https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tsa/

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tsaguide                                                 ###TSA提交流程

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tbl2asn2/                                                ###

ftp://ftp.ncbi.nih.gov/toolbox/ncbi_tools/converters/by_program/tbl2asn/          ###tbl2asn工具下载页面,有win,linux版本

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK53709/#gbankquickstart.Submission_using_tbl2asn

https://wenku.baidu.com/view/1fac238f4431b90d6d85c750.html

http://downloads.asperasoft.com/

1、SUBMITTER

提交者的一些信息

2、GENE INFO

1):bioproject           PRJNA395283

2):biosample         SAMN07374786   SAMN07374806

3):SRA run accession

SRR5877206,SRR5877205,

SRR5877204,SRR5877203

4):assembly metadata

assembly method                             #组装方法

version or data program was run     #版本

description of assembly method      #组装方法描述

sequencing technology                    #测序平台

3、FILE

file type (默认)

       TSA submitter guide       #进入界面链接

structured comment template           #填写组装结构信息并下载    assembly.cmt           https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/structcomment/nongenomes/

template.stb                                     #联系人和数据所有者并下载   template.sbt            https://www.ncbi.nlm.nih.gov/WebSub/template.cgi

                                Reference title(文章)   :       

Publication status:A.Unpublished   B.In-press   C.Published

4、SEQUENCE

          上传*.sqn文件

          tbl2asn -t *.sbt -i *.fa -w *.cmt -M t -a s -j "[organism=...][moltype=mRNA][SRA=SRR...,SRR...][tech=TSA]"   具体参数根据实际情况填写,所给文件名一定要与文件夹中文件名字一致,且不能有空格,空格用_代替。

           

15、TSA数据上传(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/tsaguide/#SP)的更多相关文章

  1. 8、SRR数据下载https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.8.2/

    1.prefetch SRRxxxxxx         -/ncbi/public/sra 2.fastq-dump --split-files xxxxxxsra 3.SRA.SAM以及Fastq ...

  2. 12、geo数据上传

    1.注册一个NCBI账户 注册geo账户(老用户和新用户): https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/submitter/ 有3个月的时间 GEO DataSets > ...

  3. 如何优化 FineUI 控件库的性能,减少 80% 的数据上传量!

    在开始正文之前,请帮忙为当前排名前 10 唯一的 .Net 开源软件 FineUI 投一票: 投票地址: https://code.csdn.net/2013OSSurvey/gitop/codevo ...

  4. 个人永久性免费-Excel催化剂功能第20波-Excel与Sqlserver零门槛交互-数据上传篇

    Excel作为众多数据存储的交换介质,在不同的系统内的数据很少可以很连贯地进行整合分析,一般的业务系统都会提供导出Excel作为标配功能供用户使用系统内生成的数据. 此时最大的问题是,Excel很维去 ...

  5. 【AllJoyn专题】基于AllJoyn和Yeelink的传感器数据上传与指令下行的研究

    接触高通物联网框架AllJoyn不太久,但确是被深深地吸引了.在我看来,促进我深入学习的原因有三点:一.AllJoyn开源,对开源的软硬件总会有种莫名的喜爱,虽然或许不会都深入下去:二.顺应潮流,物联 ...

  6. 云中树莓派(2):将传感器数据上传到 AWS IoT 并利用Kibana进行展示

    云中树莓派(1):环境准备 云中树莓派(2):将传感器数据上传到AWS IoT 并利用Kibana进行展示 1. 传感器安装及配置 1.1 DHT22 安装 DHT22 是一款温度与湿度传感器,它有3 ...

  7. Linux本地数据上传到阿里云OSS

    这篇文章主要是介绍如何将服务器本地的数据上传到阿里云OSS的指定bucket中,最重要的参考文档是数据迁移单机部署.我第一次上传数据到OSS上时,步骤要比前面的链接中介绍的要麻烦,ossimport工 ...

  8. java实现access数据上传

    一. --springMvc实现上传 https://blog.csdn.net/qian_ch/article/details/69258465 --转换成spring64位上传 https://b ...

  9. 关于数据上传阿里云MaxCompute调研

    1.背景 当前的数据存储基于mysql库表存储形式,目前已经无法满足愈加增大的数据存储需求,新项目基于Maxcompute数据仓库架构,需要将统计日志上传Maxcompute,本文对Maxcomput ...

随机推荐

  1. 用linux搭建ranzhi环境

    一.安装红帽6.5 1.安装时需选择桥接模式: 2.选择自定义,在设置中将镜像文件(ISO)选择进去: 3.安装时选择[桌面]安装(在/etc/inittab文件中,若id=5则为桌面模式,id=3为 ...

  2. 从mysqldump整库备份文件中恢复单表

    最近,系统更新出现了问题,比较紧急,需要对三张表进行回档.由于我们都是采用mysqldump进行每天全备整库,数据量比较大,一个备份文件大概有70G,需要从这个70G文件中恢复三张表,真是蛋疼至极啊, ...

  3. img标签中alt属性与title属性

    alt属性 1.alt属性是考虑到不支持图像显示或者图像显示被关闭的浏览器的用户,以及视觉障碍的用户和使用屏幕阅读器的用户.当图片不显示的时候,图片的替换文字.2.alt属性值得长度必须少于100个英 ...

  4. MAC下ssh免密码登录远程服务器

    生成密钥.在终端下执行命令: ssh-keygen -t rsa 一路回车,各种提示按默认不要改,等待执行完毕.然后执行: ls ~/.ssh #可以看到两个密钥文件:id_rsa(私钥) id_rs ...

  5. 分享知识-快乐自己:Liunx 安装 Zookeeper

    Zookeeper可以安装在windows中也可以安装在linux中! 但是我们的服务器基本都是在linux之上 安装我们的 zookeeper 注册中心! 安装成功之后  修改 nat 模式对应的端 ...

  6. PHP基于单例模式编写PDO类的方法

    一.单例模式简介 简单的说,一个对象(在学习设计模式之前,需要比较了解面向对象思想)只负责一个特定的任务: 二.为什么要使用PHP单例模式? 1.php的应用主要在于数据库应用, 所以一个应用中会存在 ...

  7. string 中的 length函数 和size函数 返回值问题

    string 中的 length函数 和 size函数 的返回值  (  还有 char [ ] 中 测量字符串的  strlen 函数 ) 应该是 unsigned int 类型的 不可以 和 -1 ...

  8. Spring4自动装配(default-autowire) (转)

    原文地址:http://blog.csdn.net/conglinyu/article/details/63684957 Spring 自动装配 通过配置default-autowire 属性,Spr ...

  9. Saiku_学习_03_Saiku+Kylin构建多维分析OLAP平台

    一.技术选型 参见:Saiku+Kylin多维分析平台探索 1.saiku Saiku 作为分析平台,提供可视化的操作,能方便的对数据进行查询.分析,并提供图形化显示 2.kylin Kylin 作为 ...

  10. codeforces 627B B. Factory Repairs(线段树)

    B. Factory Repairs time limit per test 4 seconds memory limit per test 256 megabytes input standard ...