利用Kibana进行展示
云中树莓派(1):环境准备 云中树莓派(2):将传感器数据上传到AWS IoT 并利用Kibana进行展示 1. 传感器安装及配置 1.1 DHT22 安装 DHT22 是一款温度与湿度传感器,它有3 ...
- Linux本地数据上传到阿里云OSS
这篇文章主要是介绍如何将服务器本地的数据上传到阿里云OSS的指定bucket中,最重要的参考文档是数据迁移单机部署.我第一次上传数据到OSS上时,步骤要比前面的链接中介绍的要麻烦,ossimport工 ...
- java实现access数据上传
一. --springMvc实现上传 https://blog.csdn.net/qian_ch/article/details/69258465 --转换成spring64位上传 https://b ...
- 关于数据上传阿里云MaxCompute调研
1.背景 当前的数据存储基于mysql库表存储形式,目前已经无法满足愈加增大的数据存储需求,新项目基于Maxcompute数据仓库架构,需要将统计日志上传Maxcompute,本文对Maxcomput ...
随机推荐
- DEV开发之控件XtraTabbedMdiManager
使用的时候要先设置窗体的IsMdiZContainer属性为True然后再窗体上新增XtraTabbedMdiManager控件 设置属性:HeaderLocation为bottomClosePage ...
- Yii2学习笔记---内附GridView配置总结
1./vendor/yiisoft/yii2/web/UrlManager.php 方法createUrl 修改url参数转码2.config/web.php 配置文件Yii::$app(应用主体)的 ...
- 【三】MongoDB文档的CURD操作
一.插入文档 使用insert方法插入文档到一个集合中,如果集合不存在创建集合,有以下几种方法: db.collection.insertOne({}):(v3.2 new) #插入一个文档到集合中 ...
- 第二十一篇 socket
socket通常也称作"套接字",用于描述IP地址和端口,是一个通信链的句柄,应用程序通常通过"套接字"向网络发出请求或者应答网络请求 socket和file的 ...
- neutron qos Quality of Service
Quality of Service advanced service is designed as a service plugin. The service is decoupled from t ...
- JAVA- 切换默认的Java
删除自带的java yum remove java java -version发现还有java,因为电脑上安装了多个版本的java,这时我们可以用 yum groupremove java 通过组的这 ...
- 四 Django框架,models.py模块,数据库操作——创建表、数据类型、索引、admin后台,补充Django目录说明以及全局配置文件配置
Django框架,models.py模块,数据库操作——创建表.数据类型.索引.admin后台,补充Django目录说明以及全局配置文件配置 数据库配置 django默认支持sqlite,mysql, ...
- php mysqli_get_server_version()函数
php mysqli_get_server_version()函数以整数形式返回MySQL服务器版本. 本文章想大家介绍mysqli_get_server_version 函数的基本使用方法和实例,需 ...
- Struts2 - action通配符映射
一个 Web 应用可能有成百上千个 action 声明. 可以利用 struts 提供的通配符映射机制把多个彼此相似的映射关系简化为一个映射关系 通配符映射规则 – 若找到多个匹配, 没有通 ...
- FFMPEG(一) 从V4L2捕获摄像头数据
系列相关博文: FFMPEG(一) 从V4L2捕获摄像头数据 FFMPEG(二) v4l2 数据格式装换 FFMPEG(三) v4l2 数据编码H264 最近在学习FFMPEG,发现网上的很多例子都是 ...